• 学习笔记253—fmri_2 dicom转档


    还是bilibili课程笔记 https://b23.tv/FvgWGP
    P6 dicom转档与pre
    1 看原始数据
    1)软件 radiAnt
    https://www.radiantviewer.com/c/how-to-install-radiant-dicom-viewer-on-macos/
    这是软件官网,里面有一个安装教程,跟着安装顺序下需要的软件并安装
    注:这个软件有个激活license的界面,直接点next可以先用软件,网上有教程说过期了重安
    2)看数据,怎么看,包括哪些内容
    视频讲的很清楚 在p6 8min左右

    2 数据转换
    目的:把source data 转换成SPM可以分析的数据(analysis data)
    这是第二步数据转换了,上一个笔记里已经有一步数据转换了,将.IMA转成.dcm,链接如下:
    https://editor.csdn.net/md/?articleId=109509832
    整体类似:raw data —— source data —— analysis data 【个人理解,敬请指正】
    所需软件 MRIConvert

    (也有教用MRIcro这个软件转的,但是听完感觉比MRIConvert 复杂,略,感兴趣可以看p6 40min左右)
    MRIConvert 软件网址:按电脑系统下载安装
    https://lcni.uoregon.edu/downloads/mriconvert

    直接点击.app 就能打开,不用把.pkg拉到applications

       1、 软件打开后,窗口上半部分,选择数据文件(输入),中间可以选择转成什么格式,拉开如下,选择 Analyze 7.5

    2、 analysis 7.5 —— options (按需勾选)

    3、选择folder——选择输出路径——convert all

    数据转换结果—— analysis format
    每个文件夹含三类文件
    1、txt 是一些核磁相关的基础信息,写文章可以用到,比如trial number,number of slices
    2、.hdr和.img都是成对的,hdr是对应的img的一些参数信息,往往比较小1k(必须要成对处理,比如删都删)
    注:img和nifti两种格式,都可以用于spm分析,只是转换类型方式不一样。
    IMG的来源是用MRIconvert软件里选择Analyze 7.5转出来的
    nifti的来源是用MRIconvert软件里选择nifti转出来的

    参考链接:https://blog.csdn.net/weixin_44669441/article/details/109718580

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/hechangchun/p/16156044.html
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