• Bloom Filter 原理及实现


    题外话:

        很久没写博客了,因为前一段时间过年在家放假,又因为自己保研了,所以一直比较闲。整个假期,基本都在准备毕业设计的相关内容。我毕业设计的方向是关于搜索引擎的,因此,期间阅读了大量相关论文。阅读了很多论文和技术书籍之后,我有几点感触。首先,发现国内很多论文或是书籍只是大量引述其他人的研究结果,自己的独特的见解非常少,一篇文章,70%的内容都是在以介绍为主,感觉发这样的论文是没有什么意义的。相反,国外尤其是像MIT,斯坦福,google之类的领域专家发表很多极其优秀的论文,阅读后给人一种震撼。我之前在网上搜索技术文章或是论文的时候经常绕过英文的,现在发现国外的确有非常多优秀的外文文章,所以无障碍英文阅读能力是提升自己专业水平的重要因素。 我现在已经逐渐习惯阅读外文文章和书籍。

       期间,我还翻译了一篇关于网络信息采集和索引的外文文章,收获很大。不是因为,我从中获得了多少知识,而是在翻译的过程中,我了解了作者精心的设计思路以及严谨的语言表达,也锻炼了我翻译的能力以及组织语言的能力。

    废话不多说了,开始正题,写个在爬虫系统中常用的URL去重经典算法Bloom Filter.

    正题:

    Bloom Filter概念和原理

    引用一篇讲述非常好的文章。http://blog.csdn.net/jiaomeng/article/details/1495500,其博客里还有很多关于Bloom filter比较深入的研究,而且博客篇篇都很精彩,非常值得学习。

                                     Bloom Filter概念和原理

    焦萌 2007127

    Bloom Filter是一种空间效率很高的随机数据结构,它利用位数组很简洁地表示一个集合,并能判断一个元素是否属于这个集合。Bloom Filter的这种高效是有一定代价的:在判断一个元素是否属于某个集合时,有可能会把不属于这个集合的元素误认为属于这个集合(false positive)。因此,Bloom Filter不适合那些“零错误”的应用场合。而在能容忍低错误率的应用场合下,Bloom Filter通过极少的错误换取了存储空间的极大节省。

    集合表示和元素查询

    下面我们具体来看Bloom Filter是如何用位数组表示集合的。初始状态时,Bloom Filter是一个包含m位的位数组,每一位都置为0

    为了表达S={x1, x2,…,xn}这样一个n个元素的集合,Bloom Filter使用k个相互独立的哈希函数(Hash Function),它们分别将集合中的每个元素映射到{1,…,m}的范围中。对任意一个元素x,第i个哈希函数映射的位置hi(x)就会被置为11ik)。注意,如果一个位置多次被置为1,那么只有第一次会起作用,后面几次将没有任何效果。在下图中,k=3,且有两个哈希函数选中同一个位置(从左边数第五位)。   

    在判断y是否属于这个集合时,我们对y应用k次哈希函数,如果所有hi(y)的位置都是11ik),那么我们就认为y是集合中的元素,否则就认为y不是集合中的元素。下图中y1就不是集合中的元素。y2或者属于这个集合,或者刚好是一个false positive

    错误率估计

    前面我们已经提到了,Bloom Filter在判断一个元素是否属于它表示的集合时会有一定的错误率(false positive rate),下面我们就来估计错误率的大小。在估计之前为了简化模型,我们假设kn<m且各个哈希函数是完全随机的。当集合S={x1, x2,…,xn}的所有元素都被k个哈希函数映射到m位的位数组中时,这个位数组中某一位还是0的概率是:

    其中1/m表示任意一个哈希函数选中这一位的概率(前提是哈希函数是完全随机的),(1-1/m)表示哈希一次没有选中这一位的概率。要把S完全映射到位数组中,需要做kn次哈希。某一位还是0意味着kn次哈希都没有选中它,因此这个概率就是(1-1/m)的kn次方。令p = e-kn/m是为了简化运算,这里用到了计算e时常用的近似:

    ρ为位数组中0的比例,则ρ的数学期望E(ρ)= p’。在ρ已知的情况下,要求的错误率(false positive rate)为:

    (1-ρ)位数组中1的比例,(1-ρ)k就表示k次哈希都刚好选中1的区域,即false positive rate。上式中第二步近似在前面已经提到了,现在来看第一步近似。p’只是ρ的数学期望,在实际中ρ的值有可能偏离它的数学期望值。M. Mitzenmacher已经证明[2] ,位数组中0的比例非常集中地分布在它的数学期望值的附近。因此,第一步的近似得以成立。分别将pp’代入上式中,得:

     

    相比p’f’,使用pf通常在分析中更为方便。

    最优的哈希函数个数

    既然Bloom Filter要靠多个哈希函数将集合映射到位数组中,那么应该选择几个哈希函数才能使元素查询时的错误率降到最低呢?这里有两个互斥的理由:如果哈希函数的个数多,那么在对一个不属于集合的元素进行查询时得到0的概率就大;但另一方面,如果哈希函数的个数少,那么位数组中的0就多。为了得到最优的哈希函数个数,我们需要根据上一小节中的错误率公式进行计算。

