• Pandas读取或存储数据至Mysql


    两种链接方式

    用DBAPI构建数据库链接

    import pymysql
    import pandas as pd
    
    con = pymysql.connect(host="127.0.0.1",user="root",password="password",db="world")
    # 读取sql
    data_sql=pd.read_sql("SQL查询语句",con)
    # 存储
    data_sql.to_csv("test.csv")

    用sqlalchemy构建数据库链接

    import pandas as pd
    import sqlalchemy
    from sqlalchemy import create_engine
    
    # 用sqlalchemy构建数据库链接engine
    db_info = {'user':'user', 
    'password':'pwd', 
    'host':'localhost', 
    'database':'xx_db' # 这里我们事先指定了数据库,后续操作只需要表即可
    } 
    engine = create_engine('mysql+pymysql://%(user)s:%(password)s@%(host)s/%(database)s?charset=utf8' % db_info,encoding='utf-8') #这里直接使用pymysql连接,echo=True,会显示在加载数据库所执行的SQL语句。
    # sql 命令
    sql_cmd = "SELECT * FROM table"
    df = pd.read_sql(sql=sql_cmd, con=engine)

    从Mysql读取数据,返回DataFrame格式的数据

    read_sql

    pandas.read_sql(sql, con, index_col=None, coerce_float=True, params=None, parse_dates=None, columns=None, chunksize=None)

    效果:将SQL查询或数据库表读入DataFrame。

    官方关于参数的详细介绍:https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.read_sql.html

    如何使用read_sql

    来源:https://www.cnblogs.com/cymwill/p/8289367.html

    下面两个的作用又是相同的:

    将DataFrame格式的数据存储到Mysql

    to_sql

    DataFrame.to_sql(name, con, schema=None, if_exists='fail', index=True, index_label=None, chunksize=None, dtype=None,method=None)

    下部分来源:https://www.jianshu.com/p/d615699ff254

    我们从一个简单的例子开始。在 mysql 数据库中有一个 emp_data 表,假设我们使用 pandas DataFrame ,将数据拷贝到另外一个新表 emp_backup

    import pandas as pd
    from sqlalchemy import create_engine
    import sqlalchemy
    
    engine = create_engine('mysql+pymysql://user:password@localhost/stonetest?charset=utf8')
    df = pd.read_sql('emp_master', engine)
    df.to_sql('emp_backup', engine)

    使用 mysql 的 describe 命令比较 emp_master 表和 emp_backup 表结构:

    mysql> describe emp_master;
    +----------------+-------------+------+-----+---------+-------+
    | Field          | Type        | Null | Key | Default | Extra |
    +----------------+-------------+------+-----+---------+-------+
    | EMP_ID         | int(11)     | NO   | PRI | NULL    |       |
    | GENDER         | varchar(10) | YES  |     | NULL    |       |
    | AGE            | int(11)     | YES  |     | NULL    |       |
    | EMAIL          | varchar(50) | YES  |     | NULL    |       |
    | PHONE_NR       | varchar(20) | YES  |     | NULL    |       |
    | EDUCATION      | varchar(20) | YES  |     | NULL    |       |
    | MARITAL_STAT   | varchar(20) | YES  |     | NULL    |       |
    | NR_OF_CHILDREN | int(11)     | YES  |     | NULL    |       |
    +----------------+-------------+------+-----+---------+-------+
    8 rows in set (0.00 sec)
    

    emp_backup 表结构:

    mysql> describe emp_backup;
    +----------------+------------+------+-----+---------+-------+
    | Field          | Type       | Null | Key | Default | Extra |
    +----------------+------------+------+-----+---------+-------+
    | index          | bigint(20) | YES  | MUL | NULL    |       |
    | EMP_ID         | bigint(20) | YES  |     | NULL    |       |
    | GENDER         | text       | YES  |     | NULL    |       |
    | AGE            | bigint(20) | YES  |     | NULL    |       |
    | EMAIL          | text       | YES  |     | NULL    |       |
    | PHONE_NR       | text       | YES  |     | NULL    |       |
    | EDUCATION      | text       | YES  |     | NULL    |       |
    | MARITAL_STAT   | text       | YES  |     | NULL    |       |
    | NR_OF_CHILDREN | bigint(20) | YES  |     | NULL    |       |
    +----------------+------------+------+-----+---------+-------+
    9 rows in set (0.00 sec)
    

    我们发现,to_sql() 并没有考虑将 emp_master 表字段的数据类型同步到目标表,而是简单的区分数字型和字符型,这是第一个问题,第二个问题呢,目标表没有 primary key。因为 pandas 定位是数据分析工具,数据源可以来自 CSV 这种文本型文件,本身是没有严格数据类型的。而且,pandas 数据 to_excel() 或者to_sql() 只是方便数据存放到不同的目的地,本身也不是一个数据库升迁工具。

    但如果我们需要严谨地保留原表字段的数据类型,以及保留 primary key,该怎么做呢?

