• MongoDB优化之三:如何排查MongoDB CPU利用率高的问题


    遇到这个问题,99.9999% 的可能性是「用户使用上不合理导致」,本文主要介绍从应用的角度如何排查 MongoDB CPU 利用率高的问题。

    Step1: 分析数据库正在执行的请求

    用户可以通过 Mongo Shell 连接,并执行 db.currentOp() 命令,能看到数据库当前正在执行的操作,如下是该命令的一个输出示例,标识一个正在执行的操作。db.currentOp()的操作需要用MongoDB的root账户登录才能正常分析。

    重点关注几个字段:

    • client:请求是由哪个客户端发起的?
    • opid:操作的opid,有需要的话,可以通过 db.killOp(opid) 直接干掉的操作
    • secs_running/microsecs_running: 这个值重点关注,代表请求运行的时间,如果这个值特别大,就得注意了,看看请求是否合理
    • query/ns: 这个能看出是对哪个集合正在执行什么操作
    • lock*:还有一些跟锁相关的参数,需要了解可以看官网文档,本文不做详细介绍

    这里先要明确一下,通过 db.currentOp() 查看正在执行的操作,目的到底是什么?

    并不是说我们要将正在执行的操作都列出来,然后通过 killOp 逐个干掉;这一步的目的是要看一下,是否有「意料之外」的耗时请求正在执行。

    比如你的业务平时 CPU 利用率不高,运维管理人员连到数据库执行了一些需要全表扫描的操作,然后突然 CPU 利用率飙高,导致你的业务响应很慢,那么就要重点关注下那些执行时间很长的操作。

    一旦找到罪魁祸首,拿到对应请求的 opid,执行 db.killOp(opid) 将对应的请求干掉。

    如果你的应用一上线,cpu利用率就很高,而且一直持续,通过 db.currentOp 的结果也没发现什么异常请求,可以进入到 Step2 进行更深入的分析。

    Step2:分析数据库慢请求

    MongoDB 支持 profiling 功能,将请求的执行情况记录到同DB下的 system.profile 集合里

    profiling 有3种模式

    profiling 设置文档在这里,多看官网文档

    • 关闭 profiling
    • 针对所有请求开启 profiling,将所有请求的执行都记录到 system.profile 集合
    • 针对慢请求 profiling,将超过一定阈值的请求,记录到system.profile 集合

    默认请求下,MongoDB 的 profiling 功能是关闭,生产环境建议开启,慢请求阈值可根据需要定制,如不确定,直接使用默认值100ms。

    1. operationProfiling:
    2. mode: slowOp
    3. slowOpThresholdMs: 100

    基于上述配置,MongoDB 会将超过 100ms 的请求记录到对应DB 的 system.profile 集合里,system.profile 默认是一个最多占用 1MB 空间的 capped collection。

    1. 查看最近3条 慢请求,{$natrual: -1} 代表按插入数序逆序
    2. db.system.profile.find().sort({$natrual: -1}).limit(3)

    在开启了慢请求 profiling 的情况下(MongoDB 云数据库是默认开启慢请求 profiling的),我们对慢请求的内容进行分析,来找出可优化的点,常见的包括。

    profiling的结果输出含义在这里,多看官网文档

    CPU杀手1:全表扫描

    全集合(表)扫描 COLLSCAN,当一个查询(或更新、删除)请求需要全表扫描时,是非常耗CPU资源的,所以当你在 system.profile 集合 或者 日志文件发现 COLLSCAN 关键字时,就得注意了,很可能就是这些查询吃掉了你的 CPU 资源;确认一下,如果这种请求比较频繁,最好是针对查询的字段建立索引来优化。

    一个查询扫描了多少文档,可查看 system.profile 里的 docsExamined 的值,该值越大,请求CPU开销越大。

    关键字:COLLSCAN、 docsExamined

    CPU杀手2:不合理的索引

    有的时候,请求即使查询走了索引,执行也很慢,通常是因为索引建立不太合理(或者是匹配的结果本身就很多,这样即使走索引,请求开销也不会优化很多)。

    如下所示,假设某个集合的数据,x字段的取值很少(假设只有1、2),而y字段的取值很丰富。

    1. { x: 1, y: 1 }
    2. { x: 1, y: 2 }
    3. { x: 1, y: 3 }
    4. ......
    5. { x: 1, y: 100000}
    6. { x: 2, y: 1 }
    7. { x: 2, y: 2 }
    8. { x: 2, y: 3 }
    9. ......
    10. { x: 1, y: 100000}

    要服务 {x: 1: y: 2} 这样的查询

    1. db.createIndex( {x: 1} ) 效果不好,因为x相同取值太多
    2. db.createIndex( {x: 1, y: 1} ) 效果不好,因为x相同取值太多
    3. db.createIndex( {y: 1 } ) 效果好,因为y相同取值很少
    4. db.createIndex( {y: 1, x: 1 } ) 效果好,因为y相同取值少

    至于{y: 1} 与 {y: 1, x: 1} 的区别,可参考MongoDB索引原理 及 复合索引官方文档 自行理解。

    一个走索引的查询,扫描了多少条索引,可查看 system.profile 里的 keysExamined 字段,该值越大,CPU 开销越大。

    关键字:IXSCAN、keysExamined

    CPU杀手3:大量数据排序

    当查询请求里包含排序的时候,如果排序无法通过索引满足,MongoDB 会在内存李结果进行排序,而排序这个动作本身是非常耗 CPU 资源的,优化的方法仍然是建立索引,对经常需要排序的字段,建立索引。

    当你在 system.profile 集合 或者 日志文件发现 SORT 关键字时,就可以考虑通过索引来优化排序。当请求包含排序阶段时, system.profile 里的 hasSortStage 字段会为 true。

    关键字:SORT、hasSortStage

    其他还有诸如建索引,aggregationv等操作也可能非常耗 CPU 资源,但本质上也是上述几种场景;建索引需要全表扫描,而vaggeregation 也是遍历、查询、更新、排序等动作的组合。

    Step3: 服务能力评估

    经过上述2步,你发现整个数据库的查询非常合理,所有的请求都是高效的走了索引,基本没有优化的空间了,那么很可能是你机器的服务能力已经达到上限了,应该升级配置了(或者通过 sharding 扩展)。

    当然最好的情况时,提前对 MongoDB 进行测试,了解在你的场景下,对应的服务能力上限,以便及时扩容、升级,而不是到 CPU 资源用满,业务已经完全撑不住的时候才去做评估。

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