用遗传算法进行特征选择

曾经的我只知道，这台电脑缺一个好的显卡；现在的我还知道，原来这台电脑还缺一个好的CPU。
——作者

遗传算法介绍

源码

一、算法

1.初始化种群

一个种群有好几条染色体
一条染色体大概长这样：[0,1,1,0,0,1,0,1,1,0,1]
1表示选择这个特征，0表示不选择这个特征
染色体的长度为特征的个数
初始化时0和1随机选，生成一个个染色体

2.评估种群中个体适应度

用交叉验证cross_val_score(个体,y)的结果作为适应度

3.选择

每条染色体的适应度不同，被选择的概率不同
用轮盘赌选择
先生成与染色体个数（种群大小）相同的随机数
然后再一个个看这些随机数落在哪个染色体的范围内
例：
染色体的选择概率：①[0,0.3), ②[0.3,0.6), ③[0.6,0.7), ④[0.7,0.9), ⑤[0.9,1]
生成的随机数：0.2, 0.4, 0.5, 0.78, 0.8
被选中的染色体：①, ②, ②, ④, ④

4.交叉

若第i条与第i+1条染色体发生交叉
随机选择交叉点，然后交叉
例:
第6条与第7条染色体发生交叉
第6条染色体：[1,0,0,1,0]
第7条染色体：[(color{red}{0}),(color{red}{1}),(color{red}{0}),(color{red}{1}),(color{red}{1})]
随机选择交叉点3
第6条染色体：[1,0,0,(color{red}{1}),(color{red}{1})]
第7条染色体：[(color{red}{0}),(color{red}{1}),(color{red}{0}),1,0]

5.变异

若第i条染色体发生变异
随机选择一个变异点，然后取反
0变1，1变0

二、效果

没有进行特征选择时，交叉验证的得分是0.6257839721254356

用遗传算法进行特征选择：

前面几条输出：

0
[0, [1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1], 0.6919860627177701]
1
[1, [0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0], 0.7265969802555168]
2
[2, [1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0], 0.7225319396051104]
3
[3, [0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0], 0.7170731707317073]
4
[4, [1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0], 0.7176538908246226]

最后几条输出：

94
[94, [0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0], 0.7746806039488966]
95
[95, [0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0], 0.7601626016260162]
96
[96, [0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0], 0.7698025551684088]
97
[97, [0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0], 0.7507549361207898]
98
[98, [0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0], 0.7600464576074332]
99
[99, [0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0], 0.7555168408826946]

三、逼逼几句

这个时间复杂度和空间复杂度好好好好高，运行的时候风扇呼呼转，电量哗哗掉
更多：用模拟退火算法进行特征选择

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参考：https://github.com/cainsmile/GA_for_Feature_Selection