参数文件
当 MySQL 实例启动时，数据库会先读一个配置参数文件，用来寻找数据库的各种文件所在位置以及指定某些初始化参数，这些参数通常定义了某种内存结构有多大等。在默认情况下，MySQL 实例会按照一定的顺序在指定的文职进行读取，用户只需要通过命令 mysql --help | grep my.cnf 来寻找即可。
MySQL 启动的时候如果没有参数文件，则所有的参数值取决于编译 MySQL 时指定的默认值和源代码中指定参数的默认值。但是，如果 MySQL 实例在默认的数据库目录下找不到 mysql 架构，则启动同样会失败。
MySQL 数据库的参数文件是以文本方式进行存储的。
MySQL 数据库中的参数可以分为两类：
动态参数：运行中可以更改。
静态参数：整个实例生命周期内都不得进行更改，是只读的。
日志文件
错误日志
错误日志文件对于 MySQL 的启动、运行、关闭过程进行了记录。
用户可以通过 show variables like 'log_error'; 来定位该文件。
默认情况下，错误文件的文件名为服务器的 hostname.err。
二进制日志
二进制日志记录了对 MySQL 数据库执行更改的所有操作，但是不包括 SELECT 和 SHOW 这类操作，因为这类操作对数据本身并没有修改。
若操作本身没有导致数据库发生变化，那么该操作可能也会写入二进制文件。
作用：
恢复：某些数据的恢复需要二进制日志。
复制：其原理与恢复相似，通过复制和执行二进制日志使一台远程的 MySQL 数据库与一台 MySQL 数据库进行实时同步。
审计：用户可以通过二进制日志的信息来进行审计，判断是否有对数据库进行注入的攻击。
log-bin ：配置该参数可以启动二进制日志。如果不指定 name，则默认二进制日志文件名为主机名，后缀名为二进制日志的序列号，所在路径为数据库所在目录。
二进制日志文件在默认情况下并没有启动，需要手动指定参数来启动。
启动二进制日志对数据库大约有 1% 的性能影响。
max_binlog_size ：指定了单个二进制文件的最大值，如果超过该值，则产生新的二进制文件，后缀名 +1，并记录到 .index 文件。
binlog_cache_size ：当使用事务的表存储引擎时，所有未提交的二进制日志会被记录到一个缓存中去，等该事务提交时直接将缓冲中的二进制文件写入二进制文件，而该缓冲的大小有该参数进行控制，默认大小为 32K。该参数是基于会话的，所以该值设置不能过大，当一个事务的记录大于设定的值时，MySQL 会把缓冲中的日志写入一个临时文件中，因此该值又不能设的太小。通过 show gloabl status 命令查看binlog_cache_use、binlog_cache_disk_use 的状态，可以判断当前 binlog_cache_size 的设置是否合适。
sync_binlog ：默认情况下，二进制日志并不是在每次写的时候同步到磁盘。因此，当数据库所在操作系统发生宕机时，可能会有最后一部分数据没有写入二进制的文件中，这会给恢复和复制带来问题。该参数表示每次写缓冲多少次就同步到磁盘。为 1 时表示采用同步写磁盘的方式来写二进制日志。默认值为 0，如果使用 InnoDB 存储引擎进行复制，并且向的到最大的高可用性，建议将该值设为 ON。该值为 ON 时，会对数据库的 IO 系统带来和一定的影响。但是，即使将该值设为 1，还是会有一种情况导致问题的发生。当使用 InnoDB 存储引擎时，在一个事务发出 COMMIT 动作之前，由于该值为 1，因此会将二进制日志立即写入磁盘。如果这时已经写入了二进制日志，但是提交还没有发生，并且此时发生了宕机，那么在 MySQL 数据库下次启动时，由于 COMMIT 操作并没有发生，这个事务会被回滚掉。但是二进制日志已经记录了该事务信息，不能被回滚。这个问题可以通过将参数 innodb_support_xa 设为 1 来解决。
binlog-do-db ：需要写入哪些库的日志。
binlog-ignore-db ：需要忽略哪些库的日志。
log-slave-updates ：如果当前数据库时复制中的 slave 角色，则它不会将从 master 取得并执行的二进制日志写入自己的二进制日志文件中去。如果需要写入，要设置该参数。如果需要搭建 master => slave => slave 架构的复制，则必须设置该参数。
binlog_format ：影响了记录二进制日志的格式。该参数可设的值有：
STATEMENT：记录的是日志的逻辑 SQL 语句。
ROW：记录的是表的行更改情况。如果设置为 ROW，可以将 InnoDB 的事务隔离级别为 READ COMMITTED，以获得更好的并发性。
MIXED：默认采用 STATEMENT 格式进行二进制文件的记录，但是在一些情况下会使用 ROW 格式记录。
二进制日志文件的查看通过工具 mysqlbinlog 。
慢查询日志
默认情况下，MySQL 数据库并不启动慢查询的日志，用需要手工将参数 slow_query_log 设为 ON。
long_query_time ：设置这个阈值后，MySQL 数据库会记录运行时间超过该值的所有 SQL 语句。（管理语句和未使用索引的不记录）
log_queries_not_using_indexes ：如果运行的 SQL 语句没有使用索引，MySQL 数据库同样会将这条 SQL 语句记录到慢查询日志文件。
log_throttle_queries_not_using_indexes ：每分钟允许记录到 slow log 的且未使用索引的 SQL 语句次数。默认为 0，表示没有限制。
mysqldumpslow ：分析慢查询日志。
MySQL 5.1 开始可以将慢查询的日志记录放入一张表中。慢查询表在 mysql 架构下，名为 slow_log。
log_output ：指定了慢查询输出的格式，默认为 FILE。可以将它设为 TABLE，这样慢查询日志将记录到 slow_log 表中。该参数是动态的，且是全局的。
slow_log 表用的是 CSV 引擎，对大数据量下的查询效率可能不高，用户可以将它转换到 MyISAM，并在 start_time 列上添加索引以进一步提高查询效率。不能忽视的是，这会对数据库造成额外的开销。
InnoSQL 版本加强了对于 SQL 语句的捕获方式，在原版 MySQL 的基础上在 slow_log 中增加了对于逻辑读取和物理读取的统计。这里的物理读取是指从磁盘进行 IO 读取的次数，逻辑读取包含所有的读取，不管是磁盘还是缓冲池。
long_query_io ：将超过指定逻辑 IO 次数的 SQL 语句记录到 slow log 中。默认 100。
slow_query_type ：启用 slow log 的方式。
0：不将 SQL 语句记录到 slow log
1：根据运行时间将 SQL 语句记录到 slow log
2：根据逻辑 IO 次数将 SQL 语句记录到 slow log
3：根据运行时间及逻辑 IO 次数将 SQL 语句记录到 slow log
查询日志
查询日志记录了所有对 MySQL 数据库请求的信息，无论这些请求是否得到了正确的执行。
默认的文件名为 hostname.log。
socket 文件
在 UNIX 系统下本地连接 MySQL 可以采用 UNIX 域套接字方式，这种方式需要一个套接字文件。套接字文件可有参数 socket 控制。一般在 /tmp 目录下，名为 mysql.sock。
show variables like 'socket';
pid 文件
当 MySQL 实例启动时，会将自己的进程 ID 写入一个文件中，该文件即为 PID 文件，改文件可由参数 pid_file 控制，默认位于数据库目录下，文件名为 hostname.pid。
MySQL 表结构文件
因为 MySQL 插件式存储引擎的体系结构的关系，MySQL 数据存储的是根据表进行的，每个表都会有与之对应的文件。但不论表采用何种存储引擎，MySQL 都有一个以 frm 为后缀名的文件，这个文件记录了该表的表结构定义。
frm 还用来存放视图的定义，这种文件时文本文件，可以直接查看。
存储引擎文件
MySQL 每个表存储引擎有其自己独有的文件。
表空间文件
InnoDB 采用将存储的数据按表空间进行存放的设计。在默认的配置下会有一个初始大小为 10MB，名为 ibata1 的文件。该文件就是默认的表空间文件，用户可以通过参数 innodb_data_file_path 对其进行设置。用户可以通过多个文件组成一个表空间，同时指定文件的属性。
设置 innodb_data_file_path 参数后，所有基于 InnoDB 存储引擎的表的数据都会记录到该共享表空间中。
若设置 innodb_file_per_table 参数，则用户可以将每个基于 InnoDB 存储引擎的表产生一个独立表空间。独立表空间的命名规则为：tablename.ibd。通过这样的方式，用户不用将所有的数据都存放于默认的表空间中。
需要注意的是，这些单独的表空间文件仅存储该表的数据、索引和插入缓冲 BITMAP 等信息，其余的信息还是存放在默认的表空间中。
重做日志文件
在默认情况下，在 InnoDB 存储引擎的数据目录下会有两个名为 ib_logfile0 和 ib_logfile1 的文件。在 MySQL 官方手册中将其称为 InnoDB 存储引擎的日志文件，不过准确的定义应该是重做日志文件。他们记录了对于 InnoDB 存储引擎的事务日志。
当实例或者介质失败时，重做日志文件就能派上用场。
每个 InnoDB 存储引擎至少有一个重做日志文件组，每个文件组下至少有 2 个重做日志文件，如上面默认的两个文件。为了得到更高的可靠性，用户可以设置多个的镜像日志组，将不同的文件组放在不同的磁盘上，以此提高重做日志的高可用性。在日志组中每个重做日志文件的大小一致，并以此循环写入的方式运行。
innodb_log_file_size ：指定每个重做日志文件的大小。1.2.x版本将该限制扩大为 512GB。
innodb_log_files_in_group ：指定了日志文件组中重做日志文件的数量，默认为 2.
innodb_mirrored_log_groups ：指定了日志镜像文件组的数量，默认为 1，表示只有一个日志文件组，没有镜像。如果磁盘本身已经做了高可用的方案，如磁盘阵列，那么可以不开启重做日志镜像的功能。
innodb_log_group_home_dir ：指定了日志文件组所在的路径，默认为 ./，表示在 MySQL 数据库的数据目录下。