1.WebService可以说是跨平台的，因为它采用的是XML技术，说穿了就是把你的请求按照该WebServece的标准将参数传过去，然后服务器返回结果，当然了最重要的是参数的传递和结果的返回都是采用XML格式，但需要按照规范的，现在有SOAP和ebXML，说到XML自然有DTD或是Schema了，它用WSDL和UDDI来管理这些规范。EJB也可以说成是远程调用，但采用的协议是RIM/IIOP，客户端将方法请求按照协议封装，然后发送到服务器，服务器把结果返回给客户端。由于采用了协议，所以传输的数据我们可以看成二进制数据和WebService（传输xml文本数据）不一样。 WebService提供一个跨平台的异构方法调用，一般用来实现某种商务逻辑过程。EJB提供一个更精确的方法调用，一般又多个EJB来实现一定的商务逻辑。 一般你可以用WebService来提供用户调用，具体怎么实现用EJB来做。
2.EJB的分布式：一个业务逻辑可能会调用分布在多台服务器上的 EJB 组件，但是这么多的组件调用必须纳入一个事务范围之中。也就是说如果需要调用三个 EJB 组件，第一个调用成功，第二个调用成功，但第三个调用失败了，因此在第一和第二次调用成功时进行的事务操作（这里的事务操作不单单指数据库的，还有可能包括消息队列服务的事务）都必须进行回滚。但是，如果是调用三个 WebService 的话，那调用成功的那两个基本上是不可能进行回滚的，调用完了就是完了。
WebService 只是对外提供的调用接口，而 EJB 是个业务组件。一个对外的 WebService 在服务端中也是需要实现业务逻辑的，在 J2EE 中，这些业务逻辑基本上都是由 EJB 组件来实现，对外发布 WebService 接口（当然了，使用符合 JAX-WS 规范的开源框架不用 EJB 也能做到）
相对于 EJB 这种服务端来说，Servlet 只能算是一个 Web 层面调用的客户端。一个 EJB 组件不仅仅是只能用于 B/S 结构的应用，也能用于 C/S 结构的应用。这也能澄清很多人的误区，认为 Java Web 就是 J2EE 了，其实 J2EE 是一系列的规范集，而 Java Web 只是 J2EE 诸多规范中的一小部分。J2EE 中其他大部分规范定义的都是服务端的东西，作为具体的客户端调用，可以是 B/S 的，也可以是 C/S 的。
3.Webservice主要关注于解决异构系统、不同语言系统通信，其关注的是分布式服务开发、着手点要高、站的角度高，而ejb可以看做是分布式编程平台，通过容器和组件，简化了程序开发、调试和部署等它关注的是分布式组件开发，粒度小。
Web service可以看做是异构系统、异构语言系统间通信的一个标准，而ejb只属于J2EE规范的一部分。
ejb是Java EE 中的一个规范，该规范描述了分布式应用程序需要解决的问题，例如事务处理、安全、日志、分布式等，而同时呢，sun公司也实现了自己定义的这一个标准，相当于自己颁布一个标准然后，又给出了实现供别人使用，实现以很多API的方式提供给用的人。
ejb是按照java服务器接口定义的java类，可以理解为一个特殊的java类，放在容器里容器可以帮助该类管理事务、分布式、安全等，一般小的程序不会用到，只有大型分布式系统才会用到ejb，既然ejb是一个java类或是一个组件，颗粒较小，这也是与Webservice的区别之一，下面会说到，它就可以被其它一个或多个模块调用。
包含了三种类型的Bean，可以通过注释JPA一个规范来标记,其中有一种Bean，叫MDB消息驱动bean，它的通信机制涉及到了JMS协议。
ejb可以进行远程调用，但是不能够跨语言，ejb是同步调用，而平时我们说的的ejb异步调用指的是ejb的MDB异步通信