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SAP analysis in the Ohmega software
ohmega software 关于胃食管反流疾病 对 sap的分析方法 分享。
sap 是描述 胃食管反流仪器对患者监测时,出现的症状如:咳嗽 烧心 胸痛 等症状 与反流相关的概率。这个概率大于0.95说明该症状是反流引起的。
sap需借助 Fisher Exact test 分析方法来进行分析。这个方法的表现形式如下表:
C1和C2描述的是两个条件,-C1 -C2 表达的意思就是没有符合C1 C2这两个条件的情况。字母a表示,C1和C2都满足的情况;b表示,C1 -C2表示只满足C1,不满足C2;c表示,C1条件不满足但C2条件满足;d表示,C1 C2条件都不满足的情况次数。这里的A+c应该是等同于a+c的。
有了这个表格,就能计算除C2条件因为C1条件发生的概率也就是sap。
首先计算 p:
然后sap=(1-p)*100%,在这款软件的含义是:如果sap>0.95就说明症状和反流存在关联性。
在计算胃食管反流的时候,我们把C1当作反流,C2当作某种症状。
R是反流英文 Reflux的首字母,这里就代表反流条件,S是症状 Symptoms的首字母这里代表某种症状条件。
S+R+表示既有反流又有症状 ,S-R+表示只有反流没有症状,S+R-表示只有症状没有反流,S-R-表示症状和反流都没有。这里只是很笼统的说一下其大概意思,但是详细定义S+R+这些计算方法如下:
我们是把软件检测时间分成每2分钟一段,然后分成S-和S+及这样分成的每段的无症状情况和有症状情况讨论。先说S-及无症状段情况。
接下图:
R+=3的解释,我的理解是,R1所处的这2分钟段没有出现症状,算一次,R2 和R3所处的段也没有出现症状S,算一次,
R4所处的段也没有,所以总共三次,在计算S-时,是数的段数而不是出现的反流次数。与S+的情况有区别。
R-=5的解释,我的理解是,没有出现竖着的虚线标记的段有5个所以是5次。
如果软件设置了排除进食区域,这种情况如图:
Meal period 的占用部分不算。
S+的情况
For R+S+ and R-S+ we look 2 minutes in front of each symptom. When a start of a reflux is within this two minute period this
period is said to be R+S+ and else it is categorized as R-S+.
我的翻译是,当症状出现了,往症状的出现前的前2分钟找,如果在这段时间内有一次反流就S-R+算一次,如果没有反流就R-S+算一次,需要排除已经算过的反流情况。
R+=3,我的理解是,R1在s1算一次,在s2算一次,但是s1已经算过了,s2那次就不算了。对于S3 有R2和R3两次。所以总共3次。
R-=1,我的理解是,S4前两分钟没有出现反流,所以算一次。
排除进食区域的情况:
R+=2,R1算一次,R3算一次,R2就不算了。
总体来看,就是这样。
但是本来总共只有8个两分钟段,但这里计算得出的总数是12,有些反流是被重复计算了,因为在S-和S+的计算情况不一样造成的,所以
我们要:
S-R+=S-R+ - S+R+及 3-3=0
s-R-=S-R- - S+R-及5-1=4
结果如下表:
但是明显S-R+不应该为0,有一个R4。造成这样的原因是,在算S+R+时,R2和R3所处的段被多算了一次,意思是本来S+R+的段只有2个,但因为S+计算方式不同,所以多算一个。
还有S-R-只有2个,但这里是4,是因为计算症状和反流的时间有重叠,造成了不一致,就多出来了,我觉得从图上看是看不出来的吧。