mysql出现ERROR : (2006, 'MySQL server has gone away') 的问题意思就是指client和MySQL server之间的链接断开了。
造成这样的原因一般是sql操作的时间过长，或者是传送的数据太大(例如使用insert ... values的语句过长， 这种情况可以通过修改max_allowed_packed的配置参数来避免，也可以在程序中将数据分批插入)。
产生这个问题的原因有很多，总结下网上的分析：
原因一. MySQL 服务宕了
判断是否属于这个原因的方法很简单，进入mysql控制台，查看mysql的运行时长
mysql> show global status like 'uptime';
+---------------+---------+
| Variable_name | Value |
+---------------+---------+
| Uptime | 3414707 |
+---------------+---------+
1 row in set或者查看MySQL的报错日志，看看有没有重启的信息；如果uptime数值很大，表明mysql服务运行了很久了。说明最近服务没有重启过。如果日志没有相关信息，也表名mysql服务最近没有重启过，可以继续检查下面几项内容。
原因二. mysql连接超时
即某个mysql长连接很久没有新的请求发起，达到了server端的timeout，被server强行关闭。
此后再通过这个connection发起查询的时候，就会报错server has gone away
（大部分PHP脚本就是属于此类）
mysql> show global variables like '%timeout';
+----------------------------+----------+
| Variable_name | Value |
+----------------------------+----------+
| connect_timeout | 10 |
| delayed_insert_timeout | 300 |
| innodb_lock_wait_timeout | 50 |
| innodb_rollback_on_timeout | OFF |
| interactive_timeout | 28800 |
| lock_wait_timeout | 31536000 |
| net_read_timeout | 30 |
| net_write_timeout | 60 |
| slave_net_timeout | 3600 |
| wait_timeout | 28800 |
+----------------------------+----------+
10 rows in set
wait_timeout 是28800秒，即mysql链接在无操作28800秒后被自动关闭
原因三. mysql请求链接进程被主动kill
这种情况和原因二相似，只是一个是人为一个是MYSQL自己的动作
mysql> show global status like 'com_kill';
+---------------+-------+
| Variable_name | Value |
+---------------+-------+
| Com_kill | 21 |
+---------------+-------+
1 row in set原因四. Your SQL statement was too large.
当查询的结果集超过 max_allowed_packet 也会出现这样的报错。定位方法是打出相关报错的语句。用select * into outfile 的方式导出到文件，查看文件大小是否超过 max_allowed_packet ，如果超过则需要调整参数，或者优化语句。
mysql> show global variables like 'max_allowed_packet';
+--------------------+---------+
| Variable_name | Value |
+--------------------+---------+
| max_allowed_packet | 1048576 |
+--------------------+---------+
1 row in set (0.00 sec)
修改参数：
mysql> set global max_allowed_packet=1024*1024*16;
mysql> show global variables like 'max_allowed_packet';
+--------------------+----------+
| Variable_name | Value |
+--------------------+----------+
| max_allowed_packet | 16777216 |
+--------------------+----------+
1 row in set (0.00 sec)
应用程序长时间的执行批量的MYSQL语句。执行一个SQL，但SQL语句过大或者语句中含有BLOB或者longblob字段。比如，图片数据的处理。都容易引起MySQL server has gone away。
今天遇到类似的情景，MySQL只是冷冷的说：MySQL server has gone away。
大概浏览了一下，主要可能是因为以下几种原因：
一种可能是发送的SQL语句太长，以致超过了max_allowed_packet的大小，如果是这种原因，你只要修改my.cnf，加大max_allowed_packet的值即可。
还有一种可能是因为某些原因导致超时，比如说程序中获取数据库连接时采用了Singleton的做法，虽然多次连接数据库，但其实使用的都是同一个连接，而且程序中某两次操作数据库的间隔时间超过了wait_timeout（SHOW STATUS能看到此设置），那么就可能出现问题。最简单的处理方式就是把wait_timeout改大，当然你也可以在程序里时不时顺手mysql_ping()一下，这样MySQL就知道它不是一个人在战斗。
解决MySQL server has gone away
1、应用程序长时间的执行批量的MYSQL语句。最常见的就是采集或者新旧数据转化。
解决方案：
在my.cnf文件中添加或者修改以下两个变量：
wait_timeout=2880000
interactive_timeout = 2880000 关于两个变量的具体说明可以google或者看官方手册。如果不能修改my.cnf，则可以在连接数据库的时候设置CLIENT_INTERACTIVE，比如：
sql = "set interactive_timeout=24*3600";
mysql_real_query(...)
2、执行一个SQL，但SQL语句过大或者语句中含有BLOB或者longblob字段。比如，图片数据的处理
解决方案：
在my.cnf文件中添加或者修改以下变量：
max_allowed_packet = 10M(也可以设置自己需要的大小) ，max_allowed_packet参数的作用是，用来控制其通信缓冲区的最大长度。