    先用pf进行计算。注意到f = exp(k ln(1 − e−kn/m)),我们令g = k ln(1 − e−kn/m),只要让g取到最小,f自然也取到最小。由于p = e-kn/m,我们可以将g写成

    根据对称性法则可以很容易看出当p = 1/2,也就是k = ln2· (m/n)时,g取得最小值。在这种情况下,最小错误率f等于(1/2) (0.6185)m/n。另外,注意到p是位数组中某一位仍是0的概率,所以p = 1/2对应着位数组中0和1各一半。换句话说,要想保持错误率低,最好让位数组有一半还空着。

    需要强调的一点是,p = 1/2时错误率最小这个结果并不依赖于近似值pf。同样对于f’ = exp(k ln(1 − (1 − 1/m)kn))g’ = k ln(1 − (1 − 1/m)kn)p’ = (1 − 1/m)kn,我们可以将g’写成

     

    同样根据对称性法则可以得到当p’ = 1/2时,g’取得最小值。

    位数组的大小

    下面我们来看看,在不超过一定错误率的情况下,Bloom Filter至少需要多少位才能表示全集中任意n个元素的集合。假设全集中共有u个元素,允许的最大错误率为є,下面我们来求位数组的位数m

    假设X为全集中任取n个元素的集合,F(X)是表示X的位数组。那么对于集合X中任意一个元素x,在s = F(X)中查询x都能得到肯定的结果,即s能够接受x。显然,由于Bloom Filter引入了错误,s能够接受的不仅仅是X中的元素,它还能够є (u - n)false positive。因此,对于一个确定的位数组来说,它能够接受总共n + є (u - n)个元素。在n + є (u - n)个元素中,s真正表示的只有其中n个,所以一个确定的位数组可以表示

    个集合。m位的位数组共有2m个不同的组合,进而可以推出,m位的位数组可以表示

       

    个集合。全集中n个元素的集合总共有

    个,因此要让m位的位数组能够表示所有n个元素的集合,必须有

    即:

    上式中的近似前提是nєu相比很小,这也是实际情况中常常发生的。根据上式,我们得出结论:在错误率不大于є的情况下,m至少要等于n log2(1/є)才能表示任意n个元素的集合。

    上一小节中我们曾算出当k = ln2· (m/n)时错误率f最小,这时f = (1/2)= (1/2)mln2 / n。现在令fє,可以推出

    这个结果比前面我们算得的下界n log2(1/є)大了log 1.44倍。这说明在哈希函数的个数取到最优时,要让错误率不超过єm至少需要取到最小值的1.44倍。

    总结

    在计算机科学中,我们常常会碰到时间换空间或者空间换时间的情况,即为了达到某一个方面的最优而牺牲另一个方面。Bloom Filter在时间空间这两个因素之外又引入了另一个因素:错误率。在使用Bloom Filter判断一个元素是否属于某个集合时,会有一定的错误率。也就是说,有可能把不属于这个集合的元素误认为属于这个集合(False Positive),但不会把属于这个集合的元素误认为不属于这个集合(False Negative)。在增加了错误率这个因素之后,Bloom Filter通过允许少量的错误来节省大量的存储空间。

    自从Burton Bloom70年代提出Bloom Filter之后,Bloom Filter就被广泛用于拼写检查和数据库系统中。近一二十年,伴随着网络的普及和发展,Bloom Filter在网络领域获得了新生,各种Bloom Filter变种和新的应用不断出现。可以预见,随着网络应用的不断深入,新的变种和应用将会继续出现,Bloom Filter必将获得更大的发展。

    参考资料

    [1] A. Broder and M. Mitzenmacher. Network applications of bloom filters: A survey. Internet Mathematics, 1(4):485–509, 2005.

    [2] M. Mitzenmacher. Compressed Bloom Filters. IEEE/ACM Transactions on Networking 10:5 (2002), 604—612.

