前期的调研和源内容的搜索现在已经完成。开始做真正的研究工作了。
现在你可以开始对你找到的源内容做笔记了。因为你已经准备了源内容，所以这个工作应该能够顺利开始。
第一个步骤是定位你找到的源内容并坐下来。无论是在图书挂的桌子上，还是因为源内容可以带回家而在家中处理。确保你已经准备好了源卡片和研究问题。其他需求需要根据你选择做笔记的方法来决定。
高效的使用源
大部分的文章和一部分 书籍，特别是那些从图书馆中的儿童部分的书籍，可能都是可以在一定的时间内从头到尾后完整的读完的。而另外一些书籍，则可能太长了，或者覆盖的主题过多。 在内容过长的书籍中可以通过使用目录来找到和自己的主题相关的内容。当翻到这些页面的时候，浏览一下确保包含自己所需的内容。对于不相关的主题可以直接跳 过，这可以使得你尽快的找到所需的信息。
做笔记的方法
千万要注意，不要在读 书的时候在笔记簿上记录，如果你这样做的话，你将可能陷入到杂乱的描述中，在你写文章的第一个版本的时候完全无用。许多这样做的同学都需要将这些内容剪切 下来，将其按照一定的顺序组合起来，使之有意义。而另外一些同学则没有这样做，因为他们将其写在了页面的两面上。为了避免这种问题，可以使用经过验证的做 笔记的好方法——将笔记记录在索引卡上。
在索引卡上做笔记
当你阅读源内容的时候哦，可以使用 3"x5" 或者 4"x6" 的索引卡来书写下你的文章中可能要用到的信息。第一个要注意的事情是：在每张卡片上只能写下一个 idea 。即使你在一张索引卡上只有很少的几个字，也不要在一张卡片上写下一个新的 idea 。
当你完成一个笔记卡片后，写下源卡片左上角的数字。在这个数字下面写下真正的页数。在右上角则写上几个关于此卡片主题的词语。这些词是描述此卡片的主题词。尽可能的简洁，以后会要用到。
当对一个源卡片做完笔记后，在源卡片上做一个标记，表明已经从此源卡片上找到了重要的信息。这就避免了下次重新回来再度阅读此卡片。
在计算机上做笔记
另外一种记笔记的方式是在电脑上完成。如果要使用这种方法的话，几乎需要将所有的源都可以拿回家，除非你可以将计算机带到图书馆中去。
当你决定选择在计算机上做笔记的时候，想象一下计算机的屏幕就是一张电子卡片。就像你使用索引卡片那样来做笔记。在其中留下空格，用来保证在使用的时候不会混淆。你可能需要在每个卡片之间插入一个换页符。
当决定是否使用卡片或者计算机的时候，记住一个事情：高科技不一定总是更好的。很多同学发现使用低级的方法能够有效地组织，而高科技的计算机则很容易变成剪切和拷贝。在最后，你是知道是用什么方法是最好的唯一个人，选择自己选择的吧。
高效的做笔记
知道什么是做笔记的最好格式是重要的，但是知道在卡片和计算机上写下什么是最基本的。强的笔记是一个好的论文的基础。
不要太多也不要太少
在研究的时候，你将发 现你以前不知道的感兴趣的信息。这很好！你永远可以一直学习，但是现在你的任务是找到可以用于你的论文中有用的信息。不要尝试为所有的可能有用的信息记笔 记，因为可能会找到大量的信息，而其中大部分可能用不到。这在后面管理起来会比较难，所以限制一下用于文章的真正有用的信息。如果你不确定一个信息是否可 以用于文章，则问自己一下研究的问题。写下太多是个易犯的错误，写得太少也是同样的。考虑这样的场景：你在图书馆已经工作了好多个小时，同时你的手已经很 酸了。你现在已经很困了，所以可能想着“我不需要将这些都记录下来，我可以记住”。但是实际上你记不住，特别是在完成所有的阅读和笔记之后。如果你发现了 以后可能用到的信息，就记录下来。如果太累了，就休息一下或者第二天再来。
速记法
一种节省做笔记时间的方法是速记法。在这种方法中，可以使用符号而不是写下所有的单词。下面是一些例子：
w/ => with
w/o => without
wh/ => which
+ => and; also
esp => especially
... => therefore
是否做笔记
当你遇到一个在其他源 中看到的方法或者信息的时候怎么办？是否需要再写一次？你肯定不希望最后是所有的卡片都是同样的内容。另外一方面，知道有多余一个的源中的方法是很重要 的。下面是解决方法：仅仅是将新源的号码写入到已有的笔记中。而如果遇到了一个和已有笔记中矛盾的方法呢？举个例子，在一个源中你看到够摇尾巴表示是高 兴，而在另外一个源中则说够摇尾巴不高兴，甚至有可能是准备攻击。怎样决定哪个源是正确的？现在，将所有的记录下来。在你的文章中，你看你可以使用这些源 来同意你的观点，甚至有可能根据你的研究而得到其中的一种结论。
不用拷贝
