PHP的buffer是这样的：
输出的字符串 => PHP buffer => 等待输出 => web 服务器的缓冲区 => tcp 缓冲区 => 客户端。过程其实相当的复杂。
大概的工作机制：
bool ob_start ([ callback $output_callback [, int $chunk_size [, bool $erase ]]] ) 这个函数我关键要强调一下第二个参数：
如果可选参数 chunk_size 被赋值了，在任何一个能引起缓冲区的长度等于或超过 chunk_size 的输出操作后，缓冲区都会被刷送。 默认值 0 意味着脚本结束之后，缓冲区会被刷送，其余的特殊值可以将 chunk_size从 1 设定到 4096。
这个参数默认是0.
还有一点，缓冲区是可以嵌套的。这点非常关键。比如你调用了两次ob_start ，就会创建用两个缓冲区。第二次创建的缓冲区，会写入第一次创建的缓冲区，而ob_start 创建的缓冲区，总是会写入output_buffering =ON 时候系统自动创建的缓冲区。
我们再来看一下：ob_end_flush ,这个函数的作用是把最后一次打开的缓冲区关闭掉，并把内容送入下一个缓冲区。如果下一个缓冲区没有，就进入等待输出的状态了。
flush是刷新等待输出的内容去浏览器。前提是内容是等待输出的状态了，而不是在缓冲区中，它不会影响缓冲区的内容。
再来看你的代码：
如果output_buffering = On ，那么系统会默认创建一个缓冲区，这个大小一般是2K. ob_end_flush的内容会进入这个缓冲区，而不会进入输出等待。所以调用flush一点效果都没有。直到脚本结束，PHP送出所有的内容。
如果output_buffering = Off ob_end_flush的内容会进入输出等待状态，这个时候flush一下，内容就能输出了。
当然，这个只是PHP这一端的情况分析。
还会有其他的因数影响最终的输出：
个别web服务器程序，特别是Win32下的web服务器程序，在发送结果到浏览器之前，仍然会缓存脚本的输出，直到程序结束为止。
有些Apache的模块，比如mod_gzip，可能自己进行输出缓存，这将导致flush()函数产生的结果不会立即被发送到客户端浏览器。
甚至浏览器也会在显示之前，缓存接收到的内容。例如 Netscape 浏览器会在接受到换行或 html 标记的开头之前缓存内容，并且在接受到 </table> 标记之前，不会显示出整个表格。
一些版本的 Microsoft Internet Explorer 只有当接受到的256个字节以后才开始显示该页面，所以必须发送一些额外的空格来让这些浏览器显示页面内容。