文件关联损坏常常是计算机病毒造成的，目前网络上有很多相关修复工具，相对来说，System Repair Engineer 支持的修复格式是比较齐全的，这个工具可以在http://www.kztechs.com/sreng/download.html （下载地址：http://www.kztechs.com/sreng/sreng2.zip） 免费下载到。如果你需要修复的是EXE文件关联，需要将System Repair Engineer的可执行文件改名为SREng.com ,否则你无法启动System Repair Engineer。 这个工具我没用过，不过既然有人说了，那肯定就可以用吧，呵呵
下面是清除病毒的，我知道这办法很笨，（网上工具很多）可以也可以应急来用嘛，呵呵
我是上面这个方法实现的。
我本来在优化机子，这几天机子反应很慢。借助第三方软件在优化，我没有备份的习惯。看到扫描出来的没用文件或其它，就总是直接删。这次不好，机子重启 后，机子上所有的exe文件一运行，全成记事本了。天啊，连注册表都打不开了。吓了我一跳，我可不想重做系统啊。怎么办？
手工修改方法(1)：
打开注册表编辑器把HKEY_CLASSES_ROOT\exefile\shell\open\command的默认值改为"%1"%*（把系统目录下regedit.exe文件后缀名改成.com或者.pif或者.scr，就可以使用注册表编辑器了）。
手工修改方法(2)：
在“带命令行提示的安全模式”下输入：assoc<空格>.exe=exefile<回车>，屏幕上将显示“.exe= exefile”。现在关闭命令提示符窗口，按Ctrl+Alt+Del组合键调出“Windows安全”窗口，按“关机”按钮后选择“重新启动”选项， 按正常模式启动Windows后，所有的EXE文件都能正常运行了！
根据第一种方法查注册表，一看根本没变化，应该是正常的。经试验，第二种方法此时有效。补充一下，在正常模式下，可以搜索到command.com程序，双击打开DOS窗口，执行“assoc<空格>.exe=exefile”，重启后即恢复正常。
我查啊查终于知道怎么改回来了
手工恢复EXE文件关联方法介绍
有次朋友电脑中了病毒，笔者去看了一下，是个QQ病毒，由于挺长时间没有上网搜集病毒方面消息了，笔者对这些病毒的特性也不甚了解。笔者先打开 “进程管理器”，将几个不太熟悉的程序关闭掉，但刚关掉一个，再去关闭另外一个时，刚才关闭的那个马上又运行了。没办法，笔者决定从注册表里先把启动项删 除后，再重启试试，结果，笔者刚把那些启动项删除，然后刷新一下注册表，那些启动项又还原了，看来一般的方法是行不通了，上网下载专杀工具后，仍然不能杀 掉。笔者知道这是因为病毒正在运行，所以无法删除。
由于这台电脑只有一个操作系统，也没办法在另一个系统下删除这些病毒，这时怎么办呢？如果大家也遇到这种情况时，笔者向大家推荐一种方法。
第一步：在“开始→运行”中输入CMD，打开“命令提示符”窗口。
第二步：输入ftype exefile=notepad.exe %1，这句话的意思是将所有的EXE文件用“记事本”打开。这样原来的病毒就无法启动了。
第三步：重启电脑，你会看见打开了许多“记事本”。当然，这其中不仅有病毒文件，还有一些原来的系统文件，比如：输入法程序。
第四步：右击任何文件，选择“打开方式”，然后点击“浏览”，转到Windows\System32下，选择cmd.exe，这样就可以再次打开“命令提示符”窗口。
第五步：运行ftype exefile="%1" %*，将所有的EXE文件关联还原。现在运行杀毒软件或直接改回注册表，就可以杀掉病毒了。
第六步：在每一个“记事本”中，点击菜单中的“文件→另存为”，就可看到了路径以及文件名了。找到病毒文件，手动删除即可，但得小心，必须确定那是病毒才能删除。建议将这些文件改名并记下，重启后，如果没有病毒作怪，也没有系统问题，再进行删除，
◆最后介绍一下Ftype的用法
在Windows中，Ftype命令用来显示及修改不同扩展名文件所关联的打开程序。相当于在注册表编辑器中修改“HKEY_CLASSES_ROOT”项下的部分内容一样。
Ftype的基本使用格式为：Ftype [文件类型]=[打开方式/程序]
