还是先吐个槽，网上都都是转载抄袭，基本上就那么一两篇文章，说的还不清楚....
正文：
其实说白了，从两个方法本身就能看出来端倪。
我们先把jQuery看成了一个类，这样好理解一些。
jQuery.extend()，是扩展的jQuery这个类。
假设我们把jQuery这个类看成是人类，能吃饭能喝水能跑能跳，现在我们用jQuery.extend这个方法给这个类拓展一个能唱歌的技能。这样的话，不论是男人，女人，xx人.....等能继承这个技能（方法）了。
我们这样写：
jQuery.extend({ liu: function(){ alert('liu'); } });
然后：$.liu();这样就能打印出来”liu“这个字符串
测试代码如下：
<!doctype html> <html lang="zh-cmn-Hans-CN"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>Document</title> <script type="text/javascript" src="jquery-2.1.1.js"></script> <script type="text/javascript"> ;(function($) { $.extend({ liu: function(){ alert('liu'); } }); })(jQuery); </script> <script type="text/javascript"> $(document).ready(function() { $.liu(); }); </script> </head> <body></body> </html>
这说明啥啊，这说明.liu()变成了jQuery这个类本身的方法（object）嘛。他现在能”唱歌“了。
我们再看看jQuery.fn.extend()这个方法。
从字面理解嘛，这个拓展的是jQuery.fn的方法。
jQuery.fn是啥玩意呢？
源码里是这么写的：
jQuery.fn = jQuery.prototype = { init: function( selector, context ) {//…. //…… };
哦，原来jQuery.fn=jQuery.prototype，就是原型啊。
那就一目了然了，jQuery.fn.extend拓展的是jQuery对象（原型的）的方法啊！
对象是啥？就是类的实例化嘛，例如
$("#abc")
这个玩意就是一个实例化的jQuery对象嘛。
那就是说，jQuery.fn.extend拓展的方法，你得用在jQuery对象上面才行啊！他得是张三李四王五痳六这些实例化的对象才能用啊。
说白了就是得这么用（假设xyz()是拓展的方法）：
$('selector').xyz();
你要是这么用$.xyz()；是会出错误滴。
例子源码如下：
<!doctype html> <html lang="zh-cmn-Hans-CN"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>Document</title> <script type="text/javascript" src="jquery-2.1.1.js"></script> <script type="text/javascript"> ;(function($) { $.fn.extend({ liu: function(){ alert('liu'); } }); })(jQuery); </script> <script type="text/javascript"> $(document).ready(function() { $('div').liu(); }); </script> </head> <body> <div></div> </body> </html>
和上边的区别区别一目了然吧？
其实吧，jQuery.extend()这个方法，主要是用来拓展个全局函数啦，例如$.ajax()这种，要不就是拓展个选择器啦，例如$.fn.each()，当选择器用。
大部分插件都是用jQuery.fn.extend()。