问题:
- 基本原理
- 实际应用
GWAS是在大自然的数据中去筛选疾病associated genes
CRISPR Screening则是在人为的库里筛选疾病associated genes
分析:
- GWAS的最大用途就是大数据,样本量上去了就很好搞,但现在几乎很难搞到大数据了,已经被瓜分得差不多了,就算你有钱也搞不到,样本受医生的控制,适合关系党;
- CRISPR Screening不受限制,有钱就能筛,有一点的实验设计门槛,适合技术党;
核心的原理就是通过对比,找到表型关联基因,非常直接。
研究范文:
- CRISPR Screens Identify Essential Cell Growth Mediators in BRAF Inhibitor-resistant Melanoma - 2020
- 2021. In vivo CRISPR screens identify the E3 ligase Cop1 as a modulator of macrophage infiltration and cancer immunotherapy target. Cell
参考:
- 精准大海捞针--CRISPR screening专题