• 面试被问傻!5亿个数大文件怎么排序?


    曾经被问傻的一道面试题分享给你:

    给你1个文件bigdata,大小4663M,5亿个数,文件中的数据随机,如下一行一个整数:

    6196302  
    3557681  
    6121580  
    2039345  
    2095006  
    1746773  
    7934312  
    2016371  
    7123302  
    8790171  
    2966901  
    ...  
    7005375
    

    现在要对这个文件进行排序,怎么搞?

    内部排序

    先尝试内排,选2种排序方式:

    3路快排:

    private final int cutoff = 8;  
      
    public <T> void perform(Comparable<T>[] a) {  
      perform(a,0,a.length - 1);  
    }  
      
    private <T> int median3(Comparable<T>[] a,int x,int y,int z) {  
      if(lessThan(a[x],a[y])) {  
        if(lessThan(a[y],a[z])) {  
          return y;  
        }  
        else if(lessThan(a[x],a[z])) {  
          return z;  
        }else {  
          return x;  
        }  
      }else {  
        if(lessThan(a[z],a[y])){  
          return y;  
        }else if(lessThan(a[z],a[x])) {  
          return z;  
        }else {  
          return x;  
        }  
      }  
    }  
      
    private <T> void perform(Comparable<T>[] a,int low,int high) {  
      int n = high - low + 1;  
      
      if(n <= cutoff) {  
        InsertionSort insertionSort = SortFactory.createInsertionSort();  
        insertionSort.perform(a,low,high);  
      
      }else if(n <= 100) {  
        int m = median3(a,low,low + (n >>> 1),high);  
        exchange(a,m,low);  
      
      }else {  
        int gap = n >>> 3;  
        int m = low + (n >>> 1);  
        int m1 = median3(a,low,low + gap,low + (gap << 1));  
        int m2 = median3(a,m - gap,m,m + gap);  
        int m3 = median3(a,high - (gap << 1),high - gap,high);  
        int ninther = median3(a,m1,m2,m3);  
        exchange(a,ninther,low);  
      }  
      
      if(high <= low)  
        return;  
      
      int lt = low;  
      
      int gt = high;  
      
      Comparable<T> pivot = a[low];  
      int i = low + 1;  
      
      
      
      while (i <= gt) {  
        if(lessThan(a[i],pivot)) {  
      
          exchange(a,lt++,i++);  
        }else if(lessThan(pivot,a[i])) {  
          exchange(a,i,gt--);  
        }else{  
          i++;  
        }  
      }  
      
      
      perform(a,low,lt - 1);  
      perform(a,gt + 1,high);  
    }
    

    归并排序:

    private final int cutoff = 8;  
      
      
    @Override  
    public <T> void perform(Comparable<T>[] a) {  
      Comparable<T>[] b = a.clone();  
      perform(b, a, 0, a.length - 1);  
    }  
      
    private <T> void perform(Comparable<T>[] src,Comparable<T>[] dest,int low,int high) {  
      if(low >= high)  
        return;  
      
      
      if(high - low <= cutoff) {  
        SortFactory.createInsertionSort().perform(dest,low,high);  
        return;  
      }  
      
      int mid = low + ((high - low) >>> 1);  
      perform(dest,src,low,mid);  
      perform(dest,src,mid + 1,high);  
      
      
      if(lessThanOrEqual(src[mid],src[mid+1])) {  
        System.arraycopy(src,low,dest,low,high - low + 1);  
      }  
      
      
      merge(src,dest,low,mid,high);  
    }  
      
    private <T> void merge(Comparable<T>[] src,Comparable<T>[] dest,int low,int mid,int high) {  
      
      for(int i = low,v = low,w = mid + 1; i <= high; i++) {  
        if(w > high || v <= mid && lessThanOrEqual(src[v],src[w])) {  
          dest[i] = src[v++];  
        }else {  
          dest[i] = src[w++];  
        }  
      }  
    }
    

    数据太多,递归太深 ->栈溢出?加大Xss?

    数据太多,数组太长 -> OOM?加大Xmx?

    耐心不足,没跑出来.而且要将这么大的文件读入内存,在堆中维护这么大个数据量,还有内排中不断的拷贝,对栈和堆都是很大的压力,不具备通用性。

    sort命令来跑

    sort -n bigdata -o bigdata.sorted

    跑了多久呢?24分钟.

    为什么这么慢?