    使用 SQL 语句来创建表结构

    如果数据源本身是来自数据库,通过脚本操作是比较方便的。如果数据源是来自 CSV 之类的文本文件,可以手写 SQL 语句或者利用 pandas get_schema() 方法,如下例:

    import sqlalchemy
    
    print(pd.io.sql.get_schema(df, 'emp_backup', keys='EMP_ID', 
       dtype={'EMP_ID': sqlalchemy.types.BigInteger(),
           'GENDER': sqlalchemy.types.String(length=20),
           'AGE': sqlalchemy.types.BigInteger(),
           'EMAIL':  sqlalchemy.types.String(length=50),
           'PHONE_NR':  sqlalchemy.types.String(length=50),
           'EDUCATION':  sqlalchemy.types.String(length=50),
           'MARITAL_STAT':  sqlalchemy.types.String(length=50),
           'NR_OF_CHILDREN': sqlalchemy.types.BigInteger()
           }, con=engine))

    get_schema()并不是一个公开的方法,没有文档可以查看。生成的 SQL 语句如下:

    CREATE TABLE emp_backup (
            `EMP_ID` BIGINT NOT NULL AUTO_INCREMENT,
            `GENDER` VARCHAR(20),
            `AGE` BIGINT,
            `EMAIL` VARCHAR(50),
            `PHONE_NR` VARCHAR(50),
            `EDUCATION` VARCHAR(50),
            `MARITAL_STAT` VARCHAR(50),
            `NR_OF_CHILDREN` BIGINT,
            CONSTRAINT emp_pk PRIMARY KEY (`EMP_ID`)
    )

    to_sql() 方法使用 append 方式插入数据

    to_sql() 方法的 if_exists 参数用于当目标表已经存在时的处理方式,默认是 fail,即目标表存在就失败,另外两个选项是 replace 表示替代原表,即删除再创建,append 选项仅添加数据。使用 append 可以达到要求。

    import pandas as pd
    from sqlalchemy import create_engine
    import sqlalchemy
    
    engine = create_engine('mysql+pymysql://user:password@localhost/stonetest?charset=utf8')
    df = pd.read_sql('emp_master', engine)
    # make sure emp_master_backup table has been created
    # so the table schema is what we want
    df.to_sql('emp_backup', engine, index=False, if_exists='append')

    也可以在 to_sql() 方法中,通过 dtype 参数指定字段的类型,然后在 mysql 中 通过 alter table 命令将字段 EMP_ID 变成 primary key。

    df.to_sql('emp_backup', engine, if_exists='replace', index=False,
              dtype={'EMP_ID': sqlalchemy.types.BigInteger(),
                     'GENDER': sqlalchemy.types.String(length=20),
                     'AGE': sqlalchemy.types.BigInteger(),
                     'EMAIL':  sqlalchemy.types.String(length=50),
                     'PHONE_NR':  sqlalchemy.types.String(length=50),
                     'EDUCATION':  sqlalchemy.types.String(length=50),
                     'MARITAL_STAT':  sqlalchemy.types.String(length=50),
                     'NR_OF_CHILDREN': sqlalchemy.types.BigInteger()
                     })
    
    with engine.connect() as con:
        con.execute('ALTER TABLE emp_backup ADD PRIMARY KEY (`EMP_ID`);')

    当然,如果数据源本身就是 mysql,当然不用大费周章来创建数据表的结构,直接使用 create table like xxx 就行。以下代码展示了这种用法:

    import pandas as pd 
    from sqlalchemy import create_engine
    
    engine = create_engine('mysql+pymysql://user:password@localhost/stonetest?charset=utf8')
    df = pd.read_sql('emp_master', engine)
    
    # Copy table structure
    with engine.connect() as con:
        con.execute('DROP TABLE if exists emp_backup')
        con.execute('CREATE TABLE emp_backup LIKE emp_master;')
    
    df.to_sql('emp_backup', engine, index=False, if_exists='append')
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