方法2
（很妥协，很纠结的办法）
进入mysql server
在mysql 命令行中运行
set global max_allowed_packet = 2*1024*1024*10
然后关闭掉这此mysql server链接，再进入。
show VARIABLES like '%max_allowed_packet%';
查看下max_allowed_packet是否编辑成功
经验总结：
在很多台机器上用方法一都没问题，但2011年11月14日遇到一台机器死活都不成功，
使用命令行方式：set global max_allowed_packet = 16M;
也不行，但使用
set global max_allowed_packet = 2*1024*1024*10;
成功了，很是郁闷
问题终于找出来了，不是方法的问题，是设置完成后要把命令行退出重新登录查看，看来系统变量的值在登录后会缓存。但在这台机器上使用配置INI文件。