1、禁用配置服务器向导
由于不需要服务器设置功能，首先我们先禁止“配置你的服务器”（Manage Your Server）向导的出现，你可以在控制面板（Control Panel） -> 管理员工具（Administrative Tools ）-> 管理你的服务器（Manage Your Server）运行它，然后在窗口的左下角复选“登录时不要显示该页”（Don't display this page at logon）。
2、建立一个新的用户账号
Windows Server 2003不支持类似于Windows XP的登录欢迎屏幕。你可以在首次进入系统后建立一个有你个性的新用户账号。
打开“开始”（Start） -> “运行”（Run） -> 键入“lusrmgr.msc ”，你将看到本地用户和组（Local Users and Groups ）。
右键点击左边窗口的“用户”（Users），选择“新用户”（New User）.在弹出的对话框中输入账号信息,然后点击“建立”（Great）。这样你的账号就可用了，当然，你可以选择把你的账号添加到管理员组，右键点击你新建的用户。然后选择“属性”（Properties） -> 点击“隶属于” on Member of tab -> “添加”Add.. -> “高级”Advanced -> “现在查找”Find Now 。
在查找结果对话框中双击“管理员”（Administrators），在点击两次“确定”（Ok）后关闭“本地用户和组”（Local Users and Groups window），现在你将可以注销Administrator用户用你自己的账号登录系统。
3、禁用Internet Explorer Enhanced Security
作为新windows组件出现的IE安全插件－－Internet Explorer Enhanced Security默认把你IE安全设置为最高。这样你将在访问站点弹出询问框并对你浏览网页及文件下载做出阻止的行为。我们其实不一定需要这个组件。
我们首先禁止询问框的出现,在弹出的对话框中复选”以后不要显示这个信息“ （In the future, do not show this message） 。
然后，我们可以在IE工具选项中自定义设置IE的安全级别。在”安全“（Security）选项卡上拉动滚动条把Internet区域安全设置为”中“（Medium），这个级别将适合大多数人，要是你有特别要求，这个步骤将不适合你。
通过对IE安全的设置，你现在安装可以上Sun's Java VM!
当然，你甚至可以在控制面板－－添加程序－－添加或删除Windows组件中卸载Internet Explorer Enhanced Security 。
Windows server 2003没有集成MS Java VM或Sun Java VM,你可以自行下载并安装它。
5、禁止关机事件跟踪
关机事件跟踪（Shutdown Event Tracker）也是Windows server 2003区别于其他工作站系统的一个设置，对于服务器来说这是一个必要的选择，但是对于工作站系统却没什么用，我们同样可以禁止它。
打开”开始“Start ->”运行“ Run ->输入”gpedit.msc “，在出现的窗口的左边部分，选择 ”计算机配置“（Computer Configuration ）-> ”管理模板“（Administrative Templates）-> ”系统“（System）,在右边窗口双击“Shutdown Event Tracker”。
在出现的对话框中选择“禁止”（Disabled），点击然后“确定”（OK）保存后退出。
这样，你将看到类似于windows 2000的关机窗口
6、启用硬件和DirectX加速
硬件加速：桌面点击右键－－属性（Properties） -> 设置（Settings）－－高级（Advanced）－－疑难解答（Troubleshoot）。把该页面的硬件加速滚动条拉到“完全”（Full），最好点击“确定”（OK）保存退出。这期间可能出现一瞬的黑屏是完全正常。
DirectX加速：打开“开始”（Start） -> “运行”（Run），键入“dxdiag”并回车打开“DirectX 诊断工具”（DirectX Tools），在“显示”（Display）页面，点击DirectDraw, Direct3D and AGP Texture 加速三个按钮启用加速。
7、允许声音加速
如果你使用的是Windows server 2003标准版请从第二步操作，因为标准版已允许声音服务。
打开“开始”（Start） -> “运行”（Run），键入“Services.msc ”，在出现的窗口中找到“Windows Audio”并双击它，然后在启动模式（startup type ）的下拉菜单选择“自动”（Automatic），并点击“应用”（Apply） ->“开始”（Start） -> “确定”（OK）
打开“开始”（Start）->“运行”（Run），键入“dxdiag”并回车打开“DirectX 诊断工具”（DirectX Tools），在“Sound”（Display）页面，把“声音的硬件加速级别”（Hardware Sound Acceleration Level）滚动条拉到“完全加速”（Full Acceleration）。
8、启用桌面主题
也许你对WINDOWS经典的桌面已经感到厌烦的话，你就要考虑启用桌面主题了，Windows server 2003默认是关闭此服务的。
打开“开始”（Start）->“运行”（Run），键入“Services.msc”，在出现的窗口找到Themes这个服务并双击它，然后在启动模式（startup type）的下拉菜单选择“自动”（Automatic），并点击“应用”（Apply） ->“开始”（Start）-> “确定” 。
这样的操作也是只能让你使用Windows自带的Luna主题的三个模式，假如你希望使用更多的第三方主题文件的话，你需要使用修改的Uxtheme.dll文件来支持它，关于修改的Uxtheme.dll文件，你可以在http://vortex.winbeta.org/找到更多。
注：至于怎么替换Uxtheme.dll的问题，本站已经N次的解答过了，需要了解的朋友请查询以往的帖子。
9、允许内置的IMAPI CD-Burning服务和支持Windows影像设备服务
假如你希望启用Windows内置的IMAPI CD-Burning服务。做如下操作：
打开“开始”（Start）-> “运行”（Run），键入“Services.msc ”，在出现的窗口中找到“IMAPI CD-Burning COM Service ”并双击它，然后在启动模式（startup type）的下拉菜单选择“自动”（Automatic），并点击“应用”（Apply）->“开始”（Start）-> “确定”（OK）。
假如你有如数码相机和扫描仪之类的影像设备，你应该打开Windows Image Acquisition 服务。
打开“开始”（Start）-> “运行”（Run），键入“Services.msc ”，在出现的窗口中找到“Windows Image Acquisition (WIA)”并双击它，然后在启动模式（startup type）的下拉菜单选择“自动”（Automatic），并点击“应用”（Apply）->“开始”（Start）->“确定”（OK）
10、高级设置
我们可以修改一些windows server 2003的高级设置以适合工作站的应用环境。
右键点击“我的电脑”（My Computer）－－属性（Properties）－－高级（Advanced）－－性能（Performance）－－设置（Setting）－－高级（Advanced），把“处理器计划”（Processor scheduling ）和内存使用（Memory usage）分配给“程序”（Programs）使用。然后点击“确定”（OK.）
禁用错误报告
右键点击“我的电脑”（My Computer）－－属性（Properties）－－高级（Advanced）－－点击“错误报告”（Error Reporting ）按钮，在出现的窗口中把“禁用错误报告”（Disable Error Reporting）选上并复选“但是，发生错误时通知我”（But, notify me when critical errors occur.）
调整虚拟内存
正常运行Windows所需要的虚拟内存是作为物理内存的“后备力量”而存在的，虽然运行速度上硬盘不如内存，但在容量上内存是无法与硬盘相提并论的。所以我们一直是认为虚拟内存越大越好，其实事实上并不是这样的，尤其是安装Windows server 2003用做工作站的环境下并不承担高负荷工作的情况下，我们可以试试禁用虚拟内存。前提是你必须拥有512M物理内存以上。很多朋友担心如果禁用虚拟内存会不会象在Windows 9x环境下一样造成系统无法正常待机和休眠的情况，其实不会这样的，因为从windows xp开始它的虚拟内存（即pagefile.sys）是专用于数据交换的，待机模式时数据依旧保留在物理内存中，休眠模式也有其专用的休眠文件（Hiberfil.sys），所以绝对不会出现系统无法休眠的问题。而使用Windows server 2003的一些朋友经常会对其的关机和注销缓慢感到束手无策，在此我个人的解决办法就是禁用虚拟内存，这样你的注销和关机时间可能会加快很多。我今天做了测试，在加载虚拟内存的情况下注销用户重登陆windows的时间是3秒，关机是23秒。但是在禁用虚拟内存的情况下注销重登陆的时间减少到2秒，而关机时间缩短到3秒。
右键点击“我的电脑”（My Computer）－－属性（Properties）－－高级（Advanced）－－性能（Performance）－－设置（Setting）－－高级（Advanced），点击“虚拟内存”（Virtual memory）部分的“更改”（Change），然后在出现的窗口选择“无分页文件”。重启系统即可。
注意：调整虚拟内存部分经过个人测试无任何问题，但是不保证在您的机器上也是这样，所以我不对此设置造成的任何后果承担责任。只是建议对Windows server 2003关机速度有怨言的朋友尝试。
11、自动登陆
Windows Server 2003默认是使用"CTRL-ATL-DEL to login" 对话框来登陆Windows的，不过我们我们可以使用Windows XP的Tweak UI来使Server 2003自动登陆。
下载Tweak UI软件
下载后直接执行tweakui.exe
在左边的面板中选择Logon -> Autologon -> 在右边勾选Log on automatically at system startup输入你的用户名和域名（如果没有就不写）
点击下面的Set Password，输入用户名的密码，然后点击OK。
虽然同样的功能通过修改注册表也能完成，但是修改注册表的方法密码在注册表中表现的是明文，而Tweak UI在注册表中不会留下明文的密码，所以推荐使用Tweak UI来完成这项工作。
12、安装DirectX 9a
在Windows Server 2003上安装DirectX 9a和在其他版本的Windows上安装DirectX 9a的方法是一样的。安装之前先启用DirectX and Graphics Acceleration。
下载：DirectX 9.0a Websetup
运行该文件就可以开始安装，websetup.exe只是一个安装向导，在安装过程中将会下载大概6.9 MB文件。
安装结束后需要重启动系统。
13、隐藏文件
Windows Server 2003默认情况下是显示所有的文件夹的，如果你不想这样，可以通过一下方法来隐藏：
打开任意一个文件夹，选择Tools -> Folder Options -> View，选择Do not show hidden files and folders，点击OK。
在Windows Server 2003中，已经安装了Windows Media Player 9，点击Start-> Programs -> Accessories -> Entertainment -> Windows Media Player就可以打开它。