MySQL的慢查询，全名是慢查询日志，是MySQL提供的一种日志记录，用来记录在MySQL中响应时间超过阀值的语句。具体环境中，运行时间超过long_query_time值的SQL语句，则会被记录到慢查询日志中。long_query_time的默认值为10，意思是记录运行10秒以上的语句。默认情况下，MySQL数据库并不启动慢查询日志，需要手动来设置这个参数。
当然，如果不是调优需要的话，一般不建议启动该参数，因为开启慢查询日志会或多或少带来一定的性能影响。
此外，慢查询日志支持将日志记录写入文件和数据库表。
3. MySQL 慢查询的相关参数解释：
l slow_query_log：是否开启慢查询日志，1表示开启，0表示关闭。
l log-slow-queries ：旧版（5.6以下版本）MySQL数据库慢查询日志存储路径。可以不设置该参数，系统则会默认给一个缺省的文件host_name-slow.log
l slow-query-log-file：新版（5.6及以上版本）MySQL数据库慢查询日志存储路径。可以不设置该参数，系统则会默认给一个缺省的文件host_name-slow.log
l long_query_time：慢查询阈值，当查询时间多于设定的阈值时，记录日志。
l log_queries_not_using_indexes：未使用索引的查询也被记录到慢查询日志中（可选项）。
l log_output：日志存储方式。log_output='FILE'表示将日志存入文件，默认值是'FILE'。log_output='TABLE'表示将日志存入数据库。
那么如何进行慢查询日志的配置呢？默认情况下slow_query_log的值为OFF，表示慢查询日志是禁用的，可以通过设置slow_query_log的值来开启，如下所示：
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show variables like '%slow_query_log%'; |
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+----------------------+-----------------------------------------------+ 2 rows in set (0.00 sec) |
使用set global slow_query_log=1开启了慢查询日志只对当前数据库生效，MySQL重启后则会失效。如果要永久生效，就必须修改配置文件my.cnf（其它系统变量也是如此）
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set global slow_query_log=1; |
my.cnf要增加或修改参数slow_query_log 和slow_query_log_file，如下所示：
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slow_query_log = 1 slow_query_log_file = /tmp/mysql_slow.log |
slow_query_log_file这个参数用于指定慢查询日志的存放路径，缺省情况是host_name-slow.log文件。
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show variables like 'slow_query_log_file'; |
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+---------------------+-----------------------------------------------+ | Variable_name | Value | +---------------------+-----------------------------------------------+ | slow_query_log_file | /home/WDPM/MysqlData/mysql/DB-Server-slow.log | +---------------------+-----------------------------------------------+ 1 row in set (0.00 sec) |
开启了慢查询日志后，什么样的SQL才会记录到慢查询日志里面呢？这个是由参数long_query_time控制，默认情况下long_query_time的值为10秒，可以使用命令修改，也可以在my.cnf参数里面修改。
关于运行时间正好等于long_query_time的情况，并不会被记录下来；也就是说，在mysql源码里是判断大于long_query_time，而非大于等于。
从MySQL 5.1开始，long_query_time开始以微秒记录SQL语句运行时间，之前仅用秒为单位记录。如果记录到表里面，只会记录整数部分，不会记录微秒部分
注意，某些情况下当你使用局部设置的方式时可能会出现如下情况，来看下面：
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show variables
like 'long_query_time%'; |
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+-----------------+-----------+ | Variable_name | Value | +-----------------+-----------+ | long_query_time | 10.000000 | +-----------------+-----------+ |
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set global
long_query_time=4; |
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show variables
like 'long_query_time'; |
如上所示，修改了变量long_query_time，但是查询变量long_query_time的值还是10，难道没有修改到呢？注意：使用命令 set global long_query_time=4修改后，需要重新连接或新开一个会话才能看到修改值。用show variables like 'long_query_time'查看只是当前会话的变量值。也可以不用重新连接会话，而是用show global variables like 'long_query_time';。
log_output参数指定慢查询日志的存储方式：
l log_output='FILE'表示将日志存入文件，默认值也是'FILE'。
l log_output='TABLE'表示将日志存入数据库，这样日志信息就会被写入到mysql.slow_log表中。同时也支持两种日志存储方式，配置的时候以逗号隔开即可，如：log_output='FILE,TABLE'。
日志记录到系统的专用日志表中，要比记录到文件耗费更多的系统资源。因此对于需要启用慢查询日志，又需要能够获得更高的系统性能，那么建议优先记录到文件。
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show variables like '%log_output%'; |
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+---------------+-------+ | Variable_name | Value | +---------------+-------+ | log_output | FILE | +---------------+-------+ |
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set global log_output='TABLE'; |
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show variables like '%log_output%'; |
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+---------------+-------+ | Variable_name | Value | +---------------+-------+ | log_output | TABLE | +---------------+-------+ |
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select sleep(5) ; |
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+----------+ | sleep(5) | +----------+ | 0 | +----------+ |
当我们在上面执行了一次sleep5之后，这条操作将会被记录在慢查询日志中，我们来看看：
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mysql> select * from mysql.slow_log; +---------------------+---------------------------+------------+-----------+-----------+---------------+----+----------------+-----------+-----------+-----------------+-----------+ | start_time | user_host | query_time | lock_time | rows_sent | rows_examined | db | last_insert_id | insert_id | server_id | sql_text | thread_id | +---------------------+---------------------------+------------+-----------+-----------+---------------+----+----------------+-----------+-----------+-----------------+-----------+ | 2016-06-16 17:37:53 | root[root] @ localhost [] | 00:00:03 | 00:00:00 | 1 | 0 | | 0 | 0 | 1 | select sleep(3) | 5 | | 2016-06-16 21:45:23 | root[root] @ localhost [] | 00:00:05 | 00:00:00 | 1 | 0 | | 0 | 0 | 1 | select sleep(5) | 2 | +---------------------+---------------------------+------------+-----------+-----------+---------------+----+----------------+-----------+-----------+-----------------+-----------+ |