花费了一些时间算是解决了总结一下结论，方便他人。
当需要在客户端显示网页时就要考虑用到浏览器插件，一个是MS的webbrowser，另一个好用的是webkit内核的第三方插件（webkit.net,google的open-webkit-sharp，做手机用的qtwebkit，Firefox的Geoko引擎的Windows Forms包装），webbrowser基本上可以满足需要，但是有一些问题不好解决，比如：IE6、7、8差异性大，用户不同的机器安装的IE内核不同，网页的兼容性，js脚本，不支持html5元素的网页等；令人开心的是老外分享有开源的第三方浏览器插件（下载地址：http://sourceforge.net/projects/webkitdotnet/ 一直没有更新最新版本2011），webkit.net可以很好的解决了上面的问题，使用跟webbrowser一样方便，提供的类方法也是很类似，减少学习成本可以很快的上手；其他的几个插件也是可以的，open-webkit-sharp目前更新版本3.0，完善和更新了bug，不过复杂的配置安装过程，全英文的文档，网上也有很多这方便的资料，有时间的或者有必要可以选择这个。
webkit.net调用js函数：
//webKitBrowser1.DocumentText =
// "<html><head><title>Test Page</title></head><body>" +
// "<p id="testelement" style="color: red">Hello, World!</p>" +
// "<div><p>A</p><p>B</p><p>C</p></div>" +
// "<script type="text/javascript">" +
// "function f() { window.open('http://www.google.com', 'myWindow'); }</script>" +
// "</body></html>";
webKitBrowser1.IsScriptingEnabled = true;//启用js函数调用
string str = webKitBrowser1.StringByEvaluatingJavaScriptFromString("Test()");//参数跟webbrowser有点不一样，方法名加括号，测试时不要直接alert,好像没显示出来
两句代码，js函数定义到需要调用的网页里面，或者直接嵌入一段js也可以，比如上面注释的部分。