目录树的主要部分有root（/）、/USR、/var、/home等等。下面是一个典型的linux目录结构如下：
/ 根目录
/bin 存放必要的命令
/boot 存放内核以及启动所需的文件等
/dev 存放设备文件
/etc 存放系统的配置文件
/home 用户文件的主目录，用户数据存放在其主目录中
/lib 存放必要的运行库
/mnt 存放临时的映射文件系统，我们常把软驱和光驱挂装在这里的floppy和cdrom子目录下。
/proc 存放存储进程和系统信息
/root 超级用户的主目录
/sbin 存放系统管理程序
/tmp 存放临时文件的目录
/usr 包含了一般不需要修改的应用程序，命令程序文件、程序库、手册和其它文档。
/var 包含系统产生的经常变化的文件，例如打印机、邮件、新闻等假脱机目录、日志文件、格式化后的手册页以及一些应用程序的数据文件等等。建议单独的放在一个分区。[separator]
典型的/usr目录如下：
/X11R6 存放X Window系统
/bin 存放增加的用户程序
/dict 存放字典
/doc 存放追加的文档
/etc 存放设置文件
/games 存放游戏和教学文件
/include 存放C开发工具的头文件
/info 存放GNU信息文件
/lib 存放库文件
/local 存放本地产生的增加的应用程序
/man 存放在线帮助文件
/sbin 存放增加的管理程序
/share 存放结构独立的数据
/src 存放程序的源代码
由于/usr中的文件不和特定的计算机相关，也不会在通常使用中修改，因此可以通过网络共享这个目录（文件系统），这样，当管理员安装了新的软件之后，所有共享这一文件系统的计算机均可以使用新的软件。
Linux继承了unix操作系统结构清晰的特点。在linux下的文件结构非常有条理。但是，上述的优点只有在对linux相当熟悉时，才能体会到。现在，虫虫就把linux下的目录结构简单介绍一下。
/vmlinuz
我们已经知道，每一个linux都有一个内核（vmlinuz），我们在这个内核上添加上可以完成各种特定功能的模块，每个模块就体现在 linux中各种不同的目录上。当然，各种不同的发行套件，其目录有细小的差别，但主要结构都是一样的。我们还要将linux的功能模块和各种应用程序结合起来，这样，才能使你的 linux系统为你服务。在/vmlinuz目录下存放的就是系统的内核。还记得我们在配置Lilo时，提到过这个内核吗？
/bin
显而易见，bin 就是二进制（binary）英文缩写。在一般的系统当中，你都可以在这个目录下找到linux常用的命令。在有的版本中你还会找到一些和根目录下相同的目录。
/boot
在这个目录下存放的都是系统启动时要用到的程序。我们在使用lilo引导linux的时候，会用到这里的一些信息。
/dev
dev 是设备(device)的英文缩写。这个目录对所有的用户都十分重要。因为在这个目录中包含了所有linux系统中使用的外部设备。但是这里并不是放的外部设备的驱动程序。这一点和我们常用的windows, dos操作系统不一样。它实际上是一个访问这些外部设备的端口。我们可以非常方便地去访问这些外部设备，和访问一个文件，一个目录没有任何区别。例如：我们在系统中键入：cd /dev/cdrom 我们就可以看到光驱中的文件了。同样道理，我们键入：cd /dev/mouse 就可以看看鼠标的相关文件。在这个目录下，有一个null设备，这个东西本身没有任何意义。如果你向这个目录写入文件或内容，他们统统有去无回。
/cdrom
这个目录在你刚刚安装系统的时候是空的。你可以将光驱文件系统挂在这个目录下。例如：mount /dev/cdrom /cdrom
/etc
etc这个目录是linux系统中最重要的目录之一。在这个目录下存放了系统管理时要用到的各种配置文件和子目录。我们要用到的网络配置文件，文件系统，x系统配置文件，设备配置信息，设置用户信息等都在这个目录下。以后，虫虫还会详细讲解这个目录下的内容。
/sbin
这个目录是用来存放系统管理员的系统管理程序。
/home
如果我们建立一个用户，用户名是"xx",那么在/home目录下就有一个对应的/home/xx路径，用来存放用户的主目录。
/lib
lib是库（library）英文缩写。这个目录是用来存放系统动态连接共享库的。几乎所有的应用程序都会用到这个目录下的共享库。因此，千万不要轻易对这个目录进行什么操作，一旦发生问题，你的系统就不能工作了，到时候你别说虫虫没有提醒你呀。
/lost+found
这个目录在大多数情况下都是空的。但是如果你正在工作突然停电，或是没有用正常方式关机，在你重新启动机器的时候，有些文件就会找不到应该存放的地方，对于这些文件，系统将他们放在这个目录下，就象为无家可归的人提供一个临时住所。
/mnt
这个目录在一般情况下也是空的。你可以临时将别的文件系统挂在这个目录下。
/proc
可以在这个目录下获取系统信息。这些信息是在内存中，由系统自己产生的。
/root
如果你是以超级用户的身份登录的，这个就是超级用户的主目录。
/tmp
用来存放不同程序执行时产生的临时文件。
/usr
这是linux系统中占用硬盘空间最大的目录。用户的很多应用程序和文件都存放在这个目录下。