假设系统为Ubuntu 10.10 64位。
先来看看当前的系统默认的java版本，及提供商。通过命令java -version
caoqitong@ubuntu:~$ java -version
java version "1.6.0_20"
OpenJDK Runtime Environment (IcedTea6 1.9.9) (6b20-1.9.9-0ubuntu1~10.10.2)
OpenJDK 64-Bit Server VM (build 19.0-b09, mixed mode)
根据这个信息，我们可以知道，当前默认的java jdk是OpenJDK 1.6.0 64位VM。
现在我们想要安装SunJDK，并且设置为默认的JDK，以便我们在任何地方，都能直接使用的是Sun的JDK，而不是OpenJDK。
- 安装SunJDK
首先，安装SunJDK， 有的文章说可以通过Ubunttu的命令方式自动安装：
caoqitong@ubuntu:~$ sudo apt-get install sun-java6-jdk
可是，在Ubuntu 10.10 的32位及64位中，都无法直接通过该命令安装，也许是名字变了。
我们采用的是手动安装的方法：
先到sun 官网，www.sun.com 下载 JDK。（sun已经被oracle收购了，因此会自动重定向到oracle官网），这里我们下载的是jdk-6u26-linux-x64.bin，因为这里先假设的是Ubuntu 64位。应对你的需求，可以下对应的版本，比如32位的jdk-6u26-linux-i586.bin。
比如，安装到/opt目录中，先使用mv命令，将该bin文件移动到opt目录下：
caoqitong@ubuntu:~$ sudo mv Download/jdk-6u26-linux-x64.bin /opt
(可能要求输入用户名密码，因为用的是sudo命令)
然后切换到/opt目录下，并通过chmod命令赋予该bin可执行权限：
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo chmod +x jdk-6u26-linux-x64.bin
执行安装：
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo sh jdk-6u26-linux-x64.bin
或 caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo ./jdk-6u26-linux-x64.bin
- 设置JAVA_HOME环境变量：
如果设置全局的环境变量（针对所用用户）：
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo gedit /etc/profile
export JAVA_HOME=/opt/jdk1.6.0_26
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=$CLASSPATH:$JAVA_HOME/lib
把上面添加的，原封不动的copy到文件末尾（在umask 022之后）。
(PS，Linux的路径分割符是冒号“:”，大家知道Win下是分号“;”，此处切忌不要在分号前后留空白，鄙人曾经为了好看些，就人为的加入了些前后空格，结果可想而知，所有命令都没法用了，后果很严重啊！打开shell，还会报：bash: export: `/opt/jdk1.6.0_26/bin:': not a valid identifier)
当然也可以基于安全考虑，只针对当前用户设置环境变量：
caoqitong@ubuntu:～$ gedit .bashrc
把上面三行export语句copy到文件末尾即可。
- 设置默认JDK
SUN JDK已经算安装完毕，可当我们用java -version时发现，仍旧是使用的老的OpenJDK。
需要我们更改系统的默认JDK设置：
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo update-alternatives --install /usr/bin/java java /opt/jdk1.6.0_26/bin/java 300
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo update-alternatives --install /usr/bin/javac javac /opt/jdk1.6.0_26/bin/javac 300
update-alternatives: using /opt/jdk1.6.0_26/bin/javac to provide /usr/bin/javac (javac) in auto mode.
接下来，我们先看看，系统中已经存在的JDK：
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo update-alternatives --list java
/opt/jdk1.6.0_26/bin/java
/usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/java
配置：
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo update-alternatives --config java
There are 2 choices for the alternative java (providing /usr/bin/java).
Selection Path Priority Status
------------------------------------------------------------
* 0 /usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/java 1061 auto mode
1 /opt/jdk1.6.0_26/bin/java 300 manual mode
2 /usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/java 1061 manual mode
Press enter to keep the current choice[*], or type selection number: 1
update-alternatives: using /opt/jdk1.6.0_26/bin/java to provide /usr/bin/java (java) in manual mode.
* 表示当前的默认JDK，可以看出是OpenJDK，同时可以看到刚安装的Sun JDK，序号为1，且之前设置的状态值300。
这里需要你输入设置默认的序号，这里当然我们选1。
这里，你可以再次执行该命令来查看我们的设置是否ok：
caoqitong@ubuntu:/opt$ sudo update-alternatives --config java
There are 2 choices for the alternative java (providing /usr/bin/java).
Selection Path Priority Status
------------------------------------------------------------
0 /usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/java 1061 auto mode
* 1 /opt/jdk1.6.0_26/bin/java 300 manual mode
2 /usr/lib/jvm/java-6-openjdk/jre/bin/java 1061 manual mode
Press enter to keep the current choice[*], or type selection number: 1
由于这里已经成功设置了Sun JDK，所以，这里重复选择后，没有效果了。
- 验证默认JDK
注销后重新登录，使用命令java -version
caoqitong@ubuntu:~$ java -version
java version "1.6.0_26"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_26-b03)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 20.1-b02, mixed mode)