.net是一种建立在虚拟机上执行的语言，它直接生成 MSIL 的中间语言，再由.net编译器 JIT 解释映象为本机代码并交付CPU执行。中间语言很容易被反编译，所以研究下如何有效的保护dll文件。
我大致的方法为 ：强签名+混淆+加密。
强签名
强命名程序集，可以确保你的程序集唯一，而不被篡改、冒用等；即使相同名字的程序集如果签名也会不同。
强签名很简单，本站另一文章已经详细进行了讲解，请参考：http://www.cn-web.com/shtml/article/net/fxsj/2009/06/16/913.shtml
注：未签名的主程序可以引用已签名或未签名的程序集；而已签名的主程序不能引用未签名的程序集。（上述文章有相应解决办法）
混淆
混淆就是对编译生成的MSIL中间代码进行模糊处理，最简单的混淆是名称混淆，即将 命名空间名、类名、方法名、字段名等统统换成特殊符号或其它符号，目的就是让人看到晕为止，但是并不改变程序执行逻辑。
我这里使用的Dotfuscator进行混淆。
Dotfuscator混淆方法：
1.创建新工程;
2.选择要混淆的dll、exe文件;
3.在属性里选择Library属性（很重要，因为我这里要混淆的是dll文件，如果不选中，混淆后将不能被正确调用！），如下图所示：
4.选择bulid标签，点击bulid按钮进行混淆。
我们也可以选择其它标签进行加密字符串、增加水印等操作，我这里加密工作用另外的方法，所以没有选择操作。
OK，混淆完成后，我们可以用Reflector.exe来反编译下混淆后的dll文件，可以对比源码看下效果。
加密
接下来我们继续对混淆过的dll文件进行加密处理，进一步保护dll文件。我使用的加密工具是MaxtoCode。打开软件后，切换到中文，可以看到非常简单，添加上dll文件后，直接点击执行加密就可以。其他选项比如：加密字符串、强名称等都很简单，大家一试就知道，而且MaxtoCode的帮助做的非常友好，一看就会使用。
加密后的dll文件比先前大了一倍，用Reflector.exe反编译后，发现dll文件加密的更彻底，因为主体函数内容都隐藏了。通过以上三步，使您的dll文件可免于一般人的破解，当然，不可能绝对防止被破解。