比如：像上例中的ftype exefile=notepad.exe %1，表示将所有文件类型为EXE(exefile表示为EXE类型文件)的文件都通过“记事本”程序打开，后面的%1表示要打开的程序本身(就是双击时的那个程序)。
ftype exefile="%1" %*则表示所有EXE文件本身直接运行(EXE 可以直接运行，所以用表示程序本身的%1即可)，后面的%*则表示程序命令后带的所有参数(这就是为什么EXE文件可以带参数运行的原因)。
通常都是用办法1，可是注册表里往往就是那个，根本就没变，那就说明你的EXE关联还存在，需要修复。
这样做
随便打开个文件夹—>工具—>文件夹选项—>文件类型，找到EXE。重新关联下，如果没有，就新建个，新建 时，关联找不到，那就随便写个。然后，这时，“还原”按钮就可用了。点下它，就可以恢复了。（前面不是说它还存在吗？只是不知那出错了，这样一还原就修复 了，呵呵）
另：修复文件关联损坏
文件关联损坏常常是计算机病毒造成的，目前网络上有很多相关修复工具，相对来说，System Repair Engineer 支持的修复格式是比较齐全的，这个工具可以在http://www.kztechs.com/sreng/download.html （下载地址：http://www.kztechs.com/sreng/sreng2.zip） 免费下载到。如果你需要修复的是EXE文件关联，需要将System Repair Engineer的可执行文件改名为SREng.com ,否则你无法启动System Repair Engineer。 这个工具我没用过，不过既然有人说了，那肯定就可以用吧，呵呵
下面是清除病毒的，我知道这办法很笨，（网上工具很多）可以也可以应急来用嘛，呵呵
手工清除:(仅参考,因为变种较多)
1.删除灰鸽子服务端程序
由于在Windows环境下灰鸽子的服务端是处于运行状态，无法直接删除，所以必须进入纯DOS状态删除，删除命令如下：
cd c:\windows\system
attrib-r-s-h kernel32.exe
attrib-r-s-h notepod.exe
del kernel32.exe
del notepod.exe
还要注意，如果灰鸽子服务端设置了exe 文件关联的话，将会导致注册表编辑器无法运行，所以在删除服务端之前，先将注册表编辑器重命名，以便以后对注册表进行更改，操作命令如下：
ren c:\windows\regedit.exe regedit.com
2.删除注册表中启动键
由于我们改了注册表编辑器名称，所以要打开注册表编辑器应为：打开”开始“菜单”中的“运行”然后输入“regedit.com".启动注册表编 辑器后，依次打开“HKEY—LOCAL—MACHINE\Software\Microsoft\windows\Current Version\Run"，在右边的窗口中删除名称为”Loadwindows"的键值就可以了。
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清除文件关联
灰鸽子可以设置4种文件关联：exe关联，txt关联，ini关联，inf关联，其中exe关联可以和其他三种类型同时存在。
1.解除exe关联：
启动注册表编辑器，然后找到HKEY—CLASSES—ROOT\Exefile\shell\Open\Cpmmand主键，查看起默认的键值是不是系统默认的“%1%*”，如果被修改，则改成默认值.
2.解除txt关联：
打开注册表的HKEY—CLASSES—ROOT\txtfile\shell\open\command主键，其默认值的正常参数应该为“C：\windows\notepad.exe%1",如果不是，请修改为正确数据。
3.解除ini关联：
INI文件的的关联配置保存在注册表HKEY—CLASSES—ROOT\Inffile\shell\Open\Cpmmand主键下，其默值数据也是“C：\windows\notepad.exe%1”，如果被修改的话，也要改回来。
4解除inf关联：
打开注册表的HKEY—CLASSES—ROOT\Inffile\shell\Open\Cpmmand主键，和ini,txt文件关联一样，其默认值也是“C：\windows\notepad.exe%1”，如果被修改，也要立刻改回正确的数据。