图计算pregel引擎 sparkGraph解析

PageRank源码简析

1 package org.apache.spark.graphx.lib.PageRank

   PageRank的实现类

   pageRank在spark中基于pregel思想做了并行化实现

def runWithOptions[VD: ClassTag, ED: ClassTag](
    graph: Graph[VD, ED], numIter: Int, resetProb: Double = 0.15,
    srcId: Option[VertexId] = None): Graph[Double, Double]

该方法作为主要执行入口，执行多次pr值迭代结算。而迭代计算的核心逻辑如下

红线部分完成了整个图的pr值更新，

可以看到 是Graph类实现了pregel的计算逻辑。

因此我们继续深挖Graph类，实现类 GraphImpl实现了 aggregateMessagesWithActiveSet方法

该方法是核心实现类，定义如下

private[graphx] def aggregateMessagesWithActiveSet[A: ClassTag](
    sendMsg: EdgeContext[VD, ED, A] => Unit,
    mergeMsg: (A, A) => A,
    tripletFields: TripletFields,
    activeSetOpt: Option[(VertexRDD[_], EdgeDirection)])
  : VertexRDD[A]

在其实现中，可以看到真正实现这个方法的是 EdgePartiion类。

 其实现如下。我们发现，EdgeParition，顺序地(sync)执行了sendMsg操作。

在sendMsg中，完成了pagerank 的sendMsg ，以及meger方法 的函数式调用。

 /

核心思想：

　　　基于EdgePartiion来执行 compute以及 combine，并利用rdd分区的并行化特性，来实现大同步栅栏。

主要实现逻辑：

　　　预定义了 sendMsg方法以及 combine函数，实现权重转移操作。同时包含了active点的优化（减少计算量，这个部分不做详细分析）

最终的计算结果与原始数值做join操作，计算新的pr结果。

在上文的pageRank调用入口中，可以窥见官方利用sparkRDD来实现pregrel的最佳实践。都是通过lambda表达式来定义compute和combine逻辑。

在PageRank类中的runUntilConvergenceWithOptions方法中，直接使用了org.apache.spark.graphx.Pregel 类来完成其计算。显示地定义了compute方法与conbine方法。

org.apache.spark.graphx.Pregel类中 ，该类封装了一整套完整的pregel计算逻辑（可以），其最终仍是调用graphImpl类来实现相关的计算，因此不做特别的说明

def runUntilConvergenceWithOptions[VD: ClassTag, ED: ClassTag](
    graph: Graph[VD, ED], tol: Double, resetProb: Double = 0.15,
    srcId: Option[VertexId] = None): Graph[Double, Double] 

我们可以看到 在该方法中，