• 机器学习之支持向量机(四):支持向量机的Python语言实现


    注:关于支持向量机系列文章是借鉴大神的神作,加以自己的理解写成的;若对原作者有损请告知,我会及时处理。转载请标明来源。

    序:

    我在支持向量机系列中主要讲支持向量机的公式推导,第一部分讲到推出拉格朗日对偶函数的对偶因子α;第二部分是SMO算法对于对偶因子的求解;第三部分是核函数的原理与应用,讲核函数的推理及常用的核函数有哪些;第四部分是支持向量机的应用,按照机器学习实战的代码详细解读。

    机器学习之支持向量机(一):支持向量机的公式推导

    机器学习之支持向量机(二):SMO算法

    机器学习之支持向量机(三):核函数和KKT条件的理解

    机器学习之支持向量机(四):支持向量机的Python语言实现

    1 数据样本集的介绍

    这篇文章是根据《机器学习实战》一书的实例进行代码的详细解读,我在查找这方面的资料没有人对支持向量机算法 python 实现的详细说明,我就把我在看代码时的思路和代码详细注解。如果存在不足,欢迎给我留言相互探讨。好了,废话不多说,正文开始。。。

    首先我们使用的数据是二维的坐标点,还有对应的类标号(1 或 -1)。数据集以 “testSet.txt” 命名,如下代码段中:

      1 3.542485    1.977398    -1
      2 3.018896    2.556416    -1
      3 7.551510    -1.580030    1
      4 2.114999    -0.004466    -1
      5 8.127113    1.274372    1
      6 7.108772    -0.986906    1
      7 8.610639    2.046708    1
      8 2.326297    0.265213    -1
      9 3.634009    1.730537    -1
     10 0.341367    -0.894998    -1
     11 3.125951    0.293251    -1
     12 2.123252    -0.783563    -1
     13 0.887835    -2.797792    -1
     14 7.139979    -2.329896    1
     15 1.696414    -1.212496    -1
     16 8.117032    0.623493    1
     17 8.497162    -0.266649    1
     18 4.658191    3.507396    -1
     19 8.197181    1.545132    1
     20 1.208047    0.213100    -1
     21 1.928486    -0.321870    -1
     22 2.175808    -0.014527    -1
     23 7.886608    0.461755    1
     24 3.223038    -0.552392    -1
     25 3.628502    2.190585    -1
     26 7.407860    -0.121961    1
     27 7.286357    0.251077    1
     28 2.301095    -0.533988    -1
     29 -0.232542    -0.547690    -1
     30 3.457096    -0.082216    -1
     31 3.023938    -0.057392    -1
     32 8.015003    0.885325    1
     33 8.991748    0.923154    1
     34 7.916831    -1.781735    1
     35 7.616862    -0.217958    1
     36 2.450939    0.744967    -1
     37 7.270337    -2.507834    1
     38 1.749721    -0.961902    -1
     39 1.803111    -0.176349    -1
     40 8.804461    3.044301    1
     41 1.231257    -0.568573    -1
     42 2.074915    1.410550    -1
     43 -0.743036    -1.736103    -1
     44 3.536555    3.964960    -1
     45 8.410143    0.025606    1
     46 7.382988    -0.478764    1
     47 6.960661    -0.245353    1
     48 8.234460    0.701868    1
     49 8.168618    -0.903835    1
     50 1.534187    -0.622492    -1
     51 9.229518    2.066088    1
     52 7.886242    0.191813    1
     53 2.893743    -1.643468    -1
     54 1.870457    -1.040420    -1
     55 5.286862    -2.358286    1
     56 6.080573    0.418886    1
     57 2.544314    1.714165    -1
     58 6.016004    -3.753712    1
     59 0.926310    -0.564359    -1
     60 0.870296    -0.109952    -1
     61 2.369345    1.375695    -1
     62 1.363782    -0.254082    -1
     63 7.279460    -0.189572    1
     64 1.896005    0.515080    -1
     65 8.102154    -0.603875    1
     66 2.529893    0.662657    -1
     67 1.963874    -0.365233    -1
     68 8.132048    0.785914    1
     69 8.245938    0.372366    1
     70 6.543888    0.433164    1
     71 -0.236713    -5.766721    -1
     72 8.112593    0.295839    1
     73 9.803425    1.495167    1
     74 1.497407    -0.552916    -1
     75 1.336267    -1.632889    -1
     76 9.205805    -0.586480    1
     77 1.966279    -1.840439    -1
     78 8.398012    1.584918    1
     79 7.239953    -1.764292    1
     80 7.556201    0.241185    1
     81 9.015509    0.345019    1
     82 8.266085    -0.230977    1
     83 8.545620    2.788799    1
     84 9.295969    1.346332    1
     85 2.404234    0.570278    -1
     86 2.037772    0.021919    -1
     87 1.727631    -0.453143    -1
     88 1.979395    -0.050773    -1
     89 8.092288    -1.372433    1
     90 1.667645    0.239204    -1
     91 9.854303    1.365116    1
     92 7.921057    -1.327587    1
     93 8.500757    1.492372    1
     94 1.339746    -0.291183    -1
     95 3.107511    0.758367    -1
     96 2.609525    0.902979    -1
     97 3.263585    1.367898    -1
     98 2.912122    -0.202359    -1
     99 1.731786    0.589096    -1
    100 2.387003    1.573131    -1
    数据集

