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http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/
SGE作业调度系统的简介
一、常见的几种作业调度系统
Condor是一个资源管理和作业调度系统,是来自Wisconsin-Madison大学的研究项目。充分利用工作站的空闲时间是Condor的最显著特征。Condor管理的机群由网络中的工作站组成,工作站可以自愿加入或退出。Condor监测网络中所有工作站的状态,一旦某台计算机被认为空闲,便把它纳入到资源池中。在资源池中的工作站被用来执行作业。
Sun网格引擎(Sun Grid ,SGE)是一种来自于SUN Microsystem的分布式资源管理和调度系统,它用来在基于UNIX的计算环境中优化软件和硬件资源的使用。SGE能用于查找资源池内的闲置资源并利用这些资源;它同样用于通常的一些事务中,例如管理和调度作业到可用资源中。
负载共享设施(Load Sharing Facility,LSF)是由加拿大平台计算公司研制与开发的,由Toronto大学开发的Utopia系统发展而来。在使用范围上,LSF不仅用于科学计算,也用于企业的事务处理。功能上,除了一般的作业管理特性外,它还在负载平衡、系统容错、检查点操作、进程迁移等方面作了很好的努力,并力图使之实用化。
便携式批处理系统(Portable Batch System,PBS)是一个资源管理和调度系统,它接受批处理作业(具有控制属性的shell脚本),保留和保护作业直到它开始运行。因为一个批处理作业是一个无需用户干预的,在计算机系统后台运行的程序,在批处理作业运行过程中,用户无法实时地得到作业运行结果,所以PBS只能在作业执行后,将作业结果返回给提交者。目前,PBS包含开源免费的OpenPBS、商业付费的PBS Pro、Torque三种分支。
二、SGE 常见指令
- qsub 提交任务
-cwd | #从当前工作路径运行作业 |
-wd working_dir | #定义工作目录 |
-o path | 定义标准输出文件路径、文件名 |
-e path | #定义标准错误输出文件路径、文件名 |
-j y[es]|n[o] | #定义作业的标准错误输出是否写入到输出文件中 |
-now y[es]|n[o] | #立即执行作业 |
-a date_time | #作业开始运行时间 |
-b y[es]|n[o] | #指定运行程序是二进制文件还是脚本文件,默认n |
-m b|e|a|s|n | #定义邮件发送规则。 |
b:作业开始时发送。e:作业结束时发送。a:作业失败时发送 s:作业挂起时发送。n:不发送 | |
-M user[@host] | #定义邮件地址 |
-l resource=value | #表明作业运行所需要的资源。【-l arch=solaris64,h_vmem=750M,permas=1】 |
-N job_name | #重命名作业名 |
-q queue_name | #定义作业运行队列 |
-S shell_path | #指定运行Shell环境 |
-P project_name | #定义项目名称,前提是存在该项目 |
-p priority | #定义优先级,-1023 到 1024 , 默认值0 |
-r y[es]|n[o] | #定义作业失败后是否重新运行 - |
v variable | #定义环境变量 |
-dl date_time | #定义作业到期时间,在作业到期时间之前,作业的优先级会逐步提高,直到管理员指定的最高级别。 |
举个栗子:
qsub –cwd -l h=compute-1-1, h_vmem=5G,p=4 -q all.q work.sh
其中:
-cwd 在当前工作目录;
-l 资源申请/限制,用逗号隔开
-q 申请队列
关于资源限制域,可以通过如下指令查看:qconf -sc
下面列举一些常见的关键字:
#name | shortcut | type | relop | default | urgency | define |
cpu | cpu | DOUBLE | >= | 0 | 0 | cpu nums |
h_vmem | h_vmem | MEMORY | <= | 0 | 0 | The per-job maximum memory limit in bytes. |
hostname | h | HOST | == | NONE | 0 | host name |
mem_free | mf | MEMORY | <= | 1g | 0 | MEM_NEEDED is the amount of memory (in megabytes M, or gigabytes G) that your job will require |
num_proc | p | INT | <= | 1 | 0 | process number |
qname | q | RESTRING | == | NONE | 0 | quene name |
s_data | s_data | MEMORY | <= | 0 | 0 | The per-process maximum memory limit in bytes. |
tmpdir | tmp | RESTRING | == | NONE | 0 | tmp dir |
virtual_free | vf | MEMORY | <= | 1g | 0 | The per-job maximum memory limit, dynamically |
- qstat 查看任务状态
qstat -u username 查看某个用户的任务
qstat -u * 查看所有用户的任务
qstat -j jobID 查看某个任务的详细信息
qstat -f 查看用户自己在每个节点的任务情况
qstat -q all.q -u * 查看某个队列下所有任务
qstat -q all.q@node1 -u * 查看某个队列的某一节点下所有任务
- qdel 删除任务
qdel [ -f ] [ -help ] [-u wc_user_list] [ wc_job_range_list ] [ -t task_id_range ]
qdel job_id 删除job
qdel -u usrname 删除用户的所有任务
- qhold 挂起任务
qhold job_id
qhold -u * 挂起所有用户的任务
- qalter更改任务属性
qalter [ options ] wc_job_range_list [ -- [ command_args ]]
指令和qsub差不多,不多介绍了。