区别：1、InnoDB⽀持事务，MyISAM不⽀持 1对于InnoDB每⼀条SQL语⾔都默认封装成事务，⾃动提交，这样会影响速度，所以最好把多条SQL语⾔放在begin和commit之 间，组成⼀个事务；
2、InnoDB⽀持外键，⽽MyISAM不⽀持。 2对⼀个包含外键的InnoDB表转为MYISAM会失败；
3、InnoDB是聚集索引 I ，数据⽂件是和索引绑在⼀起的，必须要有主键，通过主键索引效率很⾼。 但是辅助索引需要两次查询，先查询到主键，然后再通过主键查询到数据。因此主键不应该过⼤，因为主键太⼤，其他索引也都 会很⼤。 ⽽MyISAM是⾮聚集索引 M ，数据⽂件是分离的，索引保存的是数据⽂件的指针。主键索引和辅助索引是独⽴的。
4、InnoDB不保存表的具体⾏数，执⾏select count(*) from table时需要全表扫描。⽽MyISAM⽤⼀个变量保存了整个表的⾏ 数，执⾏上述语句时只需要读出该变量即可，速度很快；
5、Innodb不⽀持全⽂索引，⽽MyISAM⽀持全⽂索引，查询效率上MyISAM要⾼；
如何选择：是否要⽀持事务，如果要请选择innodb，如果不需要可以考虑MyISAM； 如果表中绝⼤多数都只是读查询，可以考虑MyISAM，如果既有读写也挺频繁，请使⽤InnoDB 系统奔溃后，MyISAM恢复起来更困难，能否接受； MySQL5.5版本开始Innodb已经成为Mysql的默认引擎(之前是MyISAM)，说明其优势是有⽬共睹的，如果你不知道⽤什么，那就⽤InnoDB，⾄少不会差。