    然后,数据集中对象在下图显示,我们的工作就是找到最佳的超平面(这里是直线)。

    2 Python 代码的实现

    2.1 准备数据和分析数据

    既然我们有了数据,那么就要把数据转换成可以被程序调用和处理的形式。写一个加载数据的函数,把文本中的数据转化成列表类型。代码如下:

     1 # 将文本中的样本数据添加到列表中
     2 def loadDataSet(fileName):
     3     dataMat = []
     4     labelMat = []
     5     fr = open(fileName)
     6     for line in fr.readlines() : # 对文本按行遍历
     7         lineArr = line.strip().split('	')
     8         dataMat .append([float(lineArr [0]), float(lineArr[1])])   # 每行前两个是属性数据,最后一个是类标号
     9         labelMat .append(float(lineArr[2]))
    10     return dataMat , labelMat

    由于在实现支持向量机的过程中要多次调用样本数据、类标号、对偶因子、对象经过核函数映射之后的值和其他数据,因此利用创造一个类,初始化这些数据利于保存和调用。代码如下:

     1 class optStruct:
     2     def __init__(self,dataMatIn, classLabels, C, toler, kTup):
     3         self.X = dataMatIn # 样本数据
     4         self.labelMat = classLabels # 样本的类标号
     5         self.C = C # 对偶因子的上界值
     6         self.tol = toler
     7         self.m = shape(dataMatIn)[0] # 样本的行数,即样本对象的个数
     8         self.alphas = mat(zeros((self.m, 1))) # 对偶因子
     9         self.b = 0 # 分割函数的截距
    10         self.eCache = mat(zeros((self.m, 2))) # 差值矩阵 m * 2,第一列是对象的标志位 1 表示存在不为零的差值 0 表示差值为零,第二列是实际的差值 E
    11         self.K = mat(zeros((self.m, self.m))) # 对象经过核函数映射之后的值
    12         for i in range(self.m): # 遍历全部样本集
    13             self.K[:,i] = kernelTrans(self.X, self.X[i,:], kTup ) # 调用径向基核函数

    2.2 对偶因子的求解函数

    我们通过支持向量机(二):SMO算法,可知对偶因子是我们求得超平面的关键,只有解得对偶因子才能得到超平面的法向量和截距。代码如下:

     1 # 遍历所有能优化的 alpha
     2 def smoP(dataMatIn, classLabels, C, toler, maxIter, kTup=('lin', 0)):
     3     oS = optStruct(mat(dataMatIn), mat(classLabels).transpose(), C, toler, kTup) # 创建一个类对象 oS ,类对象 oS 存放所有数据
     4     iter = 0 # 迭代次数的初始化
     5     entireSet = True # 违反 KKT 条件的标志符
     6     alphaPairsChanged = 0 # 迭代中优化的次数
     7 
     8     # 从选择第一个 alpha 开始,优化所有alpha
     9     while(iter < maxIter) and ((alphaPairsChanged > 0) or (entireSet )): # 优化的终止条件:在规定迭代次数下,是否遍历了整个样本或 alpha 是否优化
    10         alphaPairsChanged  = 0
    11         if entireSet: #
    12             for i in range(oS.m): # 遍历所有对象
    13                 alphaPairsChanged += innerL(i ,oS) # 调用优化函数(不一定优化)
    14             print "fullSet , iter: %d i %d, pairs changed %d" % (iter, i , alphaPairsChanged )
    15             iter += 1 # 迭代次数加 1
    16         else:
    17             nonBoundIs = nonzero((oS.alphas .A > 0) * (oS.alphas.A < C))[0]
    18             for i in nonBoundIs : # 遍历所有非边界样本集
    19                 alphaPairsChanged += innerL(i, oS) # 调用优化函数(不一定优化)
    20                 print "non-bound, iter: %d i :%d, pairs changed %d" % (iter, i, alphaPairsChanged )
    21             iter += 1 # 迭代次数加 1
    22         if entireSet : # 没有违反KKT 条件的alpha ,终止迭代
    23             entireSet = False
    24         elif (alphaPairsChanged == 0): # 存在违反 KKT 的alpha
    25             entireSet = True
    26         print "iteration number: %d" % iter
    27     return oS.b, oS.alphas # 返回截距值和 alphas

    上述代码中,第 13 行调用了 innerL() 函数,它是对对偶因子向量的单个元素求解。代码如下:

