VMware 可以在软件上图形化窗口直接操作 “压缩磁盘以回收未使用的空间”（方法：编辑虚拟机设置 -> 选取 “硬盘” -> 点击右侧 “压缩” 即可）。
VirtualBox 6（目前的最新版本）不支持软件窗口操作缩小虚拟机磁盘空间或者压缩虚拟机磁盘空间（不因虚拟机中删除文件释放空间），但提供 VBoxManage 命令进行清理。
一、Windows 环境
1、在虚拟机中，从微软官网下载SDelete （https://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb897443），下载完成后解压，然后 cmd 进入到刚刚存放的目录下（如 直接放在c盘根目录下），打开 cmd 执行：
-- 把整个 c 盘下的未使用的磁盘空间标记为 0，执行完后把虚拟机关机
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C:sdelete -z c:
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举例：
2、然后进入宿主机 VBoxManage.exe 目录（通常为 VirtualBox 安装目录），然后执行 BoxManage 命令压缩 VDI 虚拟机磁盘文件即可。
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D:
cd D:Program FilesOracleVirtualBox
VBoxManage modifyhd F:VMswindows_xp_professional_sp3_x86.vdi –compact
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举例：（我是桌面环境是Ubuntu18.04下安装的Virtualbox命令执行过程与Windows略有不同“Win7 ASP Config -disk001.vdi”是呀回收空间的磁盘）
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pipci@HP:~/vsd/Virtualbox/Win7 ASP work$ vboxmanage modifyhd Win7 ASP Config -disk001.vdi -compact
0%...10%...20%...30%...40%...50%...60%...70%...80%...90%...100%
pipci@HP:~/vsd/Virtualbox/Win7 ASP work$
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二、Linux环境
1、在虚拟机中，打开终端执行：
-- 依次执行，执行完后把虚拟机关机
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sudo dd if=/dev/zero of=/empty
sudo rm -f /empty
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2、然后进入宿主机 VBoxManage.exe 目录（通常为 VirtualBox 安装目录），然后执行 BoxManage 命令压缩 VDI 虚拟机磁盘文件即可。
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VBoxManage.exe modifyhd "E:VMs hel_erver_6.8_x64.vdi" --compact
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参考：https://blog.csdn.net/JohnnySun2015/article/details/105181139