• MapReduce中TextInputFormat分片和读取分片数据源码级分析


      InputFormat主要用于描述输入数据的格式(我们只分析新API,即org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.InputFormat),提供以下两个功能:

      (1)数据切分:按照某个策略将输入数据切分成若干个split,以便确定MapTask个数以及对应的split;

      (2)为Mapper提供输入数据:读取给定的split的数据,解析成一个个的key/value对,供mapper使用。

      InputFormat有两个比较重要的方法:(1)List<InputSplit> getSplits(JobContext job);(2)RecordReader<LongWritable, Text> createRecordReader(InputSplit split,TaskAttemptContext context)。这两个方法分别对应上面的两个功能。

      InputSplit分片信息有两个特点:(1)是逻辑分片,只是在逻辑上对数据进行分片,并不进行物理切分,这点和block是不同的,只记录一些元信息,比如起始位置、长度以及所在的节点列表等;(2)必须可序列化,分片信息要上传到HDFS文件,还会被JobTracker读取,序列化可以方便进程通信以及永久存储。

      RecordReader对象可以将输入数据,即InputSplit对应的数据解析成众多的key/value,会作为MapTask的map方法的输入。

      我们本节就以最长使用的TextInputFormat为列来讲解分片和读取分片数据。

      先看继承关系:(1)public class TextInputFormat extends FileInputFormat;(2)public abstract class FileInputFormat<K, V> extends InputFormat;(3)public abstract class InputFormat。最顶的父类InputFormat只有两个未实现的抽象方法getSplits和createRecordReader;而FileInputFormat包含的方法比较多,如下图:

    ,我们在自己的MR程序中设置输入目录就是调用这里的方法;TextInputFormat这个类只有俩个方法,代码如下:

     1 /** An {@link InputFormat} for plain text files.  Files are broken into lines.
     2  * Either linefeed or carriage-return are used to signal end of line.  Keys are
     3  * the position in the file, and values are the line of text.. */
     4 public class TextInputFormat extends FileInputFormat<LongWritable, Text> {
     5 
     6   @Override
     7   public RecordReader<LongWritable, Text> 
     8     createRecordReader(InputSplit split,
     9                        TaskAttemptContext context) {
    10     return new LineRecordReader();
    11   }
    12 
    13   @Override
    14   protected boolean isSplitable(JobContext context, Path file) {
    15     CompressionCodec codec = 
    16       new CompressionCodecFactory(context.getConfiguration()).getCodec(file);
    17     return codec == null;
    18   }
    19 
    20 }

      isSplitable方法就是是否要切分文件,这个方法显示如果是压缩文件就不切分,非压缩文件就切分。

      接下来,我们只关注上面说的那两个主要方法,首先来看:

      一、getSplits方法,这个方法在FileInputFormat类中,它的子类一般只需要实现TextInputFormat中的两个方法而已,getSplits方法代码如下: 

     1  /** 
     2    * Generate the list of files and make them into FileSplits.
     3    */ 
     4   public List<InputSplit> getSplits(JobContext job
     5                                     ) throws IOException {
     6     long minSize = Math.max(getFormatMinSplitSize(), getMinSplitSize(job));
     7     long maxSize = getMaxSplitSize(job);    //Long.MAX_VALUE
     8 
     9     // generate splits
    10     List<InputSplit> splits = new ArrayList<InputSplit>();
    11     List<FileStatus>files = listStatus(job);
    12     for (FileStatus file: files) {
    13       Path path = file.getPath();
    14       FileSystem fs = path.getFileSystem(job.getConfiguration());
    15       long length = file.getLen();    //整个文件的长度
    16       BlockLocation[] blkLocations = fs.getFileBlockLocations(file, 0, length);
    17       if ((length != 0) && isSplitable(job, path)) {    //默认是true,但是如果是压缩的,则是false
    18         long blockSize = file.getBlockSize();        //64M,67108864B
    19         long splitSize = computeSplitSize(blockSize, minSize, maxSize);    //计算split大小  Math.max(minSize, Math.min(maxSize, blockSize))
    20 
    21         long bytesRemaining = length;            
    22         while (((double) bytesRemaining)/splitSize > SPLIT_SLOP) {
    23           int blkIndex = getBlockIndex(blkLocations, length-bytesRemaining);
    24           splits.add(new FileSplit(path, length-bytesRemaining, splitSize, 
    25                                    blkLocations[blkIndex].getHosts()));        //hosts是主机名,name是IP
    26           bytesRemaining -= splitSize;        //剩余块的大小
    27         }
    28         
    29         if (bytesRemaining != 0) {    //最后一个
    30           splits.add(new FileSplit(path, length-bytesRemaining, bytesRemaining, 
    31                      blkLocations[blkLocations.length-1].getHosts()));
    32         }
    33       } else if (length != 0) {    //isSplitable(job, path)等于false
    34         splits.add(new FileSplit(path, 0, length, blkLocations[0].getHosts()));
    35       } else {
    36         //Create empty hosts array for zero length files
    37         splits.add(new FileSplit(path, 0, length, new String[0]));
    38       }
    39     }
    40     
    41     // Save the number of input files in the job-conf
    42     job.getConfiguration().setLong(NUM_INPUT_FILES, files.size());
    43 
    44     LOG.debug("Total # of splits: " + splits.size());
    45     return splits;
    46   }
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      (1)minSize = Math.max(getFormatMinSplitSize(), getMinSplitSize(job)):getFormatMinSplitSize()=1,getMinSplitSize(job)获取"mapred.min.split.size"指定的大小,默认是1;

      (2)maxSize = getMaxSplitSize(job):getMaxSplitSize(job)获取"mapred.max.split.size",默认是Long.MAX_VALUE,Long类型的最大值;

      (3)返回输入目录下所有文件的FileStatus信息列表;

      (4)然后对每一个文件获取它的目录、文件的长度、文件对应的所有块的信息(可能有多个块,每个块对应3个副本);

      (5)然后如果文件长度不为0且支持分割(isSplitable方法等于true):获取block大小,默认是64MB,通过方法computeSplitSize(blockSize, minSize, maxSize)计算分片大小splitSize,这个方法Math.max(minSize, Math.min(maxSize, blockSize));然后将bytesRemaining(剩余未分片字节数)设置为整个文件的长度,A、如果bytesRemaining超过分片大小splitSize一定量才会将文件分成多个InputSplit:bytesRemaining)/splitSize > SPLIT_SLOP(默认1.1),B、就会执行getBlockIndex(blkLocations, length-bytesRemaining)获取block的索引,第二个参数是这个block在整个文件中的偏移量,在循环中会从0越来越大,该方法代码如下:

     1  protected int getBlockIndex(BlockLocation[] blkLocations, 
     2                               long offset) {
     3     for (int i = 0 ; i < blkLocations.length; i++) {
     4       // is the offset inside this block?
     5       if ((blkLocations[i].getOffset() <= offset) &&
     6           (offset < blkLocations[i].getOffset() + blkLocations[i].getLength())){
     7         return i;
     8       }
     9     }
    10     BlockLocation last = blkLocations[blkLocations.length -1];
    11     long fileLength = last.getOffset() + last.getLength() -1;
    12     throw new IllegalArgumentException("Offset " + offset + 
    13                                        " is outside of file (0.." +
    14                                        fileLength + ")");
    15   }
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      这个方法中的if语句的条件会限制获取到,这个偏移量对应的block的索引;C、将这个索引对应的block信息的主机节点以及文件的路径名、开始的便宜量、分片大小splitSize封装到一个InputSplit中加入List<InputSplit> splits;D、bytesRemaining -= splitSize修改剩余字节大小;E、返回A中继续判断,如果满足即系走BCD,否则跳出循环。如果剩余bytesRemaining还不为0,表示还有未分配的数据,将剩余的数据及最后一个block加入splits。

      (6)如果不允许分割isSplitable==false,则将第一个block、文件目录、开始位置为0,长度为整个文件的长度封装到一个InputSplit,加入splits中;

      (7)如果文件的长度==0,则splits.add(new FileSplit(path, 0, length, new String[0]))没有block,并且初始和长度都为0;

      (8)将输入目录下文件的个数赋值给 "mapreduce.input.num.files",方便以后校对;

      (9)返回分片信息splits。

      这就是getSplits获取分片的过程。当使用基于FileInputFormat实现InputFormat时,为了提高MapTask的数据本地性,应尽量使InputSplit大小与block大小相同。

       特殊问题:就是如果分片大小超过bolck大小,但是InputSplit中的封装了单个block的所在主机信息啊,这样能读取多个bolck数据吗?这个问题我们留到最后讲解。

      二、createRecordReader方法,该方法返回一个RecordReader对象,实现了类似的迭代器功能,将某个InputSplit解析成一个个key/value对。RecordReader应该注意两点:

      A、定位记录边界:为了能识别一条完整的记录,应该添加一些同步标示,TextInputFormat的标示是换行符;SequenceFileInputFormat的标示是每隔若干条记录会添加固定长度的同步字符串。为了解决InputSplit中第一条或者最后一条可能夸InputSplit的情况,RecordReader规定每个InputSplit的第一条不完整记录划给前一个InputSplit。

      B、解析key/value:将每个记录分解成key和value两部分,TextInputFormat每一行的内容是value,该行在整个文件中的偏移量为key;SequenceFileInputFormat的记录共有四个字段组成:前两个字段分别是整个记录的长度和key的长度,均为4字节,后两个字段分别是key和value的内容。

      TextInputFormat使用的RecordReader是org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.LineRecordReader。我们在MapReduce的MapTask任务的运行源码级分析这篇文章中有介绍过LineRecordReader,initialize方法主要是获取分片信息的初始位置和结束位置,以及输入流(若有压缩则是压缩流);mapper的key/value是通过LineRecordReader.nextKeyValue()方法将key和value读取到key和value中的,在这个方法中key被设置为在文件中的偏移量,value通过LineReader.readLine(value, maxLineLength, Math.max((int)Math.min(Integer.MAX_VALUE, end-pos),maxLineLength))这个方法会读取一行数据放入value之中,方法代码如下:

     1  /**
     2    * Read one line from the InputStream into the given Text.  A line
     3    * can be terminated by one of the following: '
    ' (LF) , '
    ' (CR),
     4    * or '
    ' (CR+LF).  EOF also terminates an otherwise unterminated
     5    * line.
     6    *
     7    * @param str the object to store the given line (without newline)
     8    * @param maxLineLength the maximum number of bytes to store into str;
     9    *  the rest of the line is silently discarded.
    10    * @param maxBytesToConsume the maximum number of bytes to consume
    11    *  in this call.  This is only a hint, because if the line cross
    12    *  this threshold, we allow it to happen.  It can overshoot
    13    *  potentially by as much as one buffer length.
    14    *
    15    * @return the number of bytes read including the (longest) newline
    16    * found.
    17    *
    18    * @throws IOException if the underlying stream throws
    19    */
    20   public int readLine(Text str, int maxLineLength,
    21                       int maxBytesToConsume) throws IOException {
    22     /* We're reading data from in, but the head of the stream may be
    23      * already buffered in buffer, so we have several cases:
    24      * 1. No newline characters are in the buffer, so we need to copy
    25      *    everything and read another buffer from the stream.
    26      * 2. An unambiguously terminated line is in buffer, so we just
    27      *    copy to str.
    28      * 3. Ambiguously terminated line is in buffer, i.e. buffer ends
    29      *    in CR.  In this case we copy everything up to CR to str, but
    30      *    we also need to see what follows CR: if it's LF, then we
    31      *    need consume LF as well, so next call to readLine will read
    32      *    from after that.
    33      * We use a flag prevCharCR to signal if previous character was CR
    34      * and, if it happens to be at the end of the buffer, delay
    35      * consuming it until we have a chance to look at the char that
    36      * follows.
    37      */
    38     str.clear();
    39     int txtLength = 0; //tracks str.getLength(), as an optimization
    40     int newlineLength = 0; //length of terminating newline
    41     boolean prevCharCR = false; //true of prev char was CR
    42     long bytesConsumed = 0;
    43     do {
    44       int startPosn = bufferPosn; //starting from where we left off the last time
    45       if (bufferPosn >= bufferLength) {
    46         startPosn = bufferPosn = 0;
    47         if (prevCharCR)
    48           ++bytesConsumed; //account for CR from previous read
    49         bufferLength = in.read(buffer);    //从输入流中读取一定数量的字节,并将其存储在缓冲区数组 b 中。以整数形式返回实际读取的字节数。
    50         if (bufferLength <= 0)        //结束了,没数据了
    51           break; // EOF
    52       }
    53       //'
    ',ASCII码:10,意义:换行NL;;;;'
    ' ,ASCII码:13,意义: 回车CR
    54       for (; bufferPosn < bufferLength; ++bufferPosn) { //search for newline
    55         if (buffer[bufferPosn] == LF) {            //如果是换行字符
    
    56           newlineLength = (prevCharCR) ? 2 : 1;
    57           ++bufferPosn; // at next invocation proceed from following byte,越过换行字符
    58           break;
    59         }
    60         if (prevCharCR) { //CR + notLF, we are at notLF,如果是回车字符
    
    61           newlineLength = 1;
    62           break;
    63         }
    64         prevCharCR = (buffer[bufferPosn] == CR);
    65       }
    66       int readLength = bufferPosn - startPosn;
    67       if (prevCharCR && newlineLength == 0)    //表示还没遇到换行,有回车字符,且缓存最后一个是
    
