系统的结构逻辑（structurity）包括3公理（恒在、存在、演在公理）、6原则（泛稳定、泛互作、泛结构、泛相对、泛组织、泛惯性原则）、5原理（相容性、适存性、波动性、交汇性、协变原理）和3定律（整合律-integrative：组元协同整合为系统、系统结构协调组元；调适律-adaptation：组元、系统互作而形态结构适应改变、趋向系统稳态；组构律-construct：组元组合而层级分化、组元分化而结合成系统整体）。系统生物学又称整合（integrative）生物学，合成生物学又称建构（constructive）生物学，从而建立系统生物学、系统遗传学与合成生物学的理论基础。