作为一种增加有限DNA量的方法，全基因组扩增技术于1992年出现，该方法特别适于法医学鉴定和遗传疾病的研究，以及如二代测序技术和CGH阵列（比较基因组杂交）等新技术应用，后者的主要难题就在于DNA样本数量有限，但分析需求量又很可观。目前业界已经开发出多种WGA技术，它们之间的实验方案和复制准确度有所不同。
业界已经开发出多种WGA技术；不过这些技术在其扩增准确性和易用性等方面有所区别。多重置换扩增（MDA）的WGA技术，能够提供无偏差的准确全基因组扩增
基于PCR的WGA技术：
基于PCR的WGA技术主要有两种：
简并寡核苷酸PCR (DOP-PCR)技术(1)
和扩增前引物延伸(PEP)技术(2)。
这两种技术之间的主要区别在于PEP技术使用随机引物和低PCR退火温度，而DOP-PCR技术则使用半简并寡核苷酸（例如CGACTCGAGNNNNNNATGTGG）和更高的退火温度。
两种方法中都使用了Taq DNA聚合酶，使得扩增长度限制在3 kb（平均片段长度为400–500 kb）以内，并且会在扩增序列中引入一些错误。
不仅如此，有研究发现这些技术的基因组覆盖度不够完整，并会在扩增中产生偏向性——由于引物优先结合某些特定区域，造成DNA扩增产物中的一些序列相对增多。
多重置换扩增的WGA技术
多重置换扩增(MDA)的恒温基因组扩增技术，该技术包含了随机六聚体与变性DNA的结合过程，以及使用聚合酶在恒定温度下进行的链置换合成过程。每个置换链上添加引物后，形成分枝状的DNA结构网络。
聚合酶不会从基因组DNA模板上面解离下来，这使得生成的无偏差DNA片段可延伸至100 kb。
该酶还具有3’端→5’端的外切酶校正活性，相比基于Taq DNA聚合酶的方法，能够提供高达1000倍的保真度（参见上述基于PCR的WGA技术）。
聚合酶由独特的优化缓冲液进行支撑，能够方便的克服如发卡环一类的二级结构困难，在扩增过程中避免滑脱、定制和聚合酶解离等现象的发生。
这样无偏差的DNA片段能够合成至100 kb的长度。
参考来源：