    68         --readLength; //CR at the end of the buffer
    69       bytesConsumed += readLength;
    70       int appendLength = readLength - newlineLength;    //newlineLength换行符个数
    71       if (appendLength > maxLineLength - txtLength) {
    72         appendLength = maxLineLength - txtLength;
    73       }
    74       if (appendLength > 0) {
    75         str.append(buffer, startPosn, appendLength);    //将数据加入str
    76         txtLength += appendLength;
    77       }
    78     } while (newlineLength == 0 && bytesConsumed < maxBytesToConsume);//循环条件没有换行并且没超过上限
    79 
    80     if (bytesConsumed > (long)Integer.MAX_VALUE)
    81       throw new IOException("Too many bytes before newline: " + bytesConsumed);    
    82     return (int)bytesConsumed;
    83   }
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      这个方法目的就是读取一行记录写入str中。bytesConsumed记录这读取的字节总数;bufferLength = in.read(buffer)从输入流读取bufferLength字节的数据放入buffer中;do-while中开始部分的if语句是要保证将bufferLength个字节数据处理完毕之后再从输入流中读取下一批数据;newlineLength表示换行的标记符长度(0,1,2三种值),因为不同的系统换行标记可能不同,有三种: (回车符)、 (换行符)、 ( :  UNIX 系统行末结束符; : window 系统行末结束符; :  MAC OS 系统行末结束符);for循环会挨个检查字符是否是 或者 ,如果是回车符 ,还会将prevCharCR设置为true,当前字符如果是换行符 ,prevCharCR==true时(表示上一个字符是回车符 )则newlineLength=2(这表明当前系统的换行标记是 ),prevCharCR==false时(表示上一个字符不是回车符 )则newlineLength=1(这表明当前系统的换行标记是 ),并退出for循环;如果当前字符不是换行符 且prevCharCR==true(表明当前系统的换行标记是 )则newlineLength = 1并退出for循环;这样就找到了换行的标记,然后计算数据的长度appendLength(不包括换行符),将buffer中指定位置开始长度为appendLength的数据追加到str(这里其实是value)中;txtLength表示的是str(这里其实是value中值的长度);do-while循环的条件是:1、没有发现换行标记newlineLength == 0;2、读取的字节数量没有超过上限bytesConsumed < maxBytesToConsume,这俩条件要同时满足。这其中有个问题就是当前系统的换行标记是 ,但是这两个字符没有同时出现在这次读取的数据之中, 在下一个批次之中,这没关系,上面的for循环会检查 出现之后的下一个字符是否是 再对newlineLength进行设置的。从这个方法可以看出,即使是记录跨split、跨block也不能阻止它完整读取一行数据的决心啊。

      再返回查看LineRecordReader.nextKeyValue()方法,这个方法代码如下:  

     1 public boolean nextKeyValue() throws IOException {
     2     if (key == null) {
     3       key = new LongWritable();
     4     }
     5     key.set(pos);
     6     if (value == null) {
     7       value = new Text();
     8     }
     9     int newSize = 0;
    10     while (pos < end) {
    11       newSize = in.readLine(value, maxLineLength,
    12                             Math.max((int)Math.min(Integer.MAX_VALUE, end-pos),
    13                                      maxLineLength));
    14       if (newSize == 0) {
    15         break;
    16       }
    17       pos += newSize;
    18       if (newSize < maxLineLength) {
    19         break;
    20       }
    21 
    22       // line too long. try again
    23       LOG.info("Skipped line of size " + newSize + " at pos " + 
    24                (pos - newSize));
    25     }
    26     if (newSize == 0) {
    27       key = null;
    28       value = null;
    29       return false;
    30     } else {
    31       return true;
    32     }
    33   }
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      这个方法会控制split的读取数据的结束位置,上面的readLine方法只关注输入流不会管split的大小的。需要注意的是其中的while循环,其中的pos和end表示当前在文件中的偏移量和split的结束位置,即使这个split的最后一行跨split也会完整的获取一行。也就保证了一个记录的完整性。mapper获取key/value会通过调用getCurrentKey()和getCurrentValue()来达到的,但是调用这俩方法前得先调用nextKeyValue()方法才能实现key和value的赋值。

      

      到这我们回头看看上面的那个特殊问题,就是split的大小超过block的大小数据读取的问题,我们前面已经讲过split是逻辑分片,不是物理分片,当MapTask的数据本地性发挥作用时,会从本机的block开始读取,超过这个block的部分可能还在本机也可能不在本机,如果是后者的话就要从别的节点拉数据过来,因为实际获取数据是一个输入流,这个输入流面向的是整个文件,不受什么block啊、split的影响,split的大小越大可能需要从别的节点拉的数据越多,从从而效率也会越慢,拉数据的多少是由getSplits方法中的splitSize决定的。所以为了更有效率,应该遵循上面的黑体字。

      至此,TextInputFormat的分片和数据读取过程讲完了。这只是一个例子,其他InputFormat可以参考这个。

      参考:1、董西成,《hadoop技术内幕---深入理解MapReduce架构设计与实现原理》

           2、http://www.cnblogs.com/clarkchen/archive/2011/06/02/2068609.html

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