• pymysql 读取大数据内存卡死的解决方案


    背景:目前表中只有5G(后期持续增长),但是其中一个字段(以下称为detail字段)存了2M(不一定2M,部分为0,平均下来就是2M),字段中存的是一个数组,数组中存N个json数据。这个字段如下:

    [{"A": "A", "B": "B", "C": "C", "D": "D"}...]
    

    要是拆表的话,可能要拆好多个,要是存多行根据阿里巴巴《Java 开发手册》提出单表行数超过 500 万行,也不是很建议。希望有大佬能指教一下。
    回到正题,一开始是分两个表存储,一个表存基本信息(A表),一个表(B表)存关联字段,及detail字段。貌似没有啥用,按需求现要将两张表合在一起供BI去处理。直接复制了那张基础字段的A表,通过遍历B表根据关联字段进行更新。但是在select的时候内存读入的数据太大直接卡死(狗头)。于是在网上查找如何通过pymysql处理大数据的问题。解决方案如下:

    1.通过limit分批次读取数据进行操作:

    import pymysql
    
    up_db = pymysql.connections.Connection(host=MYSQL_HOST,
                                   port=MYSQL_PORT,
                                   user=MYSQL_USER,
                                   password=MYSQL_PASSWORD,
                                   db=MYSQL_DB,
                                   charset='utf8mb4',)
                                   
    
    count = 0
    while True:
        # if count == 2:
        #     break
    
        select_sql = "select sec_report_id,detail from sec_report_original_data_detail limit %s,2"%(count)
        up_cursor = up_db.cursor()
        up_cursor.execute(select_sql)
        result = up_cursor.fetchall()
        for data in result:
            sec_report_id = data[0]
            detail = data[1]
            update_sql = "update `sec_report_original_data_intact` set detail = '%s' where `sec_report_id` = '%s' " % (
            db.escape_string(detail), sec_report_id)
            print(update_sql)
            res = up_cursor.execute(update_sql)
            if res:
                print(res)
                up_db.commit()
                print(f'{sec_report_id}插入成功')
    
        count+=2
    

    可以解决问题,不过只是拿了几条做测试(我用的是第二种),这里没写终止条件,有朋友要用的话自己加上。

    2.通过pymysql的SSCursor没有缓存的游标

    pymysql.cursors.SSCursor代替默认的cursor会从数据库中一条一条的读取记录,从而不会造成内存卡死,但是也有需要注意的地方:

    • 这个游标对象只能读完所有行之后才能处理其他sql。如果你需要并行执行sql,需要重新生成一个连接
    • 必须一次性读完所有行,每次读取后处理数据要快,不能超过60s,否则mysql将会断开这次连接(没有遇到这个问题,遇到的可以讨论一下)
    import pymysql
    
    db = pymysql.connections.Connection(host=MYSQL_HOST,
                                   port=MYSQL_PORT,
                                   user=MYSQL_USER,
                                   password=MYSQL_PASSWORD,
                                   db=MYSQL_DB,
                                   charset='utf8mb4',
                                   cursorclass=pymysql.cursors.SSDictCursor)
    
    up_db = pymysql.connections.Connection(host=MYSQL_HOST,
                                   port=MYSQL_PORT,
                                   user=MYSQL_USER,
                                   password=MYSQL_PASSWORD,
                                   db=MYSQL_DB,
                                   charset='utf8mb4',)
                                   
    up_cursor = up_db.cursor()
    cursor = pymysql.cursors.SSCursor(db)
    select_sql = "select sec_report_id,detail from sec_report_original_data_detail"
    cursor.execute(select_sql)
    result = cursor.fetchone()
    
    try:
        while result is not None:
            sec_report_id = result[0]
            detail = result[1]
            update_sql = "update `sec_report_original_data_intact` set detail = '%s' where `sec_report_id` = '%s'"%(db.escape_string(detail),sec_report_id)
            res = up_cursor.execute(update_sql)
    
            if res:
                print(res)
                up_db.commit()
                print(f'{sec_report_id}插入成功')
            result = cursor.fetchone()
    except Exception as e:
        print(e)
    finally:
        up_cursor.close()
        cursor.close()
        db.close()
    

    解决了一次性读取大数据的方法,但是没找到特别好的存储那个detail字段中数据的办法,有朋友了解的可以沟通一下。

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