• [R] [Johns Hopkins] R Programming -- week 3


    library(datasets)
    head(airquality)
    #按月分組
    s <- split(airquality, airquality$Month)
    str(s) 
    summary(s)
    lapply(s,function(x) colMeans(x[,c("Ozone","Solar.R","Wind")],na.rm = T))
    sapply(s,function(x) colMeans(x[,c("Ozone","Solar.R","Wind")],na.rm = T))
    
    
    #多函數對照
    x <- rnorm(10)
    f1 <- gl(2,5)
    f2 <- gl(5,2)
    interaction(f1,f2)
    str(split(x,list(f1,f2))) #list會自動帶入interaction()
    str(split(x,list(f1,f2), drop = T)) #捨去空level
    
    #Debug
    message: 可能
    warning: 意料(期望)之外的事情,提醒
    error: 大問題,會stop
    condition: 所有都是condition,可設計觸發
    
    invisible() 會返回但不會顯示
    
     
    
    printmessage <- function(x) {
    if(x>0)
    print("positive")
    else
    print("negative")
    }
    x<-log(-1) #NaN warning
    printmessage2(x) #Error
    
     
    
    printmessage2 <- function(x) {
    if(is.na(x))
    print("missing")
    else if(x>0)
    print("positive")
    else
    print("negative")
    }
    x<-log(-1) #NaN warning
    printmessage2(x) #warning NaN => Na
    
    #錯誤處理的思維
    input甚麼,如何Call function
    所期待的是甚麼,Output? message? other result?
    所獲得的是甚麼
    差異是甚麼
    是否可再現錯誤
    
    #Debugging Tool
    1.traceback : 幾個function被呼叫,在哪裡出錯 (只能給出上一次的資料)
    2.debug : 函數一開始就暫停,再一行行,搭配browser
    3.browser : 函數中的停止點
    4.trace : 將debuggingcode插入特別位置
    5.recover : 報錯的訊息
    
    mean(xxx)
    #Error
    traceback()
    #1:mean(xxx)
    
    lm(y-x)
    #Error
    traceback()
    4: stats::model.frame(formula = y - x, drop.unused.levels = TRUE)
    3: eval(mf, parent.frame())
    2: eval(mf, parent.frame())
    1: lm(y - x)
    
    debug(lm) #對於lm進入debug模式
    lm(y-x) #開始針對lm(y-x)進行debug
    #Browse[2]> #一步步檢查
    debug: ret.x <- x
    #Browse[2]> 
    debug: ret.y <- y
    #Browse[2]> 
    debug: cl <- match.call()
    .
    .
    #Browse[2]> 
    Error in stats::model.frame(formula = y - x, drop.unused.levels = TRUE) : 
    object 'y' not found
    
    
    可藉由options(error = recover)將recover函數作為錯誤處理器 (此處為globel層級的設定)
    tracback中的步驟列表功能,即為recover中的功能,不過recover可以選擇步驟查看其environment
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