MySQL默认采用的是MyISAM。
1，事务处理
innodb 支持事务功能，myisam 不支持。
Myisam 的执行速度更快，性能更好。
MyISAM不支持事务，而InnoDB支持。InnoDB的AUTOCOMMIT默认是打开的，即每条SQL语句会默认被封装成一个事务，自动提交，这样会影响速度，所以最好是把多条SQL语句显示放在begin和commit之间，组成一个事务去提交。
2，select ,update ,insert ,delete 操作
MyISAM：如果执行大量的SELECT，MyISAM是更好的选择。
InnoDB：如果你的数据执行大量的INSERT或UPDATE，出于性能方面的考虑，应该使用InnoDB表。DELETE
从性能上InnoDB更优，但DELETE FROM
table时，InnoDB不会重新建立表，而是一行一行的删除，在innodb上如果要清空保存有大量数据的表，最好使用truncate
table这个命令。
3，锁机制不同
InnoDB 为行级锁，myisam 为表级锁。
注意：当数据库无法确定，所找的行时，也会变为锁定整个表。
如： update table set num = 10 where username like "%test%";
4，查询表的行数不同
MyISAM：select count() from table,MyISAM只要简单的读出保存好的行数，注意的是，当count()语句包含 where条件时，两种表的操作是一样的
InnoDB ： InnoDB 中不保存表的具体行数，也就是说，执行select count(*) from table时，InnoDB要扫描一遍整个表来计算有多少行
没有where的count()使用MyISAM要比InnoDB快得多。因为MyISAM内置了一个计数器，count()时它直接从计数器中读，而InnoDB必须扫描全表。所以在InnoDB上执行count()时一般要伴随where，且where中要包含主键以外的索引列。为什么这里特别强调“主键以外”？因为InnoDB中primary index是和raw data存放在一起的，而secondary index则是单独存放，然后有个指针指向primary key。所以只是count()的话使用secondary index扫描更快，而primary key则主要在扫描索引同时要返回raw data时的作用较大。
5，物理结构不同
MyISAM ：每个MyISAM在磁盘上存储成三个文件。第一个文件的名字以表的名字开始，扩展名指出文件类型。
.frm文件存储表定义。
数据文件的扩展名为.MYD (MYData)。
索引文件的扩展名是.MYI (MYIndex)
InnoDB：基于磁盘的资源是InnoDB表空间数据文件和它的日志文件，InnoDB 表的大小只受限于操作系统文件的大小，一般为 2GB
6、存储空间
MyISAM：可被压缩，存储空间较小。支持三种不同的存储格式：静态表(默认，但是注意数据末尾不能有空格，会被去掉)、动态表、压缩表。
InnoDB：需要更多的内存和存储，它会在主内存中建立其专用的缓冲池用于高速缓冲数据和索引。
6，anto_increment 机制不同
更好和更快的auto_increment处理
7, 索引
全文索引是指对char、varchar和text中的每个词（停用词除外）建立倒排序索引。MyISAM的全文索引其实没啥用，因为它不支持中文分词，必须由使用者分词后加入空格再写到数据表里，而且少于4个汉字的词会和停用词一样被忽略掉。
InnoDB支持外键，MyISAM不支持。
MyISAM：支持 FULLTEXT类型的全文索引
InnoDB：不支持FULLTEXT类型的全文索引，但是innodb可以使用sphinx插件支持全文索引，并且效果更好。
8， 其他：为什么MyISAM会比Innodb 的查询速度快。
INNODB在做SELECT的时候，要维护的东西比MYISAM引擎多很多；
1）数据块，INNODB要缓存，MYISAM只缓存索引块， 这中间还有换进换出的减少；
2）innodb寻址要映射到块，再到行，MYISAM 记录的直接是文件的OFFSET，定位比INNODB要快
3）INNODB还需要维护MVCC一致；虽然你的场景没有，但他还是需要去检查和维护
MVCC ( Multi-Version Concurrency Control )多版本并发控制
9、 可移植性、备份及恢复
MyISAM：数据是以文件的形式存储，所以在跨平台的数据转移中会很方便。在备份和恢复时可单独针对某个表进行操作。
InnoDB：免费的方案可以是拷贝数据文件、备份 binlog，或者用 mysqldump，在数据量达到几十G的时候就相对痛苦了。