流程概述：
1、打包资源文件，生成R.java文件
2、处理aidl文件，生成相应java 文件
3、编译工程源代码，生成相应class 文件
4、转换所有class文件，生成classes.dex文件
5、打包生成apk
6、对apk文件进行签名
7、对签名后的apk文件进行对其处理
打包过程使用的工具
名称
功能介绍 在操作系统中的路径 源码路径
aapt
（Android Asset Package Tool）
Android资源打包工具
${ANDROID_SDK_HOME} /build-tools/
ANDROID_VERSION/aapt
frameworksase oolsaap
aidl
（android interface definition language）
Android接口描述语言，
将aidl转化为.java文件的工具
${ANDROID_SDK_HOME}/build-tools/
ANDROID_VERSION/aidl
frameworksase oolsaidl
javac Java Compiler
${JDK_HOME}/java
c或/usr/bin/javac
dex
转化.class文件为Davik VM
能识别的.dex文件
${ANDROID_SDK_HOME}/build-tools/
ANDROID_VERSION/dx
apkbuilder
生成apk包
${ANDROID_SDK_HOME}/tools/
apkbuilder
sdksdkmanagerlibssdklib
srccomandroidsdklibuild
ApkBuilderMain.java
jarsigner .jar文件的签名工具 ${JDK_HOME}/jarsigner或/usr/bin/jarsigner
zipalign 字节码对齐工具
${ANDROID_SDK_HOME}/tools
/zipalign
第一步：打包资源文件，生成R.java文件。
【输入】Resource文件（就是工程中res中的文件）、Assets文件（相当于另外一种资源，这种资源Android系统并不像对res中的文件那样优化它）、AndroidManifest.xml文件（包名就是从这里读取的，因为生成R.java文件需要包名）、Android基础类库（Android.jar文件）
【工具】aapt工具
【输出】打包好的资源（bin目录中的resources.ap_文件）、R.java文件（gen目录中）
打包资源的工具aapt，大部分文本格式的XML资源文件会被编译成二进制格式的XML资源文件，除了assets和res/raw资源被原装不动地打包进APK之外，其它的资源都会被编译或者处理。 。
生成过程主要是调用了aapt源码目录下的Resource.cpp文件中的buildResource（）函数，该函数首先检查AndroidManifest.xml的合法性，然后对res目录下的资源子目录进行处理，处理的函数为makeFileResource（），处理的内容包括资源文件名的合法性检查，向资源表table添加条目等，处理完后调用compileResourceFile（）函数编译res与asserts目录下的资源并生成resources.arsc文件，compileResourceFile（）函数位于aapt源码目录的ResourceTable.cpp文件中，该函数最后会调用parseAndAddEntry（）函数生成R.java文件，完成资源编译后，接下来调用compileXmlfile()函数对res目录的子目录下的xml文件分别进行编译，这样处理过的xml文件就简单的被“加密”了，最后将所有的资源与编译生成的resorces.arsc文件以及“加密”过的AndroidManifest.xml文件打包压缩成resources.ap_文件（使用Ant工具命令行编译则会生成与build.xml中“project name”指定的属性同名的ap_文件）。
关于这一步更详细的流程可阅读http://blog.csdn.net/luoshengyang/article/details/8744683
第二步：处理aidl文件，生成相应的java文件。
【输入】源码文件、aidl文件、framework.aidl文件
【工具】aidl工具
【输出】对应的.java文件
对于没有使用到aidl的android工程，这一步可以跳过。aidl工具解析接口定义文件并生成相应的java代码供程序调用。
第三步：编译工程源代码，生成下相应的class文件。
【输入】源码文件（包括R.java和AIDL生成的.java文件）、库文件（.jar文件）
【工具】javac工具
【输出】.class文件
这一步调用了javac编译工程src目录下所有的java源文件，生成的class文件位于工程的binclasses目录下，上图假定编译工程源代码时程序是基于android SDK开发的，实际开发过程中，也有可能会使用android NDK来编译native代码，因此，如果可能的话，这一步还需要使用android NDK编译C/C++代码，当然，编译C/C++代码的步骤也可以提前到第一步或第二步。
第四步：转换所有的class文件，生成classes.dex文件。
【输入】 .class文件（包括Aidl生成.class文件，R生成的.class文件，源文件生成的.class文件），库文件（.jar文件）
【工具】javac工具
【输出】.dex文件
前面多次提到，android系统dalvik虚拟机的可执行文件为dex格式，程序运行所需的classes.dex文件就是在这一步生成的，使用的工具为dx，dx工具主要的工作是将java字节码转换为dalvik字节码、压缩常量池、消除冗余信息等。
第五步：打包生成apk。
【输入】打包后的资源文件、打包后类文件（.dex文件）、libs文件（包括.so文件，当然很多工程都没有这样的文件，如果你不使用C/C++开发的话）
【工具】apkbuilder工具
【输出】未签名的.apk文件
打包工具为apkbuilder，apkbuilder为一个脚本文件，实际调用的是android-sdk oolslibsdklib.jar文件中的com.android.sdklib.build.ApkBuilderMain类。它的代码实现位于android系统源码的sdksdkmanagerlibssdklibsrccomandroidsdklibuildApkBuilderMain.java文件，代码构建了一个ApkBuilder类，然后以包含resources.arsc的文件为基础生成apk文件，这个文件一般为ap_结尾，接着调用addSourceFolder()函数添加工程资源，addSourceFolder()会调用processFileForResource（）函数往apk文件中添加资源，处理的内容包括res目录与asserts目录中的文件，添加完资源后调用addResourceFromJar（）函数往apk文件中写入依赖库，接着调用addNativeLibraries()函数添加工程libs目录下的Native库（通过android NDK编译生成的so或bin文件），最后调用sealApk（）关闭apk文件。
第六步：对apk文件进行签名。
【输入】未签名的.apk文件
【工具】jarsigner
【输出】签名的.apk文件
android的应用程序需要签名才能在android设备上安装，签名apk文件有两种情况：一种是在调试程序时进行签名，使用eclipse开发android程序时，在编译调试程序时会自己使用一个debug.keystore对apk进行签名；另一种是打包发布时对程序进行签名，这种情况下需要提供一个符合android开发文档中要求的签名文件。签名的方法也分两种：一种是使用jdk中提供的jarsigner工具签名；另一种是使用android源码中提供的signapk工具，它的代码位于android系统源码build oolssignapk目录下。
第七步：对签名后的apk文件进行对齐处理。
【输入】签名后的.apk文件
【工具】zipalign工具
【输出】对齐后的.apk文件
这一步需要使用的工具为zipalign，它位于android-sdk ools目录，源码位于android系统源码的build oolszipalign目录，它的主要工作是将spk包进行对齐处理，使spk包中的所有资源文件距离文件起始偏移为4字节整数倍，这样通过内存映射访问apk文件时速度会更快，验证apk文件是否对齐过的工作由ZipAlign.cpp文件的verify()函数完成，处理对齐的工作则由process（）函数完成。
以一个具体项目中包含的具体文件为例作图如下：
关于Android打包apk过程中的细节以及打包后如何获取资源、查找资源、使用资源，移步老罗的博客，十分详细。
0. Android资源管理框架简要介绍和学习计划
1. 应用程序资源的编译和打包过程；
2. 应用程序资源的初始化过程；
3. 应用程序资源的查找过程。
https://blog.csdn.net/jason0539/article/details/44917745