     1 # 优化选取两个 alpha ,并计算截距 b
     2 def innerL(i, oS):
     3     Ei = calcEk(oS, i) # 计算 对象 i 的差值
     4     # 第一个 alpha 符合选择条件进入优化
     5     if ((oS.labelMat [i]*Ei <- oS.tol) and (oS.alphas[i] < oS.C)) or ((oS.labelMat [i]*Ei > oS.tol) and (oS.alphas[i] > 0)):
     6         j,Ej =selectJ(i, oS, Ei) # 选择第二个 alpha
     7         alphaIold = oS.alphas[i].copy() # 浅拷贝
     8         alphaJold = oS.alphas[j].copy() # 浅拷贝
     9 
    10         # 根据对象 i 、j 的类标号(相等或不等)确定KKT条件的上界和下界
    11         if (oS.labelMat[i] != oS.labelMat[j]):
    12             L = max(0, oS.alphas [j] - oS.alphas[i])
    13             H = min(oS.C, oS.C + oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
    14         else :
    15             L = max(0, oS.alphas[j] + oS.alphas [i] - oS.C)
    16             H = min(oS.C, oS.alphas [j] + oS.alphas [i])
    17 
    18         if L==H:print "L==H";return 0 # 不符合优化条件(第二个 alpha)
    19         eta = 2.0 * oS.K[i,j] - oS.K[i,i] - oS.K[j,j]  # 计算公式的eta ,是公式的相反数
    20         if eta >= 0:print "eta>=0";return 0 # 不考虑eta 大于等于 0 的情况(这种情况对 alpha 的解是另外一种方式,即临界情况的求解)
    21         # 优化之后的第二个 alpha 值
    22         oS.alphas[j] -= oS.labelMat[j]*(Ei - Ej)/eta
    23         oS.alphas[j] = clipAlpha(oS.alphas[j], H, L)
    24         updateEk(oS, j) # 更新差值矩阵
    25         if (abs(oS.alphas[j] - alphaJold) < 0.00001): # 优化之后的 alpha 值与之前的值改变量太小,步长不足
    26             print "j not moving enough"
    27             return 0
    28         oS.alphas[i] += oS.labelMat[j]*oS.labelMat[i]*(alphaJold - oS.alphas[j]) # 优化第二个 alpha
    29         updateEk(oS, i) # 更新差值矩阵
    30         # 计算截距 b
    31         b1 = oS.b - Ei - oS.labelMat[i] * (oS.alphas[i] - alphaIold) * oS.K[i, i] - oS.labelMat[j] * (oS.alphas[j] - alphaJold) * oS.K[i, j]
    32         b2 = oS.b - Ej - oS.labelMat[i] * (oS.alphas[i] - alphaIold) * oS.K[i, j] - oS.labelMat[j] * (oS.alphas[j] - alphaJold) * oS.K[j, j]
    33         if (0 < oS.alphas [i]) and (oS.C > oS.alphas[i]):
    34             oS.b = b1
    35         elif (0 < oS.alphas [j]) and (oS.C > oS.alphas [j]):
    36             oS.b = b2
    37         else :
    38             oS.b = (b1 + b2)/2.0
    39         return 1 # 进行一次优化
    40     else :
    41         return 0

    这里第 3 行代码调用了calcEk() 函数,它是计算预测值与真实值的差值。代码如下:

    1 # 预测的类标号值与真实值的差值,参数 oS 是类对象,k 是样本的对象的标号
    2 def calcEk(oS, k):
    3     fXk = float(multiply(oS.alphas, oS.labelMat).T * oS.K[:, k] + oS.b)  # 公式(1)
    4     Ek = fXk - float(oS.labelMat[k]) # 差值
    5     return Ek

    其中,第 3 行中指到的公式(1)是超平面方程。

    在 innerL()函数中的第 6 行,调用了 selectJ ()函数,此函数是用来选择优化的第二个对偶因子元素。代码如下:

     1 # 由启发式选取第二个 alpha,以最大步长为标准
     2 def selectJ(i, oS, Ei): # 函数的参数是选取的第一个 alpha 的对象号、类对象和对象差值
     3     maxK = -1; maxDeltaE = 0; Ej = 0 # 第二个 alpha 的初始化
     4     oS.eCache[i] = [1,Ei] # 更新差值矩阵的第 i 行
     5     validEcacheList = nonzero(oS.eCache[:,0].A)[0] # 取差值矩阵中第一列不为 0 的所有行数(标志位为 1 ),以元组类型返回
     6     if (len(validEcacheList)) > 1 : #
     7         for k in validEcacheList : # 遍历所有标志位为 1 的对象的差值
     8             if k == i: continue
     9             Ek = calcEk(oS, k) # 计算对象 k 的差值
    10             deltaE = abs(Ei - Ek) # 取两个差值之差的绝对值
    11             if (deltaE > maxDeltaE): # 选取最大的绝对值deltaE
    12                 maxK = k; maxDeltaE = deltaE; Ej = Ek
    13         return maxK, Ej # 返回选取的第二个 alpha
    14     else: # 随机选取第二个 alpha
    15         j = selectJrand(i, oS.m)
    16         Ej = calcEk(oS,j)
    17     return j, Ej # 返回选取的第二个 alpha

    这个函数的第 15 行调用了 selectJrand() 函数,是为了没有合适的第二个元素,就用随机的方式选择。代码如下:

    1 # 随机选取对偶因子alpha ,参数i 是alpha 的下标,m 是alpha 的总数
    2 def selectJrand(i,m):
    3     j = i
    4     while (j==i):
    5         j = int(random.uniform(0,m))
    6     return j

    在innerL()函数中的第 23 行调用 clipAlpha() 函数,是根据KKT 条件对对偶因子的修剪。代码如下:

    1 # 对所求的对偶因子按约束条件的修剪
    2 def clipAlpha(aj, H, L): # H 为上界,L为下界
    3     if aj > H:
    4         aj = H
    5     if L > aj:
    6         aj = L
    7     return aj

     innerL() 函数的第 29 行调用了 updateEk() 函数,更新差值矩阵的数据。代码如下:

    1 # 更新差值矩阵的数据
    2 def updateEk(oS, k):
    3     Ek = calcEk(oS, k) # 调用计算差值的函数
    4     oS.eCache [k] = [1,Ek]

    2.3 核函数

     这里我们使用的径向基核函数,把数据从低维映射到高维,把不可分数据变成可分。当然,我们给出的数据集是线性可分,现在给出另外数据集,分为训练集“testSetRBF.txt”和测试集"testSetRBF2.txt"。

    径向基核函数公式如下:

    数据集

      1 -0.214824    0.662756    -1.000000
      2 -0.061569    -0.091875    1.000000
      3 0.406933    0.648055    -1.000000
      4 0.223650    0.130142    1.000000
      5 0.231317    0.766906    -1.000000
      6 -0.748800    -0.531637    -1.000000
      7 -0.557789    0.375797    -1.000000
      8 0.207123    -0.019463    1.000000
      9 0.286462    0.719470    -1.000000
     10 0.195300    -0.179039    1.000000
     11 -0.152696    -0.153030    1.000000
     12 0.384471    0.653336    -1.000000
     13 -0.117280    -0.153217    1.000000
     14 -0.238076    0.000583    1.000000
     15 -0.413576    0.145681    1.000000
     16 0.490767    -0.680029    -1.000000
     17 0.199894    -0.199381    1.000000
     18 -0.356048    0.537960    -1.000000
     19 -0.392868    -0.125261    1.000000
     20 0.353588    -0.070617    1.000000
     21 0.020984    0.925720    -1.000000
     22 -0.475167    -0.346247    -1.000000
     23 0.074952    0.042783    1.000000
     24 0.394164    -0.058217    1.000000
     25 0.663418    0.436525    -1.000000
     26 0.402158    0.577744    -1.000000
     27 -0.449349    -0.038074    1.000000
     28 0.619080    -0.088188    -1.000000
     29 0.268066    -0.071621    1.000000
     30 -0.015165    0.359326    1.000000
     31 0.539368    -0.374972    -1.000000
     32 -0.319153    0.629673    -1.000000
     33 0.694424    0.641180    -1.000000
     34 0.079522    0.193198    1.000000
     35 0.253289    -0.285861    1.000000
     36 -0.035558    -0.010086    1.000000
     37 -0.403483    0.474466    -1.000000
     38 -0.034312    0.995685    -1.000000
     39 -0.590657    0.438051    -1.000000
     40 -0.098871    -0.023953    1.000000
     41 -0.250001    0.141621    1.000000
     42 -0.012998    0.525985    -1.000000
     43 0.153738    0.491531    -1.000000
     44 0.388215    -0.656567    -1.000000
     45 0.049008    0.013499    1.000000
     46 0.068286    0.392741    1.000000
     47 0.747800    -0.066630    -1.000000
     48 0.004621    -0.042932    1.000000
     49 -0.701600    0.190983    -1.000000
     50 0.055413    -0.024380    1.000000
     51 0.035398    -0.333682    1.000000
     52 0.211795    0.024689    1.000000
     53 -0.045677    0.172907    1.000000
     54 0.595222    0.209570    -1.000000
     55 0.229465    0.250409    1.000000
     56 -0.089293    0.068198    1.000000
     57 0.384300    -0.176570    1.000000
     58 0.834912    -0.110321    -1.000000
     59 -0.307768    0.503038    -1.000000
     60 -0.777063    -0.348066    -1.000000
     61 0.017390    0.152441    1.000000
     62 -0.293382    -0.139778    1.000000
     63 -0.203272    0.286855    1.000000
     64 0.957812    -0.152444    -1.000000
     65 0.004609    -0.070617    1.000000
     66 -0.755431    0.096711    -1.000000
     67 -0.526487    0.547282    -1.000000
     68 -0.246873    0.833713    -1.000000
     69 0.185639    -0.066162    1.000000
     70 0.851934    0.456603    -1.000000
     71 -0.827912    0.117122    -1.000000
     72 0.233512    -0.106274    1.000000
     73 0.583671    -0.709033    -1.000000
     74 -0.487023    0.625140    -1.000000
     75 -0.448939    0.176725    1.000000
     76 0.155907    -0.166371    1.000000
     77 0.334204    0.381237    -1.000000
     78 0.081536    -0.106212    1.000000
     79 0.227222    0.527437    -1.000000
     80 0.759290    0.330720    -1.000000
     81 0.204177    -0.023516    1.000000
     82 0.577939    0.403784    -1.000000
     83 -0.568534    0.442948    -1.000000
     84 -0.011520    0.021165    1.000000
     85 0.875720    0.422476    -1.000000
     86 0.297885    -0.632874    -1.000000
     87 -0.015821    0.031226    1.000000
     88 0.541359    -0.205969    -1.000000
     89 -0.689946    -0.508674    -1.000000
     90 -0.343049    0.841653    -1.000000
     91 0.523902    -0.436156    -1.000000
     92 0.249281    -0.711840    -1.000000
     93 0.193449    0.574598    -1.000000
     94 -0.257542    -0.753885    -1.000000
     95 -0.021605    0.158080    1.000000
     96 0.601559    -0.727041    -1.000000
     97 -0.791603    0.095651    -1.000000
     98 -0.908298    -0.053376    -1.000000
     99 0.122020    0.850966    -1.000000
    100 -0.725568    -0.292022    -1.000000
    训练集
      1 0.676771    -0.486687    -1.000000
      2 0.008473    0.186070    1.000000
      3 -0.727789    0.594062    -1.000000
      4 0.112367    0.287852    1.000000
      5 0.383633    -0.038068    1.000000
      6 -0.927138    -0.032633    -1.000000
      7 -0.842803    -0.423115    -1.000000
      8 -0.003677    -0.367338    1.000000
      9 0.443211    -0.698469    -1.000000
     10 -0.473835    0.005233    1.000000
     11 0.616741    0.590841    -1.000000
     12 0.557463    -0.373461    -1.000000
     13 -0.498535    -0.223231    -1.000000
     14 -0.246744    0.276413    1.000000
     15 -0.761980    -0.244188    -1.000000
     16 0.641594    -0.479861    -1.000000
     17 -0.659140    0.529830    -1.000000
     18 -0.054873    -0.238900    1.000000
     19 -0.089644    -0.244683    1.000000
     20 -0.431576    -0.481538    -1.000000
     21 -0.099535    0.728679    -1.000000
     22 -0.188428    0.156443    1.000000
     23 0.267051    0.318101    1.000000
     24 0.222114    -0.528887    -1.000000
     25 0.030369    0.113317    1.000000
     26 0.392321    0.026089    1.000000
     27 0.298871    -0.915427    -1.000000
     28 -0.034581    -0.133887    1.000000
     29 0.405956    0.206980    1.000000
     30 0.144902    -0.605762    -1.000000
     31 0.274362    -0.401338    1.000000
     32 0.397998    -0.780144    -1.000000
     33 0.037863    0.155137    1.000000
     34 -0.010363    -0.004170    1.000000
     35 0.506519    0.486619    -1.000000
     36 0.000082    -0.020625    1.000000
     37 0.057761    -0.155140    1.000000
     38 0.027748    -0.553763    -1.000000
     39 -0.413363    -0.746830    -1.000000
     40 0.081500    -0.014264    1.000000
     41 0.047137    -0.491271    1.000000
     42 -0.267459    0.024770    1.000000
     43 -0.148288    -0.532471    -1.000000
     44 -0.225559    -0.201622    1.000000
     45 0.772360    -0.518986    -1.000000
     46 -0.440670    0.688739    -1.000000
     47 0.329064    -0.095349    1.000000
     48 0.970170    -0.010671    -1.000000
     49 -0.689447    -0.318722    -1.000000
     50 -0.465493    -0.227468    -1.000000
     51 -0.049370    0.405711    1.000000
     52 -0.166117    0.274807    1.000000
     53 0.054483    0.012643    1.000000
     54 0.021389    0.076125    1.000000
     55 -0.104404    -0.914042    -1.000000
     56 0.294487    0.440886    -1.000000
     57 0.107915    -0.493703    -1.000000
     58 0.076311    0.438860    1.000000
     59 0.370593    -0.728737    -1.000000
     60 0.409890    0.306851    -1.000000
     61 0.285445    0.474399    -1.000000
     62 -0.870134    -0.161685    -1.000000
     63 -0.654144    -0.675129    -1.000000
     64 0.285278    -0.767310    -1.000000
     65 0.049548    -0.000907    1.000000
     66 0.030014    -0.093265    1.000000
     67 -0.128859    0.278865    1.000000
     68 0.307463    0.085667    1.000000
     69 0.023440    0.298638    1.000000
     70 0.053920    0.235344    1.000000
     71 0.059675    0.533339    -1.000000
     72 0.817125    0.016536    -1.000000
     73 -0.108771    0.477254    1.000000
     74 -0.118106    0.017284    1.000000
     75 0.288339    0.195457    1.000000
     76 0.567309    -0.200203    -1.000000
     77 -0.202446    0.409387    1.000000
     78 -0.330769    -0.240797    1.000000
     79 -0.422377    0.480683    -1.000000
     80 -0.295269    0.326017    1.000000
     81 0.261132    0.046478    1.000000
     82 -0.492244    -0.319998    -1.000000
     83 -0.384419    0.099170    1.000000
     84 0.101882    -0.781145    -1.000000
     85 0.234592    -0.383446    1.000000
     86 -0.020478    -0.901833    -1.000000
     87 0.328449    0.186633    1.000000
     88 -0.150059    -0.409158    1.000000
     89 -0.155876    -0.843413    -1.000000
     90 -0.098134    -0.136786    1.000000
     91 0.110575    -0.197205    1.000000
     92 0.219021    0.054347    1.000000
     93 0.030152    0.251682    1.000000
     94 0.033447    -0.122824    1.000000
     95 -0.686225    -0.020779    -1.000000
     96 -0.911211    -0.262011    -1.000000
     97 0.572557    0.377526    -1.000000
     98 -0.073647    -0.519163    -1.000000
     99 -0.281830    -0.797236    -1.000000
    100 -0.555263    0.126232    -1.000000
    测试集