听说过抄袭吗？这意味着将别人的内容拷贝，并声称为自己所有。这是偷窃的一种，但实际上对此没有严格的区别。
问题是很多同学在抄 袭，却没有意识到正在这样做。这个问题开始于做笔记阶段。在做笔记的时候，可能只是简单的从源中拷贝。而并没有在这些字词上加上引号表示这是别人的成果。 在写文章草稿的时候，已经记不清这些字词是来自于源中而将其写入到了文章中，这样一直到了最后的文章中。尽管不是想这样做，但是实际上已经是在抄袭了。
避免抄袭的一种方式是 采用意译，使用自己的语言写下想法，而不是完整的拷贝。看看本章中的笔记，可以看到和源中的字词是不一样的。有些笔记甚至没有完整的句子。使用不完整的句 子可以确保你不是抄袭，而且可以节省时间、精力和空间。当你在写文章草稿的时候，当然还是要使用完整的句子。
引用还是不引用
在某些时候，从源中拷贝字词是可以的——只是需要在这些文字周围加上引号，表示这是实际上作者的工作。
从源中引用是可以的，但是不要使用太频繁。只有在阅读你的文章的时候确实需要知道原作者的话的时候才进行引用。下面的两个例子演示了什么时候可以引用“为什么狗要这样做”的源。
“狗的大脑不能学习字词，狗的嘴巴不能说话，所以狗也不会学习说话。”
当为这段文章做笔记的时候，可以采用意译的方式，而没有必要引用。下面是个例子：
“狗不能说话——大脑和嘴巴都不是为语言准备的。”
而下面的话则可能需要引用，因为作者采用了一种容易被记住的方式：
“狗是很好的朋友。但是如果和他交谈，请忘记这点！”
如果你准备引用这句，拷贝到笔记上，然后再加上引号。确保所有的都已经拷贝，包括所有的标点符号。在你的文章中，可能这样结束：
就像 Nancy White 在她的书《为什么狗要这样做》中说的那样，“狗是很好的朋友。但是如果和他交谈，请忘记这点！”。
即使是很好的引用，如果使用太多的话，也会丢失其作用。如果你的文章中一个引用接着一个引用，则读者将质疑哪里找到你自己写的内容。
组织笔记
一旦你完成了所有的源阅读并记录了笔记，你应该拥有了一组并没有特别排序后的卡片（电脑上则是一组屏幕上的笔记）。现在是时候将这些笔记组织起来，并为自己的论文所使用。下面是一些使用的例子，可以使得这些工作为论文所使用。
组织卡片
使用索引卡片做笔记的好处就是可以移动直到按照你想的顺序排列。在电脑上也没有必要剪切和粘贴，而是可以将卡片放置在一次性可以看到的屏幕内。注意一件事情，在整理笔记的时候不要让这些卡片落在了地上。
首先将有着所有同样想法的卡片放在一起。（不必担心这些卡片是否来自同一个源，因为上面都有着编号）。
下一步，将这些卡片按照顺序进行组织。有着六种基本的顺序类型，使用其中的一种或者组合排列卡片。
按照时间先后顺序：按照事件发生的先后顺序。这种排列类型特别适合于那种讨论历史事件或者是人的生平。
按照空间顺序：按照位置或者地点排序。这种排列类型适合于地理相关的课题或者设计一个如花园的主题。
因果关系：讨论了一个事件如何引起另外一个事件的发生。这种组织类型适合于你的论文解释了一个科学过程或者历史事件。
问题的解决方法解释了如何解决问题的多种方法。你可能使用这种组织方式来讨论环境问题，如全球变暖等。
比较与对比讨论了人物事件以及想法之间的相似性和不同。
重要性排序讨论了想法的重要性。可以从最重要的方面开始，而结束于最不重要的事件。
假设你的卡片包含下面的标题：狗吠、摇尾巴、舔面、翻滚、咆哮、露出牙齿。如何阻止这些？下面是一种方式：
卡片是按照不同行为类 型分类的。我知道这些行为之间交流着什么。所以可以使用一种比较与对比的组织方法。首先从声音开始，然后到面部表情，最后到身体语言。同时还会从狗的身体 的一部分到另一部分，这里从耳朵到尾巴最后到身体语言。所以这里组合了两种顺序方法：对比与比较和空间顺序。
当你决定基本的组织方式后，按照其来组织笔记。在这里，你会得到三堆卡片——分别是声音、面部表情和身体语言。将卡片按照顺序放在每一堆中使其有意义。记住你还可以按照其他顺序来移动卡片，直到自己满意为止（卡片之间有着逻辑联系）。
使用纸夹或者橡皮圈来固定这些笔记，然后按照顺序堆起来。在所有的笔记整理完成后，放上一个更大的橡皮圈使得其按照一定的顺序组织。
组织电脑上的卡片
如果你是在电脑上做的 笔记，整理它们和整理索引卡片是类似的。不同在于你可以使用电脑上的剪切粘贴功能代替卡片的移动。方便之处在于可以节省输入——有些时候可以直接将文字转 变为标题而不需要重新输入。不便之处在于没有移动卡片那样方便：可以将卡片重叠起来而只需要看一次，但是如果将很多电脑中的信息放在一个屏幕中则会让人很 困惑。