医疗机构的门户网站通常包含以下主要功能：
其中，信息发布类栏目和医患交互类栏目都可以在CMS上进行定制实现。Windows Azure Web Site Gallery中的CMS系统完全可以满足需求，甚至几乎都不需要写代码。医患交互是一个比较宽泛的主题，可以融入Web 2.0和SNS元素，在国外比较盛行。但是，传统的Web 2.0和SNS对国内医疗行业而言是无效的，只是"看上去很美"而已，并无生存空间。别的不说，现在知名点的医生（专家），一天都忙的像没头苍蝇似的，一天几十、上百个号，平均与每个门诊患者交流的时间都不会超过十分钟。在这种情况下，哪个医护人员还有心思和时间去写博客，发微博呢，更别提在线解答患者提问了。当然，随着新医改的推进，医疗资源分布不均问题将得以有效解决。生活水平不断提高，广大人民群众对于高质量，多元化的医疗保健需求也在急速增长。依托先进的信息化手段，不断开拓新型医疗服务，将成为未来国内每个医疗机构都要面对的挑战。从某种角度来看，深层次、全方位、高效的医患互动将是未来国内医疗信息化领域的发展方向。Healthcare Cloud on Windows Azure会在后续文章中进行探讨。目前看来，貌似只有"投诉与建议"等留言板形式的交互内容还是相对实用一些的。
这里需要说明的一点是：Windows Azure Web Site Gallery中提供的CMS系统都是国外的开源（或商业）产品，与国内的CMS系统相比，在管理、运维、操作、开发等方面会有些差异。但这完全不会掩盖这些系统本身所具备的优秀的特性和功能。Windows Azure Web Site Gallery中所有的CMS系统都支持多语言，所以完全不用担心其默认的英文界面和内容。随着Windows Azure在国内的普及和推广，相信其本地化程度会越来越高，毕竟，微软在这方面一向都做的非常出色。
现阶段，医疗机构可以在门户网站上提供的在线医疗服务内容还非常有限，基本上只有：就医指南，预约挂号，检查结果和检验报告查询三项服务。有些大型的体检中心会提供会员服务和个人体检报告管理服务。在线医疗服务功能需要与医疗机构内现有的医疗信息化系统进行集成和对接。虽然通过对CMS系统进行深度定制开发可以实现功能，但还是建议：将在线医疗服务功能与CMS系统进行分离，只在CMS系统中放置跳转至在线医疗服务系统的链接，具体原因是：
- 很多医疗机构已经自行开发了在线医疗服务系统。只要将原系统迁移到Windows Azure上即可。无需从头做起。
- 在线医疗服务需要与医疗机构现有的医疗信息化系统进行交互，而医疗机构不可能在短期内将所有关键的医疗信息化系统迁移至Windows Azure上。即便技术上是可行的，但实际是完全没有可能的。其中包括政策法规因素，IT基础设施因素等一系列问题。
- 医疗机构的门户网站只是作为承载在线医疗服务的载体之一，在线医疗服务还需要向移动应用和第三方合作伙伴进行扩展。
除信息发布、医疗服务、医患交互三大主要功能以外，医疗机构还可以根据自身的业务需求开发或定制一些特色内容，例如：教学与科研，健康论坛等。