    核函数代码如下:

     1 # 径向基核函数(高斯函数)
     2 def kernelTrans(X, A, kTup): # X 是样本集矩阵,A 是样本对象(矩阵的行向量) , kTup 元组
     3     m,n = shape(X)
     4     K = mat(zeros((m,1)))
     5     # 数据不用核函数计算
     6     if kTup [0] == 'lin': K = X * A.T
     7 
     8     # 用径向基核函数计算
     9     elif kTup[0] == 'rbf':
    10         for j in range(m):
    11             deltaRow = X[j,:] - A
    12             K[j] = deltaRow * deltaRow.T
    13         K = exp(K/(-1*kTup[1]**2))
    14     # kTup 元组值异常,抛出异常信息
    15     else:raise NameError('Houston We Have a Problem --That Kernel is not recognized')
    16     return K

    3 支持向量机预测分类测试结果

    测试函数代码如下:

     1 # 训练样本集的错误率和测试样本集的错误率
     2 def testRbf(k1=1.3):
     3     dataArr,labelArr = loadDataSet('testSetRBF.txt') # 训练样本的提取
     4     b,alphas = smoP(dataArr, labelArr, 200, 0.0001, 10000, ('rbf', k1)) # 计算得到截距和对偶因子
     5     datMat=mat(dataArr); labelMat = mat(labelArr).transpose()
     6     svInd=nonzero(alphas.A>0)[0] # 对偶因子大于零的值,支持向量的点对应对偶因子
     7     sVs=datMat[svInd]
     8     labelSV = labelMat[svInd]
     9     print "there are %d Support Vectors" % shape(sVs)[0]
    10     m,n = shape(datMat)
    11     errorCount = 0
    12     # 对训练样本集的测试
    13     for i in range(m):
    14         kernelEval = kernelTrans(sVs,datMat[i,:],('rbf', k1)) # 对象 i 的映射值
    15         predict=kernelEval.T * multiply(labelSV,alphas[svInd]) + b # 预测值
    16         if sign(predict)!=sign(labelArr[i]): errorCount += 1
    17     print "the training error rate is: %f" % (float(errorCount)/m)
    18     dataArr,labelArr = loadDataSet('testSetRBF2.txt') # 测试样本集的提取
    19     errorCount = 0
    20     datMat=mat(dataArr); labelMat = mat(labelArr).transpose()
    21     m,n = shape(datMat)
    22     # 对测试样本集的测试
    23     for i in range(m):
    24         kernelEval = kernelTrans(sVs,datMat[i,:],('rbf', k1)) # 测试样本对象 i 的映射值
    25         predict=kernelEval.T * multiply(labelSV,alphas[svInd]) + b # 预测值
    26         if sign(predict)!=sign(labelArr[i]): errorCount += 1
    27     print "the test error rate is: %f" % (float(errorCount)/m)

    运行结果:

    从结果可知,训练集的错误率在3%,测试集的错误率在4%,说明支持向量机的分类效果很好。当然在每次运行的结果与图中的结果不一定相同,因为代码段中存在随机选择对偶因子的情况,这是无法避免的,但结果的错误率是基本相同的。

    到这里支持向量机算法是讲完了,期间花费了我大量时间学习支持向量机的原理和代码的实现。虽然这部分内容存在一定的难度,但认真地去看每步的由来还是能够理解的。像我这么不怎么聪明的人都能对它说出 1,2,3,4 来,相信你也可以。我总是这么认为,你看懂支持向量机是一回事,能够说出向量机是一回事,把向量机讲出来又是另外一回事。我现在对支持向量机还有很多半只不懂的地方,希望以后对它有了新的理解再来修改支持向量机系列的文章。

