R在Linux上的安装有一些坑（Windows上安装会方便许多），在这里记录，希望可以减少读者不必要的麻烦。我的服务器是SUSE Linux 64位，无法接入互联网（安全原因，你懂的）。
到R官网http://www.r-project.org/下载源代码。下载完后上传到服务器上并解压。首先配置，cd到解压后的目录输入如下命令
./configure --prefix=<YOUR_R_HOME> --with-readline=yes --with-libpng=yes --with-x=no
参数解释
- prefix R安装目录，需要绝对路径，默认安装在R源代码目录下，建议指定特定目录，后续好维护。
- with-readline 使用系统的readline库，如果系统上没有libreadline，此选项填“no”,但是强烈推荐使用此选项，否则编译出来的R极其难用（上下左右全部无效，囧！）。如何安装libreadline，参见这里。安装好libreadline后，但是R配置时找不到，可能是libreadline.so没有在系统目录（如/usr/local/lib）中，参见这篇文章排查问题。
- with-libpng 使用系统的libpng库，用于导出png图片，libpng下载地址，参见这里。
- with-x 表示是否使用X-Windows系统，也就是类Unix操作系统的GUI，由于我的服务器是没有安装这个的，所以这一项选择”no”（一般的服务器也不会安装这个）。
配置完后，输入如下命令就可以编译并安装R到指定目录了
make && make install
在安装过程中，R有部分库依赖java，所以如果没有安装java，R安装扩展库时会异常结束，报告找不到java等信息，但是这个不影响使用。linux上安装java，可以参见这里，配置java环境变量，可以参见这里。
安装完后R后，还无法在系统任何目录下使用R，这一点比较麻烦，所以最好在系统目录下做一个软链接，方便后续操作，命令如下：
ln -s <YOUR_R_HOME>/bin/R /usr/local/bin/R
安装完R后，后续可能还需要安装一些扩展包，可以参见这篇文章了解更多扩展包的安装方法。
希望这篇文章对你有用。