• Chapter15 Principles of Metabolic Regulation


     

    15.1 调节代谢的通路

    (1)细胞和有机体维持着动态稳定

    • 调节作用的基因多 2500个 12%
    • 激酶占比多 300个
    • 一个通路受到多方调节

    (2)酶的数量和催化活性 可以被调节

    • 反应物的调控
      • 糖酵解的产物,代谢物和cofactor,底物
    • 信号分子的调控
      • cAMP,Ca2+

    ①细胞外信号:激素、神经信号(乙酰胆碱),生长因子,细胞因子

    • 调节转录因子的结合
    • 相关功能的酶共享response element,被一同调节

    ②mRNA

    ③蛋白合成后的调控

    • 蛋白可以被泛素识别降解
    • 快速关闭某一蛋白的作用很费能量,但是有助于机体快速响应

    ④转运蛋白

    • 细胞质被分割成小区室依靠膜上转运到白调控反应物浓度

    代谢组学的研究工具:DNA微阵列、二维凝胶电泳

    一旦酶被合成,如何调控:

    • 底物的浓度
    • 变构影响因子
    • 共价修饰
      • 磷酸化或去磷酸化
      • 阻遏因子的去除
    • 结合其他因子
      • PKA的激活要cAMP的结合

    (3)细胞内有些反应是近乎平衡的,在底物浓度的变化下反应反向会变化

      还有一些反应处在非平衡状态,他们是调控的位点

    • 以ATP反应供能为例,如果反应平衡了,ATP就不再有正反应的驱动力
    • 所以机体要有敏感的调控确保ATP浓度远高于平衡浓度
    • 机体的代谢通路中的关键反应都是极度不平衡的,且受到多方调控(PFK-1的反应)

    (4)腺嘌呤核苷酸在代谢调控中起到重要作用(AMPK维持ATP足量)

    • ATP/AMP 含量是细胞能量状况的标志
    • ATP的缺少使得ATP参与反应的酶 无法结合足够的底物(ATP)
    • 热力学上ATP维持高浓度推动需要ATP的反应正向进行
    • 当饥饿时,ATP会减少,AMP会增多:
      • 机体AMP变构 AMP蛋白激酶AMPK ,使其被LKB1磷酸化激活 
      • AMPK激活后推动糖酵解,脂肪酸氧化,葡萄糖转运;抑制糖原合成

    (5)除了ATP,其他物质在体内也要维持稳定:NADH、NADPH、葡萄糖

    • 脑细胞没有储糖能力,全靠胰岛素和胰高血糖素(glucagon)来平衡脑补供糖
    • 进化的压力使得调节机制处于如下协调的状态:

    ①最大化能量利用效率(不同时做反方向的事)

    ②合理分配主干和支路代谢途径

    ③选择合适的供能物质

    ④在产物聚集时,减少合成

    15.2 代谢控制分析

    (1)三个参数

    ① 通量控制系数 C

    • 代谢途径中每个酶对调节代谢物流速的相对贡献

    ② 弹性系数 ε

    • 单个酶对代谢物或效应物浓度的反应性,是酶固有的动力学性质

    ③反应系数 R

    • 外部控制物对流经代谢途径通量的影响

    总和原理 代谢途径各步反应C之和为1

    参数相关原理 R = C·ε

    (2)control 和 regulation的概念

    • control 作用的酶是调节靶点,调控代谢的通路
      • 增加可以使代谢加倍
    • regulation 作用的酶是维持机体的稳态,不至于内环境改变造成代谢突然变化
      • 增加不能使代谢加倍

     (3)可以通过提高某一通路的所有酶浓度来提高一条路的flux

    15.3 糖酵解和糖异生的协同调控

    • substrate cycle 底物循环虽然额外地消耗了能量,但是对机体调控有利

    (1)己糖激酶的同工酶在肌肉和肝脏中以不同方式调节

    • 肝中的己糖激酶IV(葡糖激酶)
      • Km值大,
      • 不被催化产物G6P抑制
      • 调控方式:
      • 高血糖时,葡萄糖通过GLUT2转运入肝细胞,被高效合成糖原
      • 当血糖浓度降低时,F6P刺激调控蛋白与酶IV的结合(与细胞核内),抑制反应
      • 葡萄糖和F6P竞争结合,当葡萄糖含量升高,酶IV被释放
    • 一般的己糖激酶在产物G6P升高时会被抑制

     (2)己糖激酶IV 和 G6Pase 可以在转录水平调节

    (3)PFK-1 和 F1,6BPase 是互为相反调节的

    • 糖酵解、柠檬酸产物堆积
    • AMP、ADP堆积

     

    (4)F2,6BP 是强有力的PFK-1、FBPase-1 别构调节剂

    • PFK-2/FPBase-2 是同一个蛋白不同结构域
    •  胰岛素和胰高血糖素通过对 PFK-2/FPBase-2 磷酸化情况的控制,控制F2,6BP的含量控制PFK-1、FBPase-1以决定糖酵解糖异生方向

     

    (5)木酮糖对于糖脂肪代谢是一个关键调控物

    • 木酮糖由戊糖途径生成
    • 磷酸化激活PP2A
    • PP2A 脱氢激活PFK-2,F2,6BP升高
    • 增加了乙酰CoA的生成和NADPH的生成

    (5)丙酮酸激酶 的调控

    • 在肝脏中,血糖降低使得胰高血糖素分泌,通过cAMP通路失活丙酮酸激酶,使得更过糖流向别处
    • 而在肌肉,肾上腺素刺激的cAMP上升会刺激糖原的分解和糖酵解来满足所需

     

    (6) 糖异生丙酮酸羧激酶的调节

    (7)对糖酵解、糖异生 的转录水平调节改变酶的数量

    ① 转录因子:ChREBP糖相应元件结合蛋白

    •  戊糖途径生成的木酮糖xylulose给机体带来了糖酵解底物充足的信号,诱生PP2A使得ChRBP去磷酸化
    • ChRBP作为转录因子结合基因上游

    ② 转录因子:SREBP-1c 固醇调控元件结合蛋白

    • 受胰岛素刺激,促进脂肪合成相关转录

    ③转录因子:CREB 环腺苷磷酸响应原件结合蛋白

    • FOXO1 是一种CREB
    • 胰高血糖素可以阻止PKB对FOXO1的磷酸化,使其促进转录糖异生相关蛋白

    15.3 SUMMARY

    • 糖酵解和糖异生有3个不共享酶的反应,这是调控的位点
    • 己糖激酶在肝中有特殊作用:低血糖时释放葡萄糖入血,高血糖时合成糖原
    • PFK-1被ATP别构抑制,F2,6BP别构激活
    • 丙酮酸激酶被ATP别构抑制,在肝中还能被cAMP磷酸化而抑制
    • 糖再生的调控位点在丙酮酸羧化酶、FBPase-1
    • F2,6BP对PFK-1,FBPase-1x的相反作用控制了糖酵解和糖异生的底物循环
    • 胰高血糖素和肾上腺素通过cAMP磷酸化PFK-2/FBPase-2来减少F2,6BP;胰岛素的作用是去磷酸化
    • 木酮糖作为一种信号促进糖酵解
    • 转录因子接受外来信号,作用于DNA来调控酶合成

    15.4 糖原的代谢 

    (1)糖原分解需要的酶

    • 糖原磷酸化酶
    • glycogen debranching enzyme 
    • 磷酸化 glucomutase
      • 糖原分解产生的G1P由glucomutase变成G6P进入血液循环

     

    (2)糖原的合成要让糖结合形成G-UDP,才能加到糖链上

    • 这个结合是不可逆的,推动反应正向进行
      • 尽管三磷酸核苷与葡糖磷酸反应的自由能小,但生成的焦磷酸水解推动反应
    • 核苷对酶的非共价促进作用
    • 对要进行糖原生成的糖分子进行了标记
    • 糖原合成到一定长度要支化,形成的非还原糖基方便合成和分解糖原

    (3)糖原合成的起始阶段需要引物

    • 由glycogenin催化在自身合成的8bp糖链形成

    15.5 糖原分解与合成的协同调控

    (1)糖原磷酸化酶受到变构调节和激素调节

    • 通过一系列酶的影响,最终通过磷酸化的状态决定活性(磷酸化有活性)

     

    • 肾上腺素造成的级联反应

    • 胰岛素通过去磷酸化降低酶活性
    • 葡萄糖的增多别构抑制酶的活性

    (2)糖原合成酶去磷酸化时表现出活性

    •  G6P进行变构调节
    • 糖原合成酶去磷酸化状态有活性
    • 总之,胰高血糖素和肾上腺素造成糖原合成酶的磷酸化,和糖原磷酸化酶的磷酸化,增高血糖
    • 胰岛素的作用相反

     

     

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