本周最新文献速递
今天有点忙,但文献分享不能落下,因此先介绍两篇吧。
一、不显著,也可以在高分杂志讲故事
文献题目: Genetic Regulation of Atherosclerosis-Relevant Phenotypes in Human Vascular Smooth Muscle Cells
不想看英文题目: 动脉粥样硬化相关表型在血管平滑肌细胞的遗传调控
杂志和影响因子: Circ Res (14.467, 1区)
样本量: 151位多祖先来源的个体 (118 位男性和 33 位女性)
分析方法: 对12个动脉粥样硬化相关表型进行关联分析,下载公众数据库冠状动脉疾病易感位点,取二者的重合显著位点(P<0.05),进行注释,挑选可靠的显著位点进行后续的功能验证。
结论:
1)关联分析结果发现有三个位点与钙化表型相关,1个位点与增值表型相关。
2)使用163个冠状动脉疾病的易感位点进行多基因风险得分的计算,发现冠状动脉疾病的高风险人群是低风险人群的1.5倍。
3)得冠状动脉疾疾病的风险和血管平滑肌细胞相关表型无任何关系。
4)冠状动脉疾疾病易感位点中,有79个位点与血管平滑肌细胞表型相关,经多重检验校正,无显著相关。
5)对79个位点进行注释,发现有32个位点是eQTL位点, 其中rs67180937被证明影响 MIA3 的表达,进一步的实验证明MIA3影响细胞增殖。
6)总结,高MIA3表达可能促进动脉粥样硬化使得血管平滑肌细胞表型发生改变(包括增生)
文章链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33040646/
二
文献题目: Identification of 31 loci for mammographic density phenotypes and their associations with breast cancer risk
不想看英文题目: 鉴定31个基因座与乳腺密度表型相关,以及与乳腺癌风险的关系
杂志和影响因子: Nat Commun(12.121,1区)
样本量: 24,192位女性
结论:
1)31个基因座与乳腺密度表型相关;
2)31个基因座中,有17个与乳腺癌风险相关(P<0.05);
3)孟德尔随机分析显示,致密区域、非致密区域和密度百分比与乳腺癌风险显着相关(P <0.05);
4)富集分析的结果表明,致密区域表型富集了繁殖、凋亡、代谢和信号传导相关的基因,非致密区域富集了代谢、细胞分化和繁殖相关的基因,密度百分比富集了解剖结构发育、代谢相关基因;
5)致密区域、非致密区域和密度百分比表型的遗传度分别为0.30(SE = 0.02),0.34(SE = 0.02),和0.31(SE = 0.02)。
文章链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33037222/
资料: phs000674.v3.p3