    粗略的看下我们的资源:

    内存

    jvm-heap/stack,native-heap/stack,page-cache,block-buffer

    数据量很大,函数调用很多,系统调用很多,内核/用户缓冲区拷贝很多,脏页回写很多,io-wait很高,io很繁忙,堆栈数据不断交换至swap,线程切换很多,每个环节的锁也很多.

    总之,内存吃紧,问磁盘要空间,脏数据持久化过多导致cache频繁失效,引发大量回写,回写线程高,导致cpu大量时间用于上下文切换,一切,都很糟糕,所以24分钟不细看了,无法忍受.

    位图法

    private BitSet bits;  
      
    public void perform(  
        String largeFileName,  
        int total,  
        String destLargeFileName,  
        Castor<Integer> castor,  
        int readerBufferSize,  
        int writerBufferSize,  
        boolean asc) throws IOException {  
      
      System.out.println("BitmapSort Started.");  
      long start = System.currentTimeMillis();  
      bits = new BitSet(total);  
      InputPart<Integer> largeIn = PartFactory.createCharBufferedInputPart(largeFileName, readerBufferSize);  
      OutputPart<Integer> largeOut = PartFactory.createCharBufferedOutputPart(destLargeFileName, writerBufferSize);  
      largeOut.delete();  
      
      Integer data;  
      int off = 0;  
      try {  
        while (true) {  
          data = largeIn.read();  
          if (data == null)  
            break;  
          int v = data;  
          set(v);  
          off++;  
        }  
        largeIn.close();  
        int size = bits.size();  
        System.out.println(String.format("lines : %d ,bits : %d", off, size));  
      
        if(asc) {  
          for (int i = 0; i < size; i++) {  
            if (get(i)) {  
              largeOut.write(i);  
            }  
          }  
        }else {  
          for (int i = size - 1; i >= 0; i--) {  
            if (get(i)) {  
              largeOut.write(i);  
            }  
          }  
        }  
      
        largeOut.close();  
        long stop = System.currentTimeMillis();  
        long elapsed = stop - start;  
        System.out.println(String.format("BitmapSort Completed.elapsed : %dms",elapsed));  
      }finally {  
        largeIn.close();  
        largeOut.close();  
      }  
    }  
      
    private void set(int i) {  
      bits.set(i);  
    }  
      
    private boolean get(int v) {  
      return bits.get(v);  
    }
    

    nice!跑了190秒,3分来钟.

    以核心内存4663M/32大小的空间跑出这么个结果,而且大量时间在用于I/O,不错.问题是,如果这个时候突然内存条坏了1、2根,或者只有极少的内存空间怎么搞?

    外部排序

    该外部排序上场了.
    外部排序干嘛的?

    内存极少的情况下,利用分治策略,利用外存保存中间结果,再用多路归并来排序;

    map-reduce的嫡系.


    1.分

    内存中维护一个极小的核心缓冲区memBuffer,将大文件bigdata按行读入,搜集到memBuffer满或者大文件读完时,对memBuffer中的数据调用内排进行排序,排序后将有序结果写入磁盘文件bigdata.xxx.part.sorted.

    循环利用memBuffer直到大文件处理完毕,得到n个有序的磁盘文件:

    2.合

    现在有了n个有序的小文件,怎么合并成1个有序的大文件?

    把所有小文件读入内存,然后内排?
    (⊙o⊙)…
    no!

    利用如下原理进行归并排序:

    我们举个简单的例子:

    文件1:3,6,9
    文件2:2,4,8
    文件3:1,5,7

    第一回合:
    文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
    文件2的最小值:2,排在文件2的第1行
    文件3的最小值:1,排在文件3的第1行
    那么,这3个文件中的最小值是:min(1,2,3) = 1
    也就是说,最终大文件的当前最小值,是文件1、2、3的当前最小值的最小值,绕么?
    上面拿出了最小值1,写入大文件.

    第二回合:

    文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
    文件2的最小值:2,排在文件2的第1行
    文件3的最小值:5,排在文件3的第2行
    那么,这3个文件中的最小值是:min(5,2,3) = 2
    将2写入大文件.

    也就是说,最小值属于哪个文件,那么就从哪个文件当中取下一行数据.(因为小文件内部有序,下一行数据代表了它当前的最小值)

    最终的时间,跑了771秒,13分钟左右.

    less bigdata.sorted.text  
    ...  
    9999966  
    9999967  
    9999968  
    9999969  
    9999970  
    9999971  
    9999972  
    9999973  
    9999974  
    9999975  
    9999976  
    9999977  
    9999978  
    ...
    

    来源:https://www.cnblogs.com/foreach-break

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