病毒
无完整细胞结构，含单一核酸（DNA或RNA）型，病毒寄生在活细胞中，掠夺别人的营养生存，危害大，如爱滋病毒，生存在人体免疫细胞，破坏人体自身保护。
细菌
是属于原核型细胞的一种单胞生物，形体微小，结构简单，无成形细胞核、也无核仁和核膜，除核蛋白体外无其他细胞器； 细菌广泛分布于土壤和水中，或者与其他生物共生。人体身上也带有相当多的细菌。据估计，人体内及表皮上的细菌细胞总数约是人体细胞总数的十倍；细菌的营养方式有自营及异营，其中异营的腐生细菌是生态系中重要的分解者，使碳循环能顺利进行。部分细菌会进行固氮作用，使氮元素得以转换为生物能利用的形式。
真菌
是具有真核和细胞壁的生物； 真菌像细菌和微生物一样都是分解者，就是一些分解死亡生物的有机物的生物。真菌将生物分解为各类无机物，使土地肥力增强。还有的真菌用于食物加工，例如酵母菌用于面包等加工，酿酒也需要真菌。 在农业、林业和畜牧业中，真菌又有有害的一面。真菌能引起植物多种病害，从而造成巨大的经济损失。
危害排名
目前所知最厉害的病毒应该是2019新型冠状病毒，但其实对人类威胁最大的还是细菌，因为病毒结构单一，再厉害的病毒在数十代复制之后都会产生变异，有的病毒一旦变异了就没有那么大的威胁了，而细菌呢时时刻刻影响着人类，所以青霉素的发明拯救了数以亿计的生命。
所以给这三者危害排名：细菌>病毒>真菌。但是如果说是致死率：病毒>细菌>真菌。