edgeR包是进行RNA-seq数据分析非常常用的一个R包。该包需要输入每个基因关于每个样本的reads数的数据,每行对应一个基因,每一列对应一个样本。
安装edgeR
先启动R,然后运行下面代码:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("edgeR")
使用edgeR
library(edgeR)
REF
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/edgeR.html
https://blog.csdn.net/hzau_yang/article/details/78118257