• python opencv 医学处理


    机器视觉实验八医学处理

    一、实验目的

    1)能利用python编写程序实现相关图片处理功能;

    2)深入了解机器视觉相关应用领域。

    二、题目描述

    1)读取图像并展示;

    2)用Niblack方法对灰度图进行局部动态阈值分割并进行展示;

    3)对图像进行反色;

    4)对图像进行扩展;

    5)选择满足面积要求的目标输出(针对黑色背景白色目标的二值图);

    6)输出最大连通图;

    7)对最大连通图进行细化;

    8)提取最大连通图的轮廓;

    9)对轮廓图像进行反色输出最终效果图。

    三、实现过程及运行效果

    实验图片如下:

     

    3.1原图像

    实验步骤:

    1)读取图像并展示;

    2)用Niblack方法对灰度图进行局部动态阈值分割并进行展示;

    代码实例:
    import cv2

    import numpy as np

    # 读取图像

    img1=cv2.imread('vas0.bmp')

    cv2.imshow('img1',img1)

    cv2.waitKey(0)

    #局部阈值

    gray = cv2.cvtColor(img1, cv2.COLOR_RGB2GRAY)  #把输入图像灰度化

    #自适应阈值化能够根据图像不同区域亮度分布,改变阈值

    binary =  cv2.adaptiveThreshold(gray, 255, cv2.ADAPTIVE_THRESH_GAUSSIAN_C,cv2.THRESH_BINARY, 35,3)

    cv2.namedWindow("binary1", cv2.WINDOW_NORMAL)

    cv2.imshow("binary1", binary)

    cv2.waitKey(0)

    运行效果:

     

    3.2.1读取原图

    3)对图像进行反色;

    代码实例:
    #反色

    img2 = binary.copy()

    cv2.threshold(binary,80,255,0,binary)

    for i in range(0,binary.shape[0]):

        for j in range(0,binary.shape[1]):

            img2[i,j] = 255-binary[i,j]

    cv2.imshow("img2", img2)

    cv2.waitKey(0)

    运行效果:

     

    3.3.1反色图

    4)对图像进行扩展;

    代码实例:

    #图像扩展

    img3 = cv2.copyMakeBorder(img2,1,1,1,1,cv2.BORDER_REPLICATE)

    cv2.imshow("img3 ", img3 )

    cv2.waitKey(0)

    运行效果:

     

    3.4.1扩展图

    5)选择满足面积要求的目标输出(针对黑色背景白色目标的二值图);

    代码实例:

    #选择满足面积要求的目标输出(针对黑色背景白色目标的二值图)

    # 查找轮廓

    contours,hierarchy = cv2.findContours(img3, cv2.RETR_EXTERNAL, cv2.CHAIN_APPROX_NONE)

    #消除小面积

    for i in range(len(contours)):

        area = cv2.contourArea(contours[i])

        if area < 150:

            cv2.drawContours(img3,[contours[i]],0,0,-1)

    cv2.imshow("img3 ",img3 )

    cv2.waitKey(0)

    3.5.1消除小面积图

     

    6)输出最大连通图;

    代码实例:

    #面积滤波,用连通区域的面积除以连通区域包络盒的面积,仅保留当这个比值小于用户所给的div的值时的连通区域

    img4=img3.copy()

    contours1,hierarchy = cv2.findContours(img4, cv2.RETR_EXTERNAL, cv2.CHAIN_APPROX_NONE)

    for j in range(len(contours1)):

        area1 = cv2.contourArea(contours1[j])

        print(area1)

        if area1 ==157.0:

         cv2.drawContours(img4,[contours1[j]],0,0,-1)

        elif area1==261.5:

         cv2.drawContours(img4,[contours1[j]],0,0,-1)

        elif area1==568.0:

         cv2.drawContours(img4,[contours1[j]],0,0,-1)

    cv2.imshow('img4',img4)

    cv2.waitKey(0)

    运行效果:

     

    3.6.1最大连通图

    7)对最大连通图进行细化;

    代码实例:

