FAT是DOS、Windows9X系统的文件寻址格式，位于DBR之后。
在解释文件分配表的概念的时候，我们有必要谈谈簇（Cluster）的概念。文件占用磁盘空间，基本单位不是字节而是簇。一般情况下，软盘每簇是1个扇区，硬盘每簇的扇区数与硬盘的总容量大小有关，可能是4、8、16、32、64……同一个文件的数据并不一定完整地存放在磁盘的一个连续的区域内，而往往会分成若干段，像一条链子一样存放。这种存储方式称为文件的链式存储。由于硬盘上保存着段与段之间的连接信息（即FAT），操作系统在读取文件时，总是能够准确地找到各段的位置并正确读出。
为了实现文件的链式存储，硬盘上必须准确地记录哪些簇已经被文件占用，还必须为每个已经占用的簇指明存储后继内容的下一个簇的簇号。对一个文件的最后一簇，则要指明本簇无后继簇。这些都是由FAT表来保存的，表中有很多表项，每项记录一个簇的信息。由于FAT对于文件管理的重要性，所以为了安全起见，FAT有一个备份，即在原FAT的后面再建一个同样的FAT。初形成的FAT中所有项都标明为“未占用”，但如果磁盘有局部损坏，那么格式化程序会检测出损坏的簇，在相应的项中标为“坏簇”，以后存文件时就不会再使用这个簇了。FAT的项数与硬盘上的总簇数相当，每一项占用的字节数也要与总簇数相适应，因为其中需要存放簇号。FAT的格式有多种，最为常见的是FAT16和FAT32。
当一个磁盘Format后，在其逻辑0扇区（即BOOT扇区）后面的几个扇区中存在着一个重要的数据表—文件分配（FAT），文件分配表一式两份，占据扇区的多小凭磁盘类型大小而定。顾名思义，文件分配表是用来表示磁盘问件的空分配信息的。它不对引导区，文件目录的信息进行表示，也不真正存储文件内容。
我们知道磁盘是由一个一个扇区组成的，若干个扇区合为一个簇，文件存取是以簇为单位的，哪怕这个文件只有1个字节。每个簇在文件分配表中都有对应的表项，簇号即为表项号，每个表项占1.5个字节（磁盘空间在10MB以下）或2个字节（磁盘空间在10MB以上）。为了方便起见，以后所说的表项都是指2个字节的。
文件分配表结构如1（H表示16进制）
表1
第0字节 表头，表磁盘类型。FFH双面软盘，每次道8扇区FEH单面软盘，每磁道8扇区FDH双面软盘，每磁道9扇区FCCH单面软盘，每磁道9扇区FC8H硬盘
第1~2字节 （表项号1）表示第一簇状态，因第一簇被系统占据，故此两字节为FFFFH
第3~4字节 （表项号2）表示第二簇状态，若为FFFH表此簇为坏的，DOS已标记为不能用；0000H表示此簇为空，可以用；FFF8H表不能示该簇为文件的最后一簇；其余数字表示文件的下一个簇号，注意高字节在后，低字节在前。
第5~6字节 （表项号3）表示第三簇状态，同上。
注意：
不要把表项内的数字误认为表示当前簇号，而应是该文件的下一个簇的簇号。.高字节在后，低字节在前是一种存储数字方式，读出时应对其进行调整。是如两字节12H，34H，应调整为3412H。
文件分配表与文件目录（FDT）相配合，可以统一管理整个磁盘的文件。它告诉系统磁盘上哪些簇是坏的或已被使用，哪些簇可以用，并存储每个文件所使用的簇号。它是文件的“总调度师”。
当DOS写文件时，首先在文件目录中检查是否有相同文件名，若无则使用一个文件目录表项，然后依次检测FAT中的每个表项对应的簇中，同时将该簇号写入文件目录表项相的26-27字节，如文件长度不止一簇，则继续向后寻找可用簇，找到后将其簇号写入上一次找到的表项中，如此直到文件结束，在最后一簇的表项里填上FFF8H，形成单向链表。
DOS删除文件时只是把文件目录表中的该文件的表项第0个字节改为E5H，表此项已被删除，并在文件分配表中把该文件占用的各簇的表项清0，并释放空间。其文件的内容仍然在盘上，并没有被真正删除，这就是undelete.exe,unerase.exe等一类恢复删除工具能起作用的原因。
文件分配表在系统中的地位十分重要，用户最好不要去修改它，以免误操作带来严重的后果。
FAT表的定位
硬盘分区的主要结构说明：
(Cylinder柱面/磁道-Side磁头-Sector扇区地址以下简称为?-?-?)
《主分区》
名称 地址 长度(扇区)
主引导记录（Main Boot Record) 0-0-1 1
系统扇区（System Secotrs） 0-0-2,0-0-63 62
引导扇区（Boot） 0-1-1 1
FAT16系统中，此扇区包含BPB（BIOS Parameter Block）表，描述逻辑盘结构组成，包含隐藏扇区数目（从0-1-1开始计算）、FAT扇区数、FAT拷贝数、硬盘磁头总数、根目录表项最大值等。
FAT32系统中，BPB表的偏移与FAT16不同，但表项基本相同。整个隐藏扇区部分都作为逻辑盘的描述区域。
隐藏扇区（Hidden Secotrs）:
FAT16 0-1-1 1
FAT32 0-1-1 32
文件分配表(File Allocation Table):
FAT16 0-1-2 根据逻辑盘容量变化
FAT32 0-1-33 根据逻辑盘容量变化
说明：
FAT16的每个表项由2字节（16位）组成，通常每个表项指向的簇包含64个扇区，即32K字节。
逻辑盘容量最大为2047MB。
FAT32的每个表项由4字节（32位）组成，通常每个表项指向的簇包含8个扇区，即4K字节。
逻辑盘容量最小为512MB。
对于C分区，在MBR的偏移01c2H处，FAT16为06H，FAT32为0CH。
有关计算公式为：
每个扇区长度=512字节
总簇数=逻辑盘容量/簇容量
总簇数=FAT表长度（字节）/每个表项长度（字节）-2
FAT表长度=逻辑盘容量/簇容量*每个表项长度
FAT表的开始由介质描述符+一串“已占用”标志组成：
FAT16硬盘----F8 FF FF 7F
FAT32硬盘----F8 FF FF 0F FF FF FF 0F
每个有效的FAT结构区包含两个完全相同的拷贝：FAT1、FAT2
文件目录表（File Directory Table），即根目录区，又称为ROOT区:
紧跟在FAT2的下一个扇区，长度为32个扇区（256个表项）。如果支持长文件名，则每个表项
为64个字节，其中，前32个字节为长文件链接说明；后32个字节为文件属性说明，包括文件长
度、起始地址、日期、时间等。如不支持长文件名，则每个表项为32个字节的属性说明。
数据区（Data Area）:
紧跟在FDT的下一个扇区，直到逻辑盘的结束地址。
《扩展分区》
名称 地址 长度(扇区)
扩展分区（Extend Partition） ?-y-1 1
系统扇区（System Secotrs） ?-y-2,?-y-63 62
引导扇区（Boot） ?-(y+1)-1 1
其后各项与主分区相同……
FAT表引起的读写故障
硬盘文件分配表庞大无法手工修复，只能依靠工具。
FAT表记录着硬盘数据的存储地址，每一个文件都有一组FAT链指定其存放的簇地址。FAT表的损坏意味着文件内容的丢失。庆幸的是DOS系统本身提供了两个FAT表，如果目前使用的FAT表损坏，可用第二个进行覆盖修复。但由于不同规格的磁盘其FAT表的长度及第二个FAT表的地址也是不固定的，所以修复时必须正确查找其正确位置，一些工具软件如NU等本身具有这样的修复功能，使用也非常的方便。采用DEBUG也可实现这种操作，即采用其m命令把第二个FAT表移到第一个表处即可(不建议这样做)。如果第二个FAT表也损坏了，则也无法把硬盘恢复到原来的状态，但文件的数据仍然存放在硬盘的数据区中，可采用CHKDSK或SCANDISK命令进行修复，最终得到*.CHK文件，这便是丢失FAT链的扇区数据。如果是文本文件则可从中提取出完整的或部分的文件内容。
软盘文件分配FAT表修复
在运行某个程序时，有时会在屏幕上看到：File allocation table bad,drive A（文件分配表坏）的错误信息，导致程序不能正常运行。
我们知道，在磁盘中有两个文件分配表：FAT1和FAT2。FAT1用于日常工作，FAT2备用。因此，在FAT1损坏时，可用FAT2表修补。
具体方法是：运行DEBUG，将FAT2读入缓冲区，用缓冲区的FAT2数据覆盖磁盘中的FAT1。
例：修复3寸1.44M软盘，在A驱
在DOS环境下进入debug环境
在“-”提示符下进行如下操作：
-L 100 0 0A 9
-W 100 0 1 9
-q
其它类型的软盘的修复方法参照下表进行。
起止逻辑扇区 5.25"低密 5.25"高密 3.5"低密 3.5"高密
BOOT区 0 0 0 0
FAT1 1-2 1-7 1-3 1-9
FAT2 3-4 8-0EH 4-6 0A-12H
例如我们要修复5.25"高密软盘的FAT,则需将上述参数改为:
-L 100 0 8 7
-W 100 0 1 7
-q