    [3] www.cs.jhu.edu/~fabian/courses/CS600.624/slides/bloomslides.pdf

    [4] http://166.111.248.20/seminar/2006_11_23/hash_2_yaxuan.ppt

     
    C++代码实现:
    bloom类简单的实现了,add和check操作。 有关更强大的扩展功能,可以参考Google code里面的一个bloom filter库,它支持了有关集合的相关操作。
     1 /*
    2 * bloom.h
    3 *
    4 * Created on: 2012-2-22
    5 * Author: xiaojay
    6 */
    7
    8 #ifndef BLOOM_H_
    9 #define BLOOM_H_
    10 #include <vector>
    11 #include "hashFun.h"
    12
    13 class Bloom
    14 {
    15 public :
    16 Bloom(int size , std::vector<HashFun*> hashfunclist );
    17 ~Bloom();
    18 void add(const char * text);
    19 bool check(const char * text);
    20
    21 private :
    22 const static int CHARBITSIZE = 8;
    23 int size;
    24 char * arr;
    25 std::vector<HashFun*> hashfunclist;
    26 inline void setbit(long pos);
    27 inline bool getbit(long pos);
    28 };
    29
    30 #endif /* BLOOM_H_ */
    31
    32 #include"bloom.h"
    33 #include<assert.h>
    34
    35 Bloom::Bloom(int size , std::vector<HashFun*> hashfunclist)
    36 {
    37 assert(hashfunclist.size()>0);
    38 this->size = size;
    39 this->hashfunclist = hashfunclist;
    40 this->arr = new char [size];
    41 }
    42
    43 Bloom::~Bloom()
    44 {
    45 if(this->arr!=NULL)
    46 {
    47 delete this->arr;
    48 }
    49 }
    50
    51 void Bloom::add(const char * text)
    52 {
    53 int nfunc = hashfunclist.size();
    54 long code = 0;
    55 for(int i=0;i<nfunc;i++)
    56 {
    57 code = hashfunclist.at(i)->gethashval(text);
    58
    59 if(code/CHARBITSIZE>size) return;
    60 else
    61 {
    62 setbit(code);
    63 }
    64 }
    65 }
    66
    67 bool Bloom::check(const char * text)
    68 {
    69 int nfunc = hashfunclist.size();
    70 long code = 0;
    71 for (int i=0;i<nfunc;i++)
    72 {
    73 code = hashfunclist.at(i)->gethashval(text);
    74 if(code/CHARBITSIZE>size) return false;
    75 else
    76 {
    77 if getbit(code) continue;
             else return false;
    78 }
    79 }
        return true;
    80 }
    81
    82 inline void Bloom::setbit(long code)
    83 {
    84 arr[code/CHARBITSIZE] |= (1<<(code%CHARBITSIZE));
    85 }
    86
    87 inline bool Bloom::getbit(long code)
    88 {
    89 if(!(arr[code/CHARBITSIZE] & (1<<(code%CHARBITSIZE))))
    90 {
    91 return false;
    92 }
    93 return true;
    94 }
     
    由于hash函数的数量以及类型都不确定,所以我们创建一个抽象类HashFun,自定义的hash函数需要继承并实现其HashFun的gethashval方法。
    #ifndef HASHFUN_H_
    #define HASHFUN_H_

    class HashFun
    {
    public :
    virtual long gethashval(const char * key) = 0;
    };

    #endif /* HASHFUN_H_ */
     
    最后我们写个简单的demo,测试一下。
    首先我们自定义两个hash函数HashFunA,HashFunB。
    #include "hashFun.h"

    class HashFunA : public HashFun
    {
    public:
    virtual long gethashval(const char * key)
    {
    unsigned int h=0;
    while(*key) h^=(h<<5)+(h>>2)+(unsigned char)*key++;
    return h%80000;
    }
    };


    #include"hashFun.h"

    class HashFunB : public HashFun
    {
    public:
    virtual long gethashval(const char * key)
    {
    unsigned int h=0;
    while(*key) h=(unsigned char)*key++ + (h<<6) + (h<<16) - h;
    return h%80000;
    }
    };
    Main函数:
    #include<iostream>
    #include<stdio.h>
    #include"hashFunA.h"
    #include"hashFunB.h"
    #include"bloom.h"
    #include<vector>
    using namespace std;

    int main()
    {
    /*
    * Create two hash functions
    */
    HashFunA *funa = new HashFunA();
    HashFunB * funb = new HashFunB();
    vector<HashFun*> hashfunclist;
    hashfunclist.push_back(funa);
    hashfunclist.push_back(funb);

    /*
    * Create Bloom object with two parameters :
    * size of the store array and list of hash functions
    */
    Bloom bloom(10000,hashfunclist);

    ///Add some words to bloom filter
    bloom.add("hello");
    bloom.add("world");
    bloom.add("ipad");
    bloom.add("iphone4");
    bloom.add("ipod");
    bloom.add("apple");
    bloom.add("banana");
    bloom.add("hello");

    /*
    * Test
    */
    char word[20];
    while(true)
    {
    cout<<"Please input a word : "<<endl;
    cin>>word;
    if(bloom.check(word))
    {
    cout<<"Word :"<<word<<" has been set in bloom filter."<<endl;
    }
    else
    {
    cout<<"Word :"<<word<<" not exist !" <<endl;
    }
    }

    return 0;
    }
     
    总结:
      Bloom Filter的基本实现很简单,但是其原理和思路是非常出色的。这个可以应用到URL去重或是某些缓存系统上。在很多面试题里面,也会出现类似大数据量下去重或是筛选的问题,采用Bloom Filter算法就可以很轻松的解决了。
     
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