    #对图像进行反色

    img5 = img4.copy()

    ret,img5 = cv2.threshold(img4,80,255,cv2.THRESH_BINARY)

    img6 = cv2.bitwise_not(img4)
    def VThin(image, array):

        h,w= image.shape[:2]

        NEXT = 1

        for i in range(h):

            for j in range(w):

                if NEXT == 0:

                    NEXT = 1

                else:

                    M = image[i, j-1] + image[i,j] + image[i, j+1] if 0<j<w-1 else 1

                    if image[i, j] == 0 and M != 0:

                        a = [0] * 9

                        for k in range(3):

                            for l in range(3):

                                if-1<(i-1+k)<h and -1<(j-1+l)<w and image[i-1+k, j-1+l] == 255:

                                    a[k*3 + l] = 1

                        sum = a[0]*1 + a[1]*2 + a[2]*4 + a[3]*8 + a[5]*16 + a[6]*32 + a[7]*64 + a[8]*128

                        image[i,j] = array[sum]*255

                        if array[sum] == 1:

                            NEXT = 0

        return image

    def HThin(image, array):

        h, w = image.shape[:2]

        NEXT = 1

        for j in range(w):

            for i in range(h):

                if NEXT == 0:

                    NEXT = 1

                else:

                    M = image[i-1, j] + image[i, j] + image[i+1, j] if 0<i<h-1 else 1

                    if image[i, j] == 0 and M != 0:

                        a = [0] * 9

                        for k in range(3):

                            for l in range(3):

                                if -1<(i-1+k)<h and -1<(j-1+l)<w and image[i-1+k, j-1+l] == 255:

                                    a[k*3 + l] = 1

                        sum = a[0]*1 + a[1]*2 + a[2]*4 + a[3]*8 + a[5]*16 + a[6]*32 + a[7]*64 + a[8]*128

                        image[i, j] = array[sum] * 255

                        if array[sum] == 1:

                            NEXT = 0

        return image

    def Xihua(binary, array, num=10):

        iXihua = binary.copy()

        for i in range(num):

            VThin(iXihua, array)

            HThin(iXihua, array)

        return iXihua

    array = [0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1,

             0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

             0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1,

             0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

             0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1,

             0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0,

             1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0]

    iThin = Xihua(img6, array)

    cv2.imshow('iThin', iThin)

    cv2.waitKey(0)

    运行效果:

     

    3.7.1细化图

    8)提取最大连通图的轮廓;

    代码实例:

    #对图像进行边界提取

    # 查找轮廓

    #提取边缘

    img7 = cv2.Canny(img4,80,255)

    cv2.imshow('img7', img7)

    cv2.waitKey(0)

    运行效果:

    3.8.1轮廓提取

    9)对轮廓图像进行反色输出最终效果图。

    代码实例:

    #反色

    img8 = img7.copy()

    for i in range(0,img7.shape[0]):

        for j in range(0,img7.shape[1]):

            img8[i,j] = 255-img7[i,j]       

    cv2.imshow("img8",img8)

    cv2.waitKey(0)

    运行效果:

     

    3.9.1最终效果图

    四、问题及解决方法

    1)有出现无法对规定轮廓进行输出,最后通过检索找到了cv2.drawContours()函数可进行轮廓的消除操作,最终完成将小面积轮廓进行去除的操作;

    2)对最大连通图的提取,最开始因为发现了计算轮廓面积的cv2.contourArea()函数,我获得了几个大轮廓的面积,实行了将最大轮廓输出的操作,可是发现有规定的一小块形状没有连通输出不了,然后自己实在没法了对面积进行了筛选输出最后成功获取。

    五、实验总结

    本次实验真的有点难到,好几次都想放弃了,可是细想之后还是没放弃,虽然不是通过老师的函数操作的,也是付出了很多心血对它进行了完成,最终的成果上,对图像细化的那一块尚存在瑕疵,不过实在是没法了,那些个数学计算方法搞得人头大。

     参考:

    https://blog.csdn.net/wsp_1138886114/article/details/101050825?utm_source=app

    https://blog.csdn.net/xuyangcao123/article/details/81023732

    https://blog.csdn.net/xiaoxifei/article/details/82854068

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/Wang1107/p/12721363.html
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