• 关于DNA双链种类数的小讨论


    DNA计数

    摘要

    之前看到 (jmh)(yyy)(zyl) 一起写的博客,我也大概了解了一下这个问题:
    因为碱基对有 (A-T)(T-A)(C-G)(G-C) 四种情况,所以长度为 (n) 的DNA双链有 (4^n) 种。

    问题发现

    出现了点小问题,比如如下两个 DNA 双链:

    [egin{array}{|cc|} 3 5\ A-T \ A-T \ A-T \ 5 3\ end{array} egin{array}{|cc|} 3 5\ T-A \ T-A \ T-A \ 5 3\ end{array} ]

    它们的平面结构完全相同,并且因为 DNA 螺旋是右手螺旋,它们的双螺旋结构理论上也一样;

    显然它们在 (4^n) 中都被算到了。

    问题探究

    这是因为 DNA 的两条脱氧核苷酸链呈反向平行;
    所以只需要先左右翻转再上下翻转(下文简称"完全翻转")就可以得到完全一样的DNA双链。
    故初步猜想 DNA 种类数为 (f_n = frac{1}{2} imes 4 ^ n),其中 (n) 为碱基对数。

    但问题还没有解决:
    (n) 为偶数时,若 DNA 的上半段与下半段可以互相通过完全翻转得到,该 DNA 并不会被算重。
    举例说明一下:

    [egin{array}{|cc|} 3 5\ A-T \ A-T \ T-A \ T-A \ 5 3\ end{array} ]

    这部分并不难处理:
    只需要算出上半段的种类数((4^{frac{n}{2}})),下半段完全翻转过去即可。

    简单总结一下,可以的到 DNA 计数的柿子:

    [f_n = egin{cases} frac{1}{2} imes 4 ^ n, & 2 | (n + 1) \ frac{1}{2} imes (4 ^ n + 4 ^ {frac{n}{2}}), & 2 | n end{cases} ]

    补充说明

    课本当中 (4 ^ n) 肯定不无道理,经过 (jmh)yy 查阅资料后发现:

    DNA计数1.jpg

    我们也没有考证资料的权威性,也不排除上述问题存在争议的可能;

    生命体是一个及其复杂的体系,也许 DNA 两条链存在些许差异只有其他细胞器可以识别;

    所以不妨认定长度为 (n) 的 DNA 双链有 (4 ^ n) 种。

    问题延伸

    在不考虑生物学的情况下,DNA 的上述性质可以扩展并加以探究;

    由于本人学业繁(bu)忙(xing),还没有完成这方面的学习,有机会一定出道题,八说了,写作业去了。

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