1、MyISAM
MyISAM 是 MySQL 的 ISAM 扩展格式（MySQL5.5 之前版本的缺省数据库引擎）数据库引擎。除了提供 ISAM 里所没有的索引和字段管理的大量功能，MyISAM 还使用一种表格锁定的机制，来优化多个并发的读写操作，其代价是你需要经常运行 OPTIMIZE TABLE 命令，来恢复被更新机制所浪费的空间。MyISAM 还有一些有用的扩展，例如用来修复数据库文件的 MyISAMCHK 工具和用来恢复浪费空间的 MyISAMPACK 工具。MYISAM 强调了快速读取操作，这可能就是为什么 MySQL 受到了 WEB 开发如此青睐的主要原因：在 WEB 开发中你所进行的大量数据操作都是读取操作。所以，大多数虚拟主机提供商和 INTERNET 平台提供商只允许使用 MYISAM 格式。MyISAM 格式的一个重要缺陷就是不能在表损坏后恢复数据 。
MyISAM 引擎使用注意：必须经常使用 Optimize Table 命令清理空间；必须经常备份所有实时数据。工具有用来修复数据库文件的 MyISAMCHK 工具和用来恢复浪费空间的
MyISAMPACK 工具。不支持事务。不支持外键。数据越多，写操作效率越低。 因为要维护数据和索引信息 。（索引列越多，相对效率越低 。 ）
如果使用该数据库引擎，会生成三个文件：
.frm:表结构信息
.MYD:数据文件
.MYI:表的索引信息
2、InnoDB
InnoDB 数据库引擎都是造就 MySQL 灵活性的技术的直接产品，这项技术就是 MYSQL++API。在使用 MYSQL 的时候，你所面对的每一个挑战几乎都源于 ISAM 和 MyISAM 数据库引擎不支持事务处理（transaction process）也不支持外键。尽管要比 ISAM 和 MyISAM 引擎慢很多，但是 InnoDB 包括了对事务处理和外键的支持，这两点都是MyISAM引擎所没有的。InnoDB是现在的 MySQL（5.5 以上版本）常用版本默认引擎。
MySQL 官方对 InnoDB 是这样解释的：InnoDB 给 MySQL 提供了具有提交、回滚和崩溃恢复能力的事务安全（ACID 兼容）存储引擎。InnoDB 锁定在行级并且也在 SELECT 语句提供一个 Oracle 风格一致的非锁定读，这些特色增加了多用户部署的性能。没有在 InnoDB 中扩大锁定的需要，因为在 InnoDB 中行级锁定适合非常小的空间。InnoDB 也支持 FOREIGN KEY强制。在 SQL 查询中，你可以自由地将 InnoDB 类型的表与其它 MySQL 的表的类型混合起来，甚至在同一个查询中也可以混合。InnoDB 是为处理巨大数据量时的最大性能设计，它的 CPU 效率可能是任何其它基于磁盘的关系数据库引擎所不能匹敌的。
InnoDB 存储引擎被完全与 MySQL 服务器整合，InnoDB 存储引擎为在主内存中缓存数据和索引而维持它自己的缓冲池。InnoDB 存储它的表＆索引在一个表空间中，表空间可以包含数个文件（或原始磁盘分区）。这与 MyISAM 表不同，比如在 MyISAM 表中每个表被存在分离的文件中。InnoDB 表可以是任何尺寸，即使在文件尺寸被限制为 2GB 的操作系统上。在 MySQL5.7 版本中，InnoDB 存储引擎管理的数据文件为两个：分别是 frm,idb 文件。
InnoDB 特点：
1 ）、支持事务
2 ） 、数据多版本读取（ InnoDB+MyISAM+ISAM ）
3 ）、锁定机制的改进
4 ）、实现外键
*********innodb与myisam 区别**********
1. InnoDB 支持事务，MyISAM 不支持，对于 InnoDB 每一条 SQL 语言都默认封装成事务，自动提交，这样会影响速度，所以最好把多条 SQL 语言放在 begin transaction 和 commit 之间，组成一个事务；
2. InnoDB 支持外键，而 MyISAM 不支持。对一个包含外键的 InnoDB 表转为 MYISAM 会失败；
3. InnoDB 是聚集索引，数据文件是和索引绑在一起的，必须要有主键，通过主键索引效率很高。但是辅助索引需要两次查询，先查询到主键，然后再通过主键查询到数据。 因此，主键不应该过大，因为主键太大，其他索引也都会很大。而 MyISAM 是非聚集索引，数据文件是分离的，索引保存的是数据文件的指针。主键索引和辅助索引是独立 的。
4. InnoDB 不保存表的具体行数，执行 select count(*) from table 时需要全表扫描。而MyISAM 用一个变量保存了整个表的行数，执行上述语句时只需要读出该变量即可，速度 很快；
5. Innodb 不支持全文索引，而 MyISAM 支持全文索引，查询效率上 MyISAM 要高；