软件工程是把软件开发作为一项具体的工程来研究的，主要是工程进度、工程质量、工程费用等方面的控制和把握，注重宏观方面的东西。而计算机科学与技术，则偏向于具体的技术实现，技术发展等，偏向于数学和计算机科学，而不是工程学。
软件工程和计算机科学与技术专业同属计算机类专业，他们的联系确实非常紧密，但还是有很多区别的。众所周知，计算机系统由硬件系统与软件系统构成，计算机科学与技术专业偏重于硬件与计算机理论方面的学习研究，像计算机原理，计算机系统结构等方面的内容。当然也会设计软件方面，但不是太深。而软件工程专业则主要偏重于应用于实践，主要是培养适应国内外软件产业市场需求的高素质、多层次、适用型软件人才，这也是教育部专门设置独立于计算机学院之外的软件学院的原因。可以看下它们各自的课程设置，就会看出其中的差异。