    机器学习之支持向量机(一):支持向量机的公式推导

    机器学习之支持向量机(二):SMO算法

    机器学习之支持向量机(三):核函数和KKT条件的理解

    机器学习之支持向量机(四):支持向量机的Python语言实现

    附:完整代码

      1 #-*- coding=utf-8 -*-
      2 import random
      3 
      4 from numpy import *
      5 
      6 # 将文本中的样本数据添加到列表中
      7 def loadDataSet(fileName):
      8     dataMat = []
      9     labelMat = []
     10     fr = open(fileName)
     11     for line in fr.readlines() : # 对文本按行遍历
     12         lineArr = line.strip().split('	')
     13         dataMat .append([float(lineArr [0]), float(lineArr[1])])   # 每行前两个是属性数据,最后一个是类标号
     14         labelMat .append(float(lineArr[2]))
     15     return dataMat , labelMat
     16 
     17 # 随机选取对偶因子alpha ,参数i 是alpha 的下标,m 是alpha 的总数
     18 def selectJrand(i,m):
     19     j = i
     20     while (j==i):
     21         j = int(random.uniform(0,m))
     22     return j
     23 
     24 # 对所求的对偶因子按约束条件的修剪
     25 def clipAlpha(aj, H, L): # H 为上界,L为下界
     26     if aj > H:
     27         aj = H
     28     if L > aj:
     29         aj = L
     30     return aj
     31 
     32 
     33 class optStruct:
     34     def __init__(self,dataMatIn, classLabels, C, toler, kTup):
     35         self.X = dataMatIn # 样本数据
     36         self.labelMat = classLabels # 样本的类标号
     37         self.C = C # 对偶因子的上界值
     38         self.tol = toler
     39         self.m = shape(dataMatIn)[0] # 样本的行数,即样本对象的个数
     40         self.alphas = mat(zeros((self.m, 1))) # 对偶因子
     41         self.b = 0 # 分割函数的截距
     42         self.eCache = mat(zeros((self.m, 2))) # 差值矩阵 m * 2,第一列是对象的标志位 1 表示存在不为零的差值 0 表示差值为零,第二列是实际的差值 E
     43         self.K = mat(zeros((self.m, self.m))) # 对象经过核函数映射之后的值
     44         for i in range(self.m): # 遍历全部样本集
     45             self.K[:,i] = kernelTrans(self.X, self.X[i,:], kTup ) # 调用径向基核函数
     46 
     47 
     48 
     49 # 预测的类标号值与真实值的差值,参数 oS 是类对象,k 是样本的对象的标号
     50 def calcEk(oS, k):
     51     fXk = float(multiply(oS.alphas, oS.labelMat).T * oS.K[:, k] + oS.b)  # 公式(1)
     52     Ek = fXk - float(oS.labelMat[k]) # 差值
     53     return Ek
     54 
     55 
     56 # 由启发式选取第二个 alpha,以最大步长为标准
     57 def selectJ(i, oS, Ei): # 函数的参数是选取的第一个 alpha 的对象号、类对象和对象差值
     58     maxK = -1; maxDeltaE = 0; Ej = 0 # 第二个 alpha 的初始化
     59     oS.eCache[i] = [1,Ei] # 更新差值矩阵的第 i 行
     60     validEcacheList = nonzero(oS.eCache[:,0].A)[0] # 取差值矩阵中第一列不为 0 的所有行数(标志位为 1 ),以元组类型返回
     61     if (len(validEcacheList)) > 1 : #
     62         for k in validEcacheList : # 遍历所有标志位为 1 的对象的差值
     63             if k == i: continue
     64             Ek = calcEk(oS, k) # 计算对象 k 的差值
     65             deltaE = abs(Ei - Ek) # 取两个差值之差的绝对值
     66             if (deltaE > maxDeltaE): # 选取最大的绝对值deltaE
     67                 maxK = k; maxDeltaE = deltaE; Ej = Ek
     68         return maxK, Ej # 返回选取的第二个 alpha
     69     else: # 随机选取第二个 alpha
     70         j = selectJrand(i, oS.m)
     71         Ej = calcEk(oS,j)
     72     return j, Ej # 返回选取的第二个 alpha
     73 
     74 # 更新差值矩阵的数据
     75 def updateEk(oS, k):
     76     Ek = calcEk(oS, k) # 调用计算差值的函数
     77     oS.eCache [k] = [1,Ek]
     78 
     79 
     80 # 优化选取两个 alpha ,并计算截距 b
     81 def innerL(i, oS):
     82     Ei = calcEk(oS, i) # 计算 对象 i 的差值
     83     # 第一个 alpha 符合选择条件进入优化
     84     if ((oS.labelMat [i]*Ei <- oS.tol) and (oS.alphas[i] < oS.C)) or ((oS.labelMat [i]*Ei > oS.tol) and (oS.alphas[i] > 0)):
     85         j,Ej =selectJ(i, oS, Ei) # 选择第二个 alpha
     86         alphaIold = oS.alphas[i].copy() # 浅拷贝
     87         alphaJold = oS.alphas[j].copy() # 浅拷贝
     88 
     89         # 根据对象 i 、j 的类标号(相等或不等)确定KKT条件的上界和下界
     90         if (oS.labelMat[i] != oS.labelMat[j]):
     91             L = max(0, oS.alphas [j] - oS.alphas[i])
     92             H = min(oS.C, oS.C + oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
     93         else :
     94             L = max(0, oS.alphas[j] + oS.alphas [i] - oS.C)
     95             H = min(oS.C, oS.alphas [j] + oS.alphas [i])
     96 
     97         if L==H:print "L==H";return 0 # 不符合优化条件(第二个 alpha)
     98         eta = 2.0 * oS.K[i,j] - oS.K[i,i] - oS.K[j,j]  # 计算公式的eta ,是公式的相反数
     99         if eta >= 0:print "eta>=0";return 0 # 不考虑eta 大于等于 0 的情况(这种情况对 alpha 的解是另外一种方式,即临界情况的求解)
    100         # 优化之后的第二个 alpha 值
    101         oS.alphas[j] -= oS.labelMat[j]*(Ei - Ej)/eta
    102         oS.alphas[j] = clipAlpha(oS.alphas[j], H, L)
    103         updateEk(oS, j) # 更新差值矩阵
    104         if (abs(oS.alphas[j] - alphaJold) < 0.00001): # 优化之后的 alpha 值与之前的值改变量太小,步长不足
    105             print "j not moving enough"
    106             return 0
    107         oS.alphas[i] += oS.labelMat[j]*oS.labelMat[i]*(alphaJold - oS.alphas[j]) # 优化第二个 alpha
    108         updateEk(oS, i) # 更新差值矩阵
    109         # 计算截距 b
    110         b1 = oS.b - Ei - oS.labelMat[i] * (oS.alphas[i] - alphaIold) * oS.K[i, i] - oS.labelMat[j] * (oS.alphas[j] - alphaJold) * oS.K[i, j]
    111         b2 = oS.b - Ej - oS.labelMat[i] * (oS.alphas[i] - alphaIold) * oS.K[i, j] - oS.labelMat[j] * (oS.alphas[j] - alphaJold) * oS.K[j, j]
    112         if (0 < oS.alphas [i]) and (oS.C > oS.alphas[i]):
    113             oS.b = b1
    114         elif (0 < oS.alphas [j]) and (oS.C > oS.alphas [j]):
    115             oS.b = b2
    116         else :
    117             oS.b = (b1 + b2)/2.0
    118         return 1 # 进行一次优化
    119     else :
    120         return 0
    121 
    122 
    123 # 遍历所有能优化的 alpha
    124 def smoP(dataMatIn, classLabels, C, toler, maxIter, kTup=('lin', 0)):
    125     oS = optStruct(mat(dataMatIn), mat(classLabels).transpose(), C, toler, kTup) # 创建一个类对象 oS ,类对象 oS 存放所有数据
    126     iter = 0 # 迭代次数的初始化
    127     entireSet = True # 违反 KKT 条件的标志符
    128     alphaPairsChanged = 0 # 迭代中优化的次数
    129 
    130     # 从选择第一个 alpha 开始,优化所有alpha
    131     while(iter < maxIter) and ((alphaPairsChanged > 0) or (entireSet )): # 优化的终止条件:在规定迭代次数下,是否遍历了整个样本或 alpha 是否优化
    132         alphaPairsChanged  = 0
    133         if entireSet: #
    134             for i in range(oS.m): # 遍历所有对象
    135                 alphaPairsChanged += innerL(i ,oS) # 调用优化函数(不一定优化)
    136             print "fullSet , iter: %d i %d, pairs changed %d" % (iter, i , alphaPairsChanged )
    137             iter += 1 # 迭代次数加 1
    138         else:
    139             nonBoundIs = nonzero((oS.alphas .A > 0) * (oS.alphas.A < C))[0]
    140             for i in nonBoundIs : # 遍历所有非边界样本集
    141                 alphaPairsChanged += innerL(i, oS) # 调用优化函数(不一定优化)
    142                 print "non-bound, iter: %d i :%d, pairs changed %d" % (iter, i, alphaPairsChanged )
    143             iter += 1 # 迭代次数加 1
    144         if entireSet : # 没有违反KKT 条件的alpha ,终止迭代
    145             entireSet = False
    146         elif (alphaPairsChanged == 0): # 存在违反 KKT 的alpha
    147             entireSet = True
    148         print "iteration number: %d" % iter
    149     return oS.b, oS.alphas # 返回截距值和 alphas
    150 
    151 # 径向基核函数(高斯函数)
    152 def kernelTrans(X, A, kTup): # X 是样本集矩阵,A 是样本对象(矩阵的行向量) , kTup 元组
    153     m,n = shape(X)
    154     K = mat(zeros((m,1)))
    155     # 数据不用核函数计算
    156     if kTup [0] == 'lin': K = X * A.T
    157 
    158     # 用径向基核函数计算
    159     elif kTup[0] == 'rbf':
    160         for j in range(m):
    161             deltaRow = X[j,:] - A
    162             K[j] = deltaRow * deltaRow.T
    163         K = exp(K/(-1*kTup[1]**2))
    164     # kTup 元组值异常,抛出异常信息
    165     else:raise NameError('Houston We Have a Problem --That Kernel is not recognized')
    166     return K
    167 
    168 # 训练样本集的错误率和测试样本集的错误率
    169 def testRbf(k1=1.3):
    170     dataArr,labelArr = loadDataSet('testSetRBF.txt') # 训练样本的提取
    171     b,alphas = smoP(dataArr, labelArr, 200, 0.0001, 10000, ('rbf', k1)) # 计算得到截距和对偶因子
    172     datMat=mat(dataArr); labelMat = mat(labelArr).transpose()
    173     svInd=nonzero(alphas.A>0)[0] # 对偶因子大于零的值,支持向量的点对应对偶因子
    174     sVs=datMat[svInd]
    175     labelSV = labelMat[svInd]
    176     print "there are %d Support Vectors" % shape(sVs)[0]
    177     m,n = shape(datMat)
    178     errorCount = 0
    179     # 对训练样本集的测试
    180     for i in range(m):
    181         kernelEval = kernelTrans(sVs,datMat[i,:],('rbf', k1)) # 对象 i 的映射值
    182         predict=kernelEval.T * multiply(labelSV,alphas[svInd]) + b # 预测值
    183         if sign(predict)!=sign(labelArr[i]): errorCount += 1
    184     print "the training error rate is: %f" % (float(errorCount)/m)
    185     dataArr,labelArr = loadDataSet('testSetRBF2.txt') # 测试样本集的提取
    186     errorCount = 0
    187     datMat=mat(dataArr); labelMat = mat(labelArr).transpose()
    188     m,n = shape(datMat)
    189     # 对测试样本集的测试
    190     for i in range(m):
    191         kernelEval = kernelTrans(sVs,datMat[i,:],('rbf', k1)) # 测试样本对象 i 的映射值
    192         predict=kernelEval.T * multiply(labelSV,alphas[svInd]) + b # 预测值
    193         if sign(predict)!=sign(labelArr[i]): errorCount += 1
    194     print "the test error rate is: %f" % (float(errorCount)/m)
    195 if __name__ == '__main__':
    196 
    197     '''
    198     # 显示计算的截距值b 和对偶因子 alphas
    199     dataMat ,labelMat = loadDataSet('testSet.txt')
    200     b, alphas = smoP(dataMat, labelMat , 0.6, 0.11, 40,('rbf',2))
    201     print '------'
    202     print b, '----',alphas
    203     '''
    204 
    205     # 支持向量机的测试
    206     testRbf()
    完整代码
  • 相关阅读:
    Web Site Administration Tool 文章收集
    Sql中补零方法及其它
    PowerDesigner 教程
    什么是Zend
    什么是CMS系统?
    谈谈今天遇到的编译工具查错的问题
    Lec4快速排序
    堆排序 zz
    强大的Python
    Lec6待学习的堆排序
  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/pursued-deer/p/7892342.html
Copyright © 2020-2023  润新知