Anaconda安装R语言及其环境配置
在正常使用中,发现集群中自带R为3.5.1,很多packages装不上(会出现non-zero exist报错),并且没有管理员权限,只能在子系统下安装,因此考虑利用Anaconda3安装新版本R语言,参考该博客:
首先安装Anaconda
wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
bash Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
利用Anaconda安装R语言及相关软件包
conda create -n r_env r-essentials r-base r-environment
conda install -c bioconda bioconductor-biocinstaller
conda activate r-environment
装完bioconductor感觉大多数的包都可以搞定了!
结束后发现打开R发现依旧是3.5.1
在用户目录下.bashrc文件中加入这么一句alias Rconda='conda activate r_env'并激活
source .bashrc
Rconda
R
成功: