001、
root@PC1:/home/test# ls test.fasta test.py root@PC1:/home/test# cat test.fasta ## 测试数据 >scaffold_1 CCCGGGTAAAACGGGTCTTCAAGAAAACGCTCCTCCGTTAATGCCGGCCGATTCAAATAA CGCTGATTCTGATTCAGGATATACAATCTGACATGATGAACAGGTTTTCCAATTGGAATC CGTT >scaffold_2 CACGCCGCCAGCGTTCGTCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCGATAAATGGATCACAGGTT AAGTTCACCGCATCCTGCGGCGACACCTGTGTGGCCTGCGTCGTGCAGGCCCTAGTTTGA >scaffold_3 TTGATCCAGTGGCTCCGGTTACTCCAGTTGATCCTGTTGCGCCTGTTGCTCCAGTTTCTC CGGTTGGTCCGGTTGATCCGGTTGCACCTGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTACTCCCGTCG CACCAGTTTCTCCTGTCGCACCAGTTGATCCTGTTGCGCCTGTTGGTCCTGTATCTCCAG >scaffold_4 CCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCGATA root@PC1:/home/test# cat test.py ## 脚本 #!/usr/bin/python in_file = open("test.fasta", "r") out_file = open("result.txt", "w") for i in in_file: i = i.replace(">","") out_file.write(i) in_file.close() out_file.close() root@PC1:/home/test# python test.py root@PC1:/home/test# ls result.txt test.fasta test.py root@PC1:/home/test# cat result.txt ## 运行结果 scaffold_1 CCCGGGTAAAACGGGTCTTCAAGAAAACGCTCCTCCGTTAATGCCGGCCGATTCAAATAA CGCTGATTCTGATTCAGGATATACAATCTGACATGATGAACAGGTTTTCCAATTGGAATC CGTT scaffold_2 CACGCCGCCAGCGTTCGTCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCGATAAATGGATCACAGGTT AAGTTCACCGCATCCTGCGGCGACACCTGTGTGGCCTGCGTCGTGCAGGCCCTAGTTTGA scaffold_3 TTGATCCAGTGGCTCCGGTTACTCCAGTTGATCCTGTTGCGCCTGTTGCTCCAGTTTCTC CGGTTGGTCCGGTTGATCCGGTTGCACCTGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTACTCCCGTCG CACCAGTTTCTCCTGTCGCACCAGTTGATCCTGTTGCGCCTGTTGGTCCTGTATCTCCAG scaffold_4 CCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCGATA