还是bilibili课程笔记 https://b23.tv/FvgWGP
P6 dicom转档与pre
1 看原始数据
1)软件 radiAnt
https://www.radiantviewer.com/c/how-to-install-radiant-dicom-viewer-on-macos/
这是软件官网,里面有一个安装教程,跟着安装顺序下需要的软件并安装
注:这个软件有个激活license的界面,直接点next可以先用软件,网上有教程说过期了重安
2)看数据,怎么看,包括哪些内容
视频讲的很清楚 在p6 8min左右
2 数据转换
目的:把source data 转换成SPM可以分析的数据(analysis data)
这是第二步数据转换了,上一个笔记里已经有一步数据转换了,将.IMA转成.dcm,链接如下:
https://editor.csdn.net/md/?articleId=109509832
整体类似:raw data —— source data —— analysis data 【个人理解,敬请指正】
所需软件 MRIConvert
(也有教用MRIcro这个软件转的,但是听完感觉比MRIConvert 复杂,略,感兴趣可以看p6 40min左右)
MRIConvert 软件网址:按电脑系统下载安装
https://lcni.uoregon.edu/downloads/mriconvert
直接点击.app 就能打开,不用把.pkg拉到applications
1、 软件打开后,窗口上半部分,选择数据文件(输入),中间可以选择转成什么格式,拉开如下,选择 Analyze 7.5
2、 analysis 7.5 —— options (按需勾选)
3、选择folder——选择输出路径——convert all
数据转换结果—— analysis format
每个文件夹含三类文件
1、txt 是一些核磁相关的基础信息,写文章可以用到,比如trial number,number of slices
2、.hdr和.img都是成对的,hdr是对应的img的一些参数信息,往往比较小1k(必须要成对处理,比如删都删)
注:img和nifti两种格式,都可以用于spm分析,只是转换类型方式不一样。
IMG的来源是用MRIconvert软件里选择Analyze 7.5转出来的
nifti的来源是用MRIconvert软件里选择nifti转出来的
参考链接:https://blog.csdn.net/weixin_44